Secuenciación de transcriptoma de lonxitude completa baseada en nanoporos
A secuenciación de nanoporos distínguese doutras plataformas de secuenciación, xa que os nucleótidos son lidos directamente sen a síntese de ADN e xera lecturas longas a decenas de quilobases. Isto permite a lectura directa de transcricións completas e abordar os retos dos estudos transcriptómicos.
√ Baixo sesgo específico da secuencia
√ Lectura completa de ADNc para estudos de estrutura xenética
√ Menos datos necesarios para cubrir o mesmo número de transcricións
√ Identificación de múltiples isoformas por xene
√ Cuantificación de expresións a nivel de isoformas
Canalización de bioinformática típica
Últimos casos de éxito con Biomarker Technologies
1. As análises comparativas de transcriptomas de lonxitude completa revelan a dinámica de desenvolvemento do tronco de Gnetum luofuense
Revista: Fronteiras en xenética
Publicado: Marzo 2021
Palabras chave: MinION | Empalme alternativo | APA | lncRNA | Transcricións expresadas de forma diferenciada
Ler texto completo
2. Movemento unidireccional de pequenos ARN desde brotes ata raíces en heteroenxertos interespecíficos
Revista: Natureza Plantas
Publicado: Xaneiro 2021
Palabras chave: Nanopore | Ilumina | detección de ARNm móbil de lonxitude completa
3. A análise completa do transcriptoma das raíces dos espárragos revela o mecanismo molecular da tolerancia á sal inducida por fungos micorrícicos arbusculares.
Revista: Botánica Ambiental e Experimental
Publicado: Xaneiro 2021
Palabras chave: MinION | Transcricións expresadas de forma diferenciada | Factores de transcrición | Empalme alternativo
4. Cambios característicos fisiolóxicos e transcriptoma de lonxitude total de raíces e follas de rosa (Rosa chinensis) en resposta ao estrés por seca
Revista: Fisioloxía Vexetal e Celular
Publicado: outubro 2020
Palabras chave: PromethION | Transcricións expresadas de forma diferenciada | Predición funcional | Isoformas empalmadas | TF e lncRNA
5. Análise e comparación ampla de PacBio e secuenciación de ARN baseada en nanoporos do transcriptoma de Arabidopsis
Xornal: Método vexetal
Publicado: abril 2020
Palabras chave: GridION | PromethION | PacBio Sequel | Illumina NovaSeq | Aliñación do xenoma | Identificación da transcrición | Empalme alternativo | SSR | LncRNA | Cuantificación isoforma
Novidades e Destacados ten como obxectivo compartir os últimos casos exitosos con Biomarker Technologies, capturando novos logros científicos, así como técnicas destacadas aplicadas durante o estudo.
Hora de publicación: Xaneiro-08-2022