RIVENCING BISLITION SPREULSED SEQUITING (RRBS)
Tha sequectation Bisulfite, RRBS) air nochdadh mar roghainn cosg-èifeachdach agus neo-èifeachdach airson sreathan balgespite eadar-dhealaichte (WGBs) ann an rannsachadh DNA. Fhad 's a tha WGBn a' toirt seachad seallaidhean coileanta le bhith a 'sgrùdadh na cruinne gu lèir aig rùn singilte singilte, faodaidh a chosgais àrd a bhith na fhactar cuibhrichte. Rrbs a 'lasachadh an dùbhlan seo gu ro-innleachdail le bhith a' sgrùdadh cuibhreann riochdaire den fhìor. Tha am modh-obrach seo an urra ri beairteas de roinnean Boirg Eilean CPG agus an uairsin taghadh meud de chriomagan 200-500 / 600 BPS. Mar thoradh air an sin, cha bhith ach na h-Eileanan airidh air eileanan CPG, ged a tha an fheadhainn le eileanan CPG air a thoirmeasg bhon sgrùdadh. Tha am pròiseas seo, còmhla ri òrdugh balail, a 'ceadachadh faighinn a-mach gun tèid an dòigh àrd-rùn, agus an dòigh-obrach, a' cuimseachadh gu sònraichte air cinn nam cuirseasan seach a 'mheadhan-fhiosrachadh methylation. Tha na rrbs na inneal luachmhor a tha a 'comasachadh rannsachadh methytotion èifeachdach agus a' toirt sùil air eòlas air dòighean epigenetic.
Feartan seirbheis
● feumaidh iad teisteanas a thoirt do fhìor.
● Tha Lambd DNA air a chleachdadh gus sùil a chumail air èifeachdas tionndaidh Bisulfite.
● Thathar a 'cumail sùil air èifeachdas xi Reescetion.
● A 'cladhach dùbailte enzyme airson sampaillean planntrais.
● SgequeNrings air illumina novaseq.
Buannachdan Seirbheis
●Cosgais cosg-èifeachdach agus neo-èifeachdach air WGBS: a 'comasachadh an an anailis an anailis a rinn e aig cosgais nas ìsle agus le riatanasan sampaill nas ìsle.
●Àrd-ùrlar iomlan:Thoir seachad seirbheis sàr-mhath bho ghiullachd sampaill, togail dhealbhan, agus senemcing gu mion-sgrùdadh bioteformatics.
●Eòlas farsaing: Le taic bho rrbs a chaidh a chrìochnachadh gu soirbheachail thar raon eadar-mheasgte de ghnèithean, tha BMKgene a 'toirt a-steach deichead mion-sgileil, susbaint farsaing, taic sàr-reic sàr-reic.
Sònrachaidhean Seirbheis
| Leabharlann | Ro-innleachd SequeNroming | Toradh dàta a thathar a 'moladh | Smachd Càileachd |
| Bha leabharlann air an làimhseachadh le BPA BPA | Illumina PE150 | 8 GB | Q30 ≥ 85% Tionndadh baistlite> 99% Èisteachd a 'gearradh> 95% |
Riatanasan sampaill
| Dùmhlachd (ng / μl) | Suim iomlan (μg) |
| |
| DNA Genomic DNA | ≥ 30 | ≥ 1 | Àireamhan cuibhrichte no truailleadh |
Sruth obair seirbheis
Lìbhrigeadh sampaill
Togail leabharlainn
SequeNrings
Mion-sgrùdadh dàta
Seirbheisean às deidh a reic
A 'toirt a-steach an sgrùdadh a leanas:
● Raw smachd càileachd a 'cumail smachd;
● Mapadh gus iomradh a thoirt air fìor;
● lorg 5mc de ionadan methylated agus comharrachadh motioc;
• Mion-sgrùdadh air sgaoileadh scobal no sampall osnage;
• Mion-sgrùdadh air roinnean methylated (DMRS);
● Dealbh gnìomh de ghinean co-cheangailte ri DMRS.
Smachd Càileachd: èifeachdas cladhach (ann am mapadh genome)
Smachd Càileachd: Tionndadh Bisulfite (ann an sealladh fiosrachaidh methylation)
Mapa methylation: 5mc sgrùdadh-inntinn methylation
Coimeas sampaill: Mion-sgrùdadh Prionnsa Amel
Sgrùdadh air roinnean methylated (DMRS): teasachadh teas
Rannsaich na h-adhartachadh rannsachaidh a tha air an comasachadh gun spionnadh iomlan tro chruinneachadh foillseachaidhean le BMKgene.
Li, z. et al. (2022) 'àrd-dhruim-dìcheallach a-steach do cheallan coltach ri Leydig le Co-obrachadh Crispr agus Factaran Pàdrainn',Pnas Nexus, 1 (4). doi: 10.1093 / pnasnexus / pgac179.
Tian, H. et al. (2023) sgrùdadh methylation deireannach DNA air feadh a 'chuirp ann an sgrìobhadh bodhaig ann an càraid Monoygotic Sìneach',Iris an-diugh de sgrùdadh clionaigeach Eòrpach, 53 (11), td. E14055. doi: 10.1111 / EiC.14055.
WU, Y. et al. (2022) 'DNA methylation agus co-mheas Waist-To-Hip: Sgrùdadh Comann Crìochnaichte ann an càraid Monoygotic Sìneach',Iris Sgrùdadh Endocrinolais, 45 (12), pp. 2365-2376. doi: 10.1007 / s40618-022-01878-4.
