O estudo de asociación de todo o xenoma (GWAS) ten como obxectivo identificar variantes xenéticas (xenotipo) que se asocian con trazos específicos (fenotipo). Os estudos de GWA investigan os marcadores xenéticos que cruzan o xenoma completo dun gran número de individuos e predín asociacións xenotipo-fenotipo mediante análises estatísticas a nivel poboacional. A resecuenciación do xenoma completo pode descubrir todas as variantes xenéticas. Xunto cos datos fenotípicos, o GWAS pódese procesar para identificar SNP, QTL e xenes candidatos relacionados con fenotipos, o que apoia con forza a creación moderna de animais/plantas. SLAF é unha estratexia de secuenciación do xenoma simplificada desenvolvida por si mesmo, que descobre marcadores distribuídos en todo o xenoma, SNP. Estes SNP, como marcadores xenéticos moleculares, pódense procesar para estudos de asociación con trazos dirixidos. É unha estratexia rendible para identificar trazos complexos asociados ás variacións xenéticas.
