Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Noticias

Xenoma

Nature_communications_logo

Asemblea a escala de cromosomas e análise do xenoma do cultivo de biomasa Miscanthus Lutarioriparius

Secuenciación de nanoporos | Illumina | HI-C | Secuenciación de ARN | Filoxenia

Neste estudo, Biomarker Technologies proporcionou soporte técnico sobre secuenciación de nanoporos, montaxe de xenoma de novo, montaxe asistida por HI-C, etc.

Abstracto

Miscanthus, unha planta perenne rizomatosa, ten un gran potencial para a produción de bioenerxía pola súa alta biomasa e tolerancia ao estrés. Informamos dunha montaxe a escala cromosómica deMiscanthus LutarioripariusXenoma combinando a secuenciación de nanoporos de Oxford e as tecnoloxías Hi-C. A montaxe de 2.07-GB abarca o 96,64% do xenoma, con contig N50 de 1,71 MB. As secuencias de centrómero e telómero están montadas para os 19 cromosomas e o cromosoma 10, respectivamente. A orixe alotetraploide do M. lutarioriparius confíase mediante repeticións de satélite centromérico. Demostran claramente a estrutura do xenoma tetraploide e varios arranxos cromosómicos en relación ao sorgo. Tándem duplican xenes deM. Lutarioripariusson enriquecidos funcionais non só en termos relacionados coa resposta ao estrés, senón na biosíntese da parede celular. As familias de xenes relacionadas coa resistencia á enfermidade, a biosíntese da parede celular e o transporte de ións metálicos son moi ampliados e evolucionados. A expansión destas familias pode ser unha base xenómica importante para a mellora de trazos notables deM. Lutarioriparius.

Estatísticas clave da montaxe do xenoma

Noticias-1
Noticias-2

Figura. Visión xeral da montaxe do xenoma de M. Lutarioriparius

Noticias e aspectos destacados ten como obxectivo compartir os últimos casos exitosos con Tecnoloxías de Biomarcadores, captando novos logros científicos así como técnicas destacadas aplicadas durante o estudo.


Tempo de publicación: xaneiro-05-2022

Envíanos a túa mensaxe: