O transcriptoma é o vínculo entre a información xenética xenómica e o proteoma da función biolóxica. A regulación de nivel transcripcional é o máis importante e o modo de regulación máis estudado dos organismos. A secuenciación do transcriptoma pode secuenciar o transcriptoma en calquera momento do tempo ou baixo calquera condición, cunha resolución precisa a un único nucleótido. Transcricións específicas de mostra.
Na actualidade, a tecnoloxía de secuenciación de transcriptoma foi moi utilizada en agronomía, medicina e outros campos de investigación, incluída a regulación de desenvolvemento de animais e plantas, adaptación ambiental, interacción inmune, localización de xenes, evolución xenética de especies e detección de enfermidades xenéticas.
