-
BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
Tha transcriptomics spàsail aig fìor thoiseach ùr-ghnàthachadh saidheansail, a’ toirt cumhachd do luchd-rannsachaidh sgrùdadh a dhèanamh air pàtrain faireachdainn gine toinnte taobh a-staigh figheagan fhad ‘s a tha iad a’ gleidheadh an co-theacsa spàsail aca. Am measg diofar àrd-ùrlaran, tha BMKGene air an BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip a leasachadh, a ’bòstadh rùn leasaichte de 3.5µm, a’ ruighinn an raon subcellular, agus a ’comasachadh suidheachaidhean fuasglaidh ioma-ìre. Bidh a’ chip S3000, anns a bheil timcheall air 4 millean spot, a’ cleachdadh microwells air an còmhdachadh le grìogagan air an luchdachadh le probes glacaidh còd-barra spàsail. Tha leabharlann cDNA, air a bheairteachadh le còdan-bàr spàsail, air ullachadh bhon chip S3000 agus air a leantainn air àrd-ùrlar Illumina NovaSeq. Bidh an cothlamadh de shamhlaichean le còd-barra spàsail agus UMIan a’ dèanamh cinnteach gu bheil an dàta a chaidh a chruthachadh ceart agus sònraichte. Tha na sgoltagan BMKManu S3000 air leth sùbailte, a’ tabhann suidheachaidhean fuasglaidh ioma-ìre a ghabhas gleusadh gu grinn ri diofar fhigheagan agus na h-ìrean mion-fhiosrachaidh a tha thu ag iarraidh. Tha an sùbailteachd seo a’ suidheachadh a’ chip mar roghainn air leth airson diofar sgrùdaidhean tar-sgrìobhaidh farsaingeachd, a’ dèanamh cinnteach gu bheil cruinneachadh spàsail mionaideach le glè bheag de dh’ fhuaim. Tha cleachdadh teicneòlas sgaradh cealla le BMKManu S3000 a’ comasachadh dàta tar-sgrìobhaidh a chuingealachadh gu crìochan cheallan, a’ leantainn gu mion-sgrùdadh aig a bheil brìgh bith-eòlasach dìreach. A bharrachd air an sin, tha an rùn leasaichte de S3000 a’ leantainn gu àireamh nas àirde de ghinean agus UMIan air an lorg gach cealla, a’ comasachadh mion-sgrùdadh fada nas cruinne air na pàtrain tar-sgrìobhaidh spàsail agus cruinneachadh cheallan.
-
Seicheamh RNA nuclei singilte
Tha leasachadh dòighean glacaidh aon-chealla agus togail leabharlainn àbhaisteach, an cois seicheamh àrd-thoradh, air ath-nuadhachadh a dhèanamh air sgrùdaidhean faireachdainn gine aig ìre cealla. Tha an t-adhartas seo a’ ceadachadh mion-sgrùdadh nas doimhne agus nas coileanta a dhèanamh air àireamhan cealla iom-fhillte, a’ faighinn thairis air na crìochan co-cheangailte ri bhith a’ toirt a-steach abairt gine cuibheasach thar gach cealla agus a’ gleidheadh fìor ioma-ghnèitheachd taobh a-staigh nan àireamhan sin. Ged a tha buannachdan do-chreidsinneach aig seicheamh RNA aon-chealla (scRNA-seq), bidh e a’ tighinn tarsainn air dùbhlain ann an cuid de fhigheagan far a bheil e duilich a bhith a’ cruthachadh casg aon-chealla agus feumach air sampallan ùra. Aig BMKGene, bidh sinn a’ dèiligeadh ris a’ chnap-starra seo le bhith a’ tabhann sreath aon-niùclasach RNA (snRNA-seq) a’ cleachdadh an teicneòlas 10X Genomics Chromium as ùire. Tha an dòigh-obrach seo a’ leudachadh an speactram de shamhlaichean a tha comasach air mion-sgrùdadh tar-sgrìobhaidh aig ìre aon-chealla.
Tha iomallachd niùclas air a choileanadh tron chip ùr-ghnàthach 10X Genomics Chromium, anns a bheil siostam microfluidics ochd-seanail le slighean dùbailte. Taobh a-staigh an t-siostam seo, tha grìogagan gel a’ toirt a-steach còdan-bàr, primers, enzymes, agus aon niuclas air an cuairteachadh ann an boinneagan ola meud nanoliter, a’ cruthachadh Gel Bead-in-Emulsion (GEM). Às deidh cruthachadh GEM, bidh lysis cealla agus sgaoileadh còd-barra a’ tachairt taobh a-staigh gach GEM. Mar thoradh air an sin, bidh moileciuilean mRNA a’ faighinn ath-sgrìobhadh air ais gu cDNAn, a’ toirt a-steach còdan-bàr 10X agus Comharran Molecular Sònraichte (UMIs). Bidh na cDNAn sin an uairsin fo smachd togail leabharlainn sreath àbhaisteach, a’ comasachadh sgrùdadh làidir agus farsaing air pròifilean faireachdainn gine aig ìre aon-chealla.
Àrd-ùrlar: 10 × Genomics Chromium agus Illumina NovaSeq Platform
-
Tar-sgrìobhadh Spàsail Genomics Visium 10x
Is e teicneòlas ùr-nodha a th’ ann an transcriptomics spàsail a leigeas le luchd-rannsachaidh sgrùdadh a dhèanamh air pàtrain faireachdainn gine taobh a-staigh figheagan fhad ‘s a tha iad a’ gleidheadh an co-theacsa spàsail aca. Is e aon àrd-ùrlar cumhachdach san raon seo 10x Genomics Visium còmhla ri sreath Illumina. Tha prionnsapal 10X Visium na laighe air sliseag sònraichte le àite glacaidh ainmichte far a bheil earrannan clò air an cur. Anns an raon glacaidh seo tha spotan le còd-barra, gach fear a rèir àite sònraichte taobh a-staigh an stuth. Tha na moileciuilean RNA a chaidh a ghlacadh bhon stuth an uairsin air an ainmeachadh le aithnichearan moileciuil gun samhail (UMIs) tron phròiseas tar-sgrìobhaidh cùil. Tha na spotan còd-barra seo agus UMIan a’ comasachadh mapadh spàsail mionaideach agus tomhas abairt gine aig rùn aon-chealla. Bidh an cothlamadh de shamhlaichean le còd-barra spàsail agus UMIan a’ dèanamh cinnteach gu bheil an dàta a chaidh a chruthachadh ceart agus sònraichte. Le bhith a’ cleachdadh an teicneòlas Spatial Transcriptomics seo, faodaidh luchd-rannsachaidh tuigse nas doimhne fhaighinn air eagrachadh spàsail cheallan agus na h-eadar-obrachaidhean moileciuil iom-fhillte a tha a’ tachairt taobh a-staigh nèapraigean, a’ tabhann seallaidhean luachmhor air na h-innealan a tha mar bhunait air pròiseasan bith-eòlasach ann an grunn raointean, a’ gabhail a-steach oncology, neur-saidheans, bith-eòlas leasachaidh, imdhun-eòlas. , agus sgrùdaidhean luibh-eòlais.
Àrd-ùrlar: 10X Genomics Visium agus Illumina NovaSeq
