Seicheamh RNA beag-Illumina
Feartan
● Tha ullachadh leabharlainn a 'toirt a-steach ceum taghadh meud
● Mion-sgrùdadh bith-fhiosrachail stèidhichte air ro-innse miRNA agus na targaidean aca
Buannachdan seirbheis
●Mion-sgrùdadh bioinformatics coileanta:A’ comasachadh comharrachadh an dà chuid miRNAn aithnichte agus ùr-nodha, comharrachadh thargaidean miRNAs, agus comharrachadh gnìomh co-fhreagarrach agus beairteas le grunn stòran-dàta (KEGG, GO).
●Smachd càileachd teann: Bidh sinn a’ buileachadh prìomh phuingean-smachd thar gach ìre, bho ullachadh sampall is leabharlainn gu sreath agus bioinformatics. Tha an sgrùdadh mionaideach seo a’ dèanamh cinnteach gun tèid toraidhean àrd-inbhe a lìbhrigeadh gu cunbhalach.
●Taic Post-reic: Tha ar dealas a’ leudachadh nas fhaide na crìoch a’ phròiseict le ùine seirbheis 3-mìosan às deidh reic. Rè na h-ùine seo, bidh sinn a’ tabhann seiseanan leanmhainn pròiseict, cuideachadh fuasgladh cheistean, agus seiseanan Q&A gus dèiligeadh ri ceistean sam bith co-cheangailte ris na toraidhean.
●Eòlas farsaing: Le eachdraidh air a bhith a’ dùnadh gu soirbheachail thairis air grunn phròiseactan sRNA a’ còmhdach còrr air 300 gnè ann an diofar raointean rannsachaidh, tha an sgioba againn a’ toirt beairteas de eòlas do gach pròiseact.
Sampall riatanasan agus lìbhrigeadh
| Leabharlann | Àrd-ùrlar | Dàta air a mholadh | QC dàta |
| Meud air a thaghadh | Illumina SE50 | 10M-20M a’ leughadh | Q30≥85% |
Sampall Riatanasan:
Nucleotides:
| Conc.(ng/μl) | Suim (μg) | Purity | Ionracas |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Pròtain cuibhrichte no gun truailleadh DNA air a nochdadh air gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; àrdachadh bun-loidhne cuingealaichte no gun a bhith ann |
● Lusan:
Root, gas no peatal: 450 mg
Duilleag no sìol: 300 mg
Toradh: 1,2 g
● beathach:
Cridhe no intestinal: 450 mg
Viscera no Brain: 240 mg
Meud: 600 mg
Cnàmhan, falt no craiceann: 1.5g
● Artrapod:
biastagan: 9g
Crustacea: 450 mg
● Fuil slàn: 2 phìob
● ceallan: 106 ceallan
● Serum agus Plasma:6 ml
Lìbhrigeadh sampall air a mholadh
Container: tiùb centrifuge 2 ml (chan eilear a’ moladh foil staoin)
Bileag sampaill: Buidheann + ath-riochdachadh me A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Gluasad:
1. Dry-deigh: Feumaidh sampaill a bhith air am pacadh ann am pocannan agus air an tiodhlacadh ann an deigh tioram.
2. Tiùban RNAstable: Faodar sampallan RNA a thiormachadh ann an tiùb seasmhach RNA (me RNAstable®) agus a chuir a-steach aig teòthachd an t-seòmair.
Sruth Obrach Seirbheis
Dealbhadh deuchainn
Eisimpleir lìbhrigeadh
às-tharraing RNA
Togalach leabharlainn
Seicheamh
Mion-sgrùdadh dàta
Seirbheisean às deidh reic
Bith-fiosrachadh
● Raw dàta smachd càileachd
● seòrsachadh sRNA
● Co-thaobhadh ri genoma iomraidh
● Comharrachadh miRNA aithnichte agus ùr-nodha
● Mion-sgrùdadh abairt miRNA eadar-dhealaichte
● Nota gnìomh de thargaidean miRNA
Comharrachadh miRNA: structar agus doimhneachd
Cur an cèill eadar-dhealaichte de miRNA - cruinneachadh rangach
Mìneachadh gnìomh air targaid de miRNAn air an cur an cèill gu eadar-dhealaichte
Dèan sgrùdadh air na h-adhartasan rannsachaidh a tha air an cuideachadh le seirbheisean seicheamh sRNA BMKGene tro chruinneachadh de fhoillseachaidhean curanta.
Chen, H. et al. (2023) ‘Tha galairean bhìorasach a’ cur bacadh air biosynthesis saponin agus photosynthesis ann am Panax notoginseng’, Fis-eòlas Lusan agus Bith-cheimigeachd, 203, td. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'Tha an lus FYVE aig a bheil pròtain anns a bheil fearann AN-ASGAIDH1 a’ ceangal le co-phàirtean microprocessor gus miRNA biogenesis ath-bhualadh ', aithisgean EMBO, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) 'Tha am MicroRNA Ame-Bantam-3p a' cumail smachd air leasachadh cuilean larbha le bhith a 'cuimseachadh air na h-àrainnean fàs ioma-fhillte epidermal 8 Gene (megf8) anns an t-seillean-meala, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24(6), td . 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) ‘Mion-sgrùdadh Amalaichte de MiRNA agus Gineadan Co-cheangailte ri Càileachd Feòil a’ nochdadh gu bheil Gga-MiR-140-5p a’ toirt buaidh air tasgadh geir intramuscular ann an cearcan’, Eòlas-eòlas ceallach agus Bith-cheimigeachd, 46(6), td. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
