-
PacBio-Làn-fhaid 16S/18S/ITS Amplicon sreath
Tha àrd-ùrlar Amplicon (16S / 18S / ITS) air a leasachadh le bliadhnaichean de eòlas ann am mion-sgrùdadh pròiseact iomadachd microbial, anns a bheil mion-sgrùdadh bunaiteach àbhaisteach agus mion-sgrùdadh pearsanaichte: tha mion-sgrùdadh bunaiteach a’ còmhdach susbaint mion-sgrùdadh prìomh-shruthach de sgrùdadh microbial gnàthach, tha susbaint an anailis beairteach agus farsaing, agus tha toraidhean anailis air an taisbeanadh ann an cruth aithisgean pròiseict; Tha susbaint mion-sgrùdadh pearsanaichte eadar-dhealaichte. Faodar sampaill a thaghadh agus faodar paramadairean a shuidheachadh gu sùbailte a rèir an aithisg sgrùdaidh bunaiteach agus adhbhar an rannsachaidh, gus riatanasan pearsanaichte a thoirt gu buil. Siostam-obrachaidh Windows, sìmplidh agus luath.
-
Tar-sgrìobhadh Làn-fhaid PacBio (Gun iomradh)
A’ gabhail dàta seicheachaidh Isoform Pacific Biosciences (PacBio) mar chur-a-steach, bidh an App seo comasach air sreathan tar-sgrìobhaidh làn-fhaid a chomharrachadh (às aonais co-chruinneachadh). Le bhith a’ mapadh sreathan làn-fhaid an aghaidh genoma iomraidh, faodar tar-sgrìobhaidhean a bharrachadh le ginean aithnichte, tar-sgrìobhaidhean, roinnean còdaidh, msaa. Anns a’ chùis seo, faodar comharrachadh nas cinntiche de structaran mRNA, leithid splicing eile, msaa. Tha co-sgrùdadh le dàta sreathaidh tar-sgrìobhaidh NGS a’ comasachadh comharrachadh nas coileanta agus tomhas nas cruinne ann an abairt aig ìre tar-sgrìobhaidh, a tha gu ìre mhòr na bhuannachd do mhìneachadh eadar-dhealaichte sìos an abhainn agus mion-sgrùdadh gnìomh.
-
Innealan-ciùil
Tha BMKCloud na phrìomh àrd-ùrlar bith-fiosrachaidh a bheir seachad fuasgladh aon-stad airson prògraman genomic, anns a bheil earbsa farsaing aig luchd-rannsachaidh ann an grunn raointean a’ toirt a-steach eòlas meidigeach, àiteachais, àrainneachd, msaa. , goireasan coimpiutaireachd, stòr-dàta poblach, cùrsaichean bioinformtic air-loidhne, msaa. smachd càileachd, co-chruinneachadh, co-thaobhadh, às-tharraing dàta, mùthaidhean, staitistig, gineadair figear, mion-sgrùdadh sreath, msaa.
-
RNA beag
Tha RNAn beaga nan seòrsa de RNA goirid neo-chòdachadh le fad cuibheasach de 18-30 nt, a’ toirt a-steach miRNA, siRNA agus piRNA. Thathas air aithris gu mòr gu bheil na RNAn beaga sin an sàs ann an grunn phròiseasan bith-eòlasach leithid truailleadh mRNA, casg air eadar-theangachadh, cruthachadh heterochromatin, msaa. Tha àrd-ùrlar anailis sreathachaidh a’ toirt a-steach mion-sgrùdadh àbhaisteach agus mèinneadh dàta adhartach. Air bunait dàta RNA-seq, faodaidh mion-sgrùdadh àbhaisteach comharrachadh agus ro-innse miRNA a choileanadh, ro-innse gine targaid miRNA, mion-sgrùdadh notaichean agus faireachdainn. Tha mion-sgrùdadh adhartach a’ comasachadh sgrùdadh agus às-tharraing miRNA gnàthaichte, gineadh diagram Venn, miRNA agus togail lìonra gine targaid.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Tha NGS-WGS na àrd-ùrlar anailis ath-sheicheamh genome slàn, a tha air a leasachadh air bunait eòlas beairteach ann am Biomarker Technologies. Tha an àrd-ùrlar seo a tha furasta a chleachdadh a’ ceadachadh sruth-obrach anailis aonaichte a chuir a-steach gu sgiobalta le bhith dìreach a’ suidheachadh beagan paramadair bunaiteach, a tha a’ freagairt air dàta sreath DNA a chaidh a chruthachadh bho àrd-ùrlar Illumina agus àrd-ùrlar sreath BGI. Tha an àrd-ùrlar seo air a chleachdadh air frithealaiche coimpiutaireachd àrd-choileanadh, a bheir cumhachd do mhion-sgrùdadh dàta fìor èifeachdach ann an ùine glè bheag. Tha mèinneadh dàta pearsanaichte ri fhaighinn air bunait mion-sgrùdadh àbhaisteach, a’ toirt a-steach ceist gine mutated, dealbhadh primer PCR, msaa.
-
mRNA (iomradh)
Is e Transcriptome an ceangal eadar fiosrachadh ginteil genomic agus proteome gnìomh bith-eòlasach. Is e riaghladh ìre tar-sgrìobhaidh am modh riaghlaidh fàs-bheairtean as cudromaiche agus as fharsainge. Faodaidh seicheamh tar-sgrìobhaidh an tar-sgrìobhadh a leantainn aig àm sam bith no fo chumha sam bith, le rùn neo-mhearachdach gu aon nucleotide. sampall ath-sgrìobhaidhean sònraichte.
Aig an àm seo, tha teicneòlas seicheamh tar-sgrìobhaidh air a chleachdadh gu farsaing ann an agronomy, leigheas agus raointean rannsachaidh eile, a’ toirt a-steach riaghladh leasachadh bheathaichean is phlanntaichean, atharrachadh àrainneachd, eadar-obrachadh dìonachd, sgìreachadh gine, mean-fhàs ginteil gnè agus lorg tumhair is galair ginteil.
-
Metagenomics (NGS)
Tha an àrd-ùrlar anailis seo air a dhealbhadh airson mion-sgrùdadh dàta metagenomic gunna-gunna air bunait bliadhnaichean de eòlas. Tha e a’ gabhail a-steach sruth-obrach amalaichte anns a bheil grunn de mhion-sgrùdaidhean metagenomics a dh’ fheumar gu cumanta, a’ gabhail a-steach giullachd dàta, sgrùdaidhean ìre gnè, sgrùdaidhean ìre gnìomh gine, binneachadh metagenome, msaa. , suidheachadh paramadair, gineadh figear pearsanaichte, msaa.
-
LncRNA
Is e seòrsa de ath-sgrìobhaidhean le faid nas fhaide na 200 nt a th’ ann an RNAn neo-chòdachadh fada (lncRNA), nach urrainn pròtainean a chòdachadh. Tha fianais tionalach a’ nochdadh gu bheil a’ mhòr-chuid de lncRNAn dualtach a bhith obrachail. Tha teicneòlasan seicheamh àrd-threabhadh agus innealan sgrùdaidh bith-fiosrachaidh a’ toirt cumhachd dhuinn sreathan lncRNA agus fiosrachadh suidheachaidh fhoillseachadh nas èifeachdaiche agus ar stiùireadh gu lorg lncRNAn le gnìomhan riaghlaidh deatamach. Tha BMKCloud moiteil àrd-ùrlar mion-sgrùdadh sreath lncRNA a thoirt don luchd-ceannach againn gus mion-sgrùdadh lncRNA luath, earbsach agus sùbailte a choileanadh.
-
GWAS
Tha sgrùdadh comann air feadh genome (GWAS) ag amas air caochlaidhean ginteil (genotype) a chomharrachadh a tha co-cheangailte ri feartan sònraichte (phenotype). Bidh sgrùdaidhean GWA a’ sgrùdadh comharran ginteil a ’dol thairis air genoma iomlan de àireamh mhòr de dhaoine fa-leth agus a’ ro-innse comainn genotype-phenotype le mion-sgrùdadh staitistigeil aig ìre sluaigh. Dh’ fhaodadh ath-sheicheamh làn-genome faighinn a-mach a h-uile caochladh ginteil. A’ ceangal ri dàta phenotypic, faodar GWAS a ghiullachd gus SNPan co-cheangailte ri phenotype, QTLs agus ginean tagraiche a chomharrachadh, a tha gu làidir a’ toirt taic do ghintinn bheathaichean/lusan an latha an-diugh. Tha SLAF na ro-innleachd seicheamh genome nas sìmplidhe fèin-leasaichte, a tha a’ lorg comharran sgaoilte air feadh genome, SNP. Faodar na SNPn sin, mar chomharran ginteil moileciuil, a phròiseasadh airson sgrùdaidhean co-cheangail le comharran cuimsichte. Tha e na ro-innleachd cosg-èifeachdach ann a bhith a’ comharrachadh atharrachaidhean ginteil co-cheangailte ri feartan iom-fhillte.
-
Ath-sgrìobhaidhean làn-ùine Nanopore
Tha isoforman iom-fhillte agus caochlaideach eile ann am fàs-bheairtean nan dòighean ginteil cudromach airson a bhith a’ riaghladh faireachdainn gine agus iomadachd pròtain. Tha comharrachadh ceart de structaran tar-sgrìobhaidh mar bhunait airson sgrùdadh domhainn air pàtrain riaghlaidh faireachdainn gine. Tha àrd-ùrlar sreathachaidh Nanopore air sgrùdadh tar-sgrìobhaidh a thoirt gu ìre isoform. Tha an àrd-ùrlar anailis seo air a dhealbhadh gus mion-sgrùdadh a dhèanamh air dàta RNA-Seq a chaidh a chruthachadh air àrd-ùrlar Nanopore air bunait genoma iomraidh, a choileanas mion-sgrùdaidhean càileachdail is cainneachdail ann an ìre gine agus ìre tar-sgrìobhaidhean.
-
circ-RNA
'S e seòrsa de RNA neo-còdaidh a th' ann an cearcall RNA (circRNA), a chaidh a lorg o chionn ghoirid gu bheil pàirt chudromach aca ann an lìonraidhean riaghlaidh a tha an sàs ann a bhith a' leasachadh, strì an aghaidh na h-àrainneachd, msaa. tha cinn circRNA air an ceangal ri chèile gus structar cruinn a chruthachadh, a shàbhaileas iad bho bhith a’ cnàmhadh exonuclease agus a tha nas seasmhaiche na a’ mhòr-chuid de RNA sreathach. Thathas air faighinn a-mach gu bheil gnìomhan eadar-dhealaichte aig CircRNA ann a bhith a’ riaghladh faireachdainn gine. Faodaidh CircRNA coileanadh mar ceRNA, a tha a’ ceangal miRNA gu farpaiseach, ris an canar spong miRNA. Tha àrd-ùrlar anailis sreathachaidh CircRNA a’ toirt cumhachd do mhion-sgrùdadh structar agus faireachdainn circRNA, ro-innse targaidean agus mion-sgrùdadh còmhla le seòrsachan eile de mholacilean RNA
-
BSA
Tha àrd-ùrlar Mion-sgrùdadh Bulked air a dhèanamh suas de mhion-sgrùdadh àbhaisteach aon-cheum agus mion-sgrùdadh adhartach le suidheachadh paramadair gnàthaichte. Tha BSA na dhòigh air a chleachdadh gus comharran ginteil co-cheangailte ri phenotype a chomharrachadh gu sgiobalta. Ann am prìomh shruth-obrach BSA tha: 1. taghadh dà bhuidheann de dhaoine fa leth le phenotypes a tha gu math dùbhlanach; 2. a' cruinneachadh an DNA, RNA no SLAF-seq (Air a leasachadh le Biomarker) de gach neach gus dà mhòr-chuid de DNA a chruthachadh; 3. a' comharrachadh sreathan eadar-dhealaichte an aghaidh genoma iomraidh no eadar iad, 4. ro-innse roinnean co-cheangailte ri tagraichean le ED agus algairim clàr-amais SNP; 5. Mion-sgrùdadh gnìomh agus beairteas air ginean ann an roinnean tagraiche, msaa. Tha mèinneadh nas adhartaiche ann an dàta a’ gabhail a-steach sgrìonadh comharran ginteil agus dealbhadh primer cuideachd.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Tha àrd-ùrlar Amplicon (16S / 18S / ITS) air a leasachadh le bliadhnaichean de eòlas ann am mion-sgrùdadh pròiseact iomadachd microbial, anns a bheil mion-sgrùdadh bunaiteach àbhaisteach agus mion-sgrùdadh pearsanaichte: tha mion-sgrùdadh bunaiteach a’ còmhdach susbaint mion-sgrùdadh prìomh-shruthach de sgrùdadh microbial gnàthach, tha susbaint an anailis beairteach agus farsaing, agus tha toraidhean anailis air an taisbeanadh ann an cruth aithisgean pròiseict; Tha susbaint mion-sgrùdadh pearsanaichte eadar-dhealaichte. Faodar sampaill a thaghadh agus faodar paramadairean a shuidheachadh gu sùbailte a rèir an aithisg sgrùdaidh bunaiteach agus adhbhar an rannsachaidh, gus riatanasan pearsanaichte a thoirt gu buil. Siostam-obrachaidh Windows, sìmplidh agus luath.
