ARNm-seq (NGS) con xenoma de referencia
O ARN-seq é unha ferramenta estándar en toda a vida e as ciencias das colleitas, cubrindo a fenda entre xenomas e proteomas. A súa forza reside en descubrir novas transcricións e cuantificar a súa expresión nun ensaio. Úsase amplamente para estudos transcriptómicos comparativos, arroxando luz en xenes relacionados con varios trazos ou fenotipos, como comparar mutantes con tipos salvaxes ou revelar a expresión xénica en condicións específicas. A aplicación BMKCloud ARNm (referencia) integra a cuantificación da expresión, a análise de expresión diferencial (DEG) e as análises de estrutura de secuencia no pipeline bioinformático ARNm-Seq (NGS) e amalgama os puntos fortes de software similar, garantindo a conveniencia e a amizade. Os usuarios poden cargar os seus datos RNA-Seq na nube, onde a aplicación ofrece unha solución de análise bioinformática completa e única. Ademais, prioriza a experiencia do cliente, ofrecendo operacións personalizadas adaptadas ás necesidades específicas dos usuarios. Os usuarios poden establecer parámetros e enviar a misión de pipeline por si mesmos, comprobar o informe interactivo, ver datos/diagramas e completar a minería de datos, como: selección de xenes de destino, agrupación funcional, esquemating, etc.
Plataforma:Illumina, MGI
Estratexia:ARN-seq
Disposición: Détidos limpos, limpos.
Tipo de biblioteca:FR-Unstranded, FR-Firststrand ou FR-Secondstrand
Ler lonxitude:150 pb
Tipo de ficheiro:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz ou *.fq.gz. O sistema faráEmpareja automaticamente os ficheiros .fastq segundo os seus nomes de ficheiros,por exemplo *_1.fastq emparellado con *._ 2.fastq.
Número de mostras:Non hai restricións ao númerode mostras, pero o tempo de análise aumentará a medida que o número demedra mostras.
Importe de datos recomendado:6g por mostra