
mRNA-seq (NGS) - De novo
A secuenciación do ARNm permite perfilar todos os transcritos de ARNm nas células en condicións específicas e é unha tecnoloxía moi utilizada en varias áreas de investigación. A canalización de secuencias de ARNm de novo de BMKCloud está deseñada para analizar bibliotecas de secuenciación enriquecidas con poli-A cando non hai xenoma de referencia dispoñible. O gasoduto comeza co control de calidade, seguido dede novomontaxe de transcrición e selección de conxuntos unigene. A análise da estrutura uníxena predice a secuencia codificante (CDS) e as repeticións de secuencia simple (SSR). Posteriormente, a análise da expresión diferencial atopa xenes expresados de forma diferencial (DEG) entre as condicións probadas, seguido da anotación funcional e o enriquecemento dos DEG para extraer coñecementos biolóxicos.
Bioinformática
