Bibliotecas pre-feitas Illumina
Características
●Plataformas:Illumina Novaseq 6000 e Novaseq X Plus
●Modos de secuenciación:PE150 e PE250
●Control de calidade das bibliotecas antes da secuenciación
●Datos de secuenciación QC e entrega:Entrega de informes QC e datos brutos en formato FastQ despois de demultiplexación e filtrado de lecturas Q30
Vantaxes do servizo
●Versatilidade dos servizos de secuenciación:O cliente pode optar por secuenciar por carril, cela de fluxo ou por cantidade de datos necesarios (secuenciación parcial de carrís).
●Amplia experiencia na plataforma de secuenciación de Illumina:con miles de proxectos pechados con varias especies.
●Entrega do informe de secuenciación QC:con métricas de calidade, precisión de datos e rendemento global do proxecto de secuenciación.
●Proceso de secuenciación madura:cun curto tempo de xiro.
●Control de calidade rigoroso: Implementamos requisitos estrictos de QC para garantir a entrega de resultados de alta calidade constantemente.
Plataformas de mostra
| Plataforma | Célula de fluxo | Modo de secuenciación | Unidade | Saída estimada |
| Novaseq x | 10b (8 carrís) | PE150 | Carril único Carril parcial | 375 GB / Carril |
| 25b (8 carrís) | PE150 | Carril único Carril parcial | 1000 GB/carril | |
| Novaseq 6000 | Cela de fluxo SP (2 carrís) | PE250 | Célula de fluxo Carril único Carril parcial | 325-400 m Reads / Lane |
| Cela de fluxo S4 (4 carrís) | PE150 | Célula de fluxo Carril único Carril parcial | ~ 800 GB / Carril |
Requisitos da mostra
| Importe de datos (x) | Concentración (qPCR/nm) | Volume | |
| Secuenciación parcial de carril
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 µl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 µl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 µl | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 µl | |
| Secuenciación de carril | Por carril | ≥ 1,5 nm / piscina de biblioteca | ≥ 25 µl / piscina de biblioteca |
Ademais da concentración e a cantidade total, tamén é necesario un patrón de pico adecuado.
Nota: A secuenciación de carrís de bibliotecas de baixa diversidade require Phix Spike-in para garantir unha chamada base robusta.
Recomendamos enviar bibliotecas pre-poidadas como mostras. Se esixe que BMKGene realice a agrupación de bibliotecas, consulte
Os requisitos da biblioteca para a secuenciación de carrís parciais.
Tamaño da biblioteca (mapa de pico)
O pico principal debe estar dentro de 300-450 pb.
As bibliotecas deberían ter un único pico principal, sen contaminación do adaptador e sen dímeros de cebador.
Ponte en contacto con nós se as túas mostras non cumpren os requisitos de material de partida.
Fluxo de traballo de servizo
Control de calidade da biblioteca
Secuenciación
Control de calidade de datos
Entrega do proxecto
Informe QC da biblioteca
Ofrécese un informe sobre a calidade da biblioteca antes de secuenciar, avaliar o importe da biblioteca e a fragmentación.
Informe QC de secuenciación
Táboa 1. Estatísticas sobre datos de secuenciación.
| ID de mostra | Bmkid | Lectura crúa | Datos en bruto (BP) | Lecturas limpas (%) | P20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figura 1. Distribución de calidade ao longo de lecturas en cada mostra
Figura 2. Distribución de contido base
Figura 3. Distribución dos contidos de lectura na secuenciación de datos
