ACRNA Secuenciación-ilumina
Características
● Esgotación de ARNm seguido da preparación da biblioteca direccional, permitindo os datos de secuenciación específica da cadea.
● O fluxo de traballo bioinformático permite a predición e a cuantificación da expresión do ARCRNA
Vantaxes do servizo
●Bibliotecas de ARN máis completas:Usamos o esgotamento do ARNm no canto do esgotamento do ARN lineal na nosa preparación previa á biblioteca, asegurando que os datos de secuenciación inclúen non só o CIRCRNA senón tamén o ARNm e o LNCRNA, permitindo a análise conxunta destes conxuntos de datos
●Análise opcional de redes de ARN endóxenas competitivas (CERNA): Proporcionando información máis profunda sobre os mecanismos reguladores celulares
●Ampla experiencia: Cun historial de procesamento de máis de 20.000 mostras en BMKGene, abarcando diversos tipos de mostras e proxectos de LNCRNA, o noso equipo achega unha ampla experiencia a todos os proxectos.
●Control de calidade rigoroso: Implementamos puntos de control básicos en todas as etapas, desde a preparación da mostra e da biblioteca ata a secuenciación e a bioinformática. Este minucioso control asegura a entrega de resultados de alta calidade constantemente.
● Soporte post-venda: O noso compromiso esténdese máis alá da finalización do proxecto cun período de servizo posterior a 3 meses. Durante este tempo, ofrecemos un seguimento do proxecto, asistencia de solución de problemas e sesións de Q&A para abordar as consultas relacionadas cos resultados.
Requisitos de mostra e entrega
| Biblioteca | Plataforma | Datos recomendados | Datos QC |
| A Biblioteca direccional esgotada con ARNm | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30≥85% |
Requisitos da mostra:
Nucleótidos:
| Conc. (Ng/µl) | Cantidade (μg) | Pureza | Integridade |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Contaminación limitada ou sen proteínas ou ADN mostrada no xel. | Rin≥6,0; 5.0≥28s/18s≥1,0; elevación de base limitada ou sen base |
● Plantas:
Raíz, talo ou pétalo: 450 mg
Folla ou semente: 300 mg
Froito: 1,2 g
● Animal:
Corazón ou intestino: 450 mg
Vísceras ou cerebro: 240 mg
Músculo: 600 mg
Ósos, pelo ou pel: 1,5g
● Artrópodos:
Insectos: 9g
Crustacea: 450 mg
● sangue enteiro:2 tubos
● Células: 106 células
● Sérico e plasma: 6 ml
Entrega de mostra recomendada
Recipiente: tubo de centrifuga de 2 ml (non se recomenda a folla de lata)
Etiquetaxe de mostra: grupo+replicar por exemplo A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Envío:
1. Ice seco: as mostras deben ser embaladas en bolsas e enteradas en xeo seco.
2. Tubos RNastable: as mostras de ARN pódense secar no tubo de estabilización do ARN (por exemplo, RNastable®) e enviadas a temperatura ambiente.
Fluxo de traballo de servizo
Deseño de experimentos
Entrega de mostra
Extracción de ARN
Construción da biblioteca
Secuenciación
Análise de datos
Servizos despois da venda
Bioinformática
Predición de circras: distribución cromosómica
ARRNAs expresados diferencialmente - trama de volcáns
ARNRNAs expresados diferencialmente - agrupación xerárquica
Enriquecemento funcional dos xenes hóspede do circro
Explora os avances da investigación facilitados polos servizos de secuenciación de CIRCRNA de BMKGene a través dunha colección curada de publicacións.
Wang, X. et al. (2021) "CPSF4 regula a formación de CIRCRNA e o silenciamento de xenes mediado por microRNA en carcinoma hepatocelular", Oncogeno 2021 40:25, 40 (25), pp. 4338-435. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) 'x OO transcriptoma que responde a OO revela o papel do RNA133 circular na resistencia á enfermidade ao regular a expresión de Osarab no arroz', Investigación en fitopatoloxía, 5 (1), pp. 1-14. doi: 10.1186/s42483-023-00188-8/figuras/6.
Y, H. et al. (2023) "CPSF3 modula o equilibrio de transcricións circulares e lineais no carcinoma hepatocelular". doi: 10.21203/rs.3.rs-2418311/v1.
Zhang, Y. et al. (2023) 'Avaliación completa dos CIRCRNA en cardiomiopatía cirrótica antes e despois do transplante de fígado ", inmunofarmacoloxía internacional, 114, p. 109495. Doi: 10.1016/j.intimp.2022.109495.
