Mean-fhàs genome
Pnans
An dachaigh tùs agus dachaigheil ann an dachaigh Gold Pretfish (Carassius AuraTus)
Pacbio | Illumina | Mapa genome Biono Genome | Hi-c Genome Seanadh | Mapa ginteil | Gwas | Rna-seq
Prìomh thachartasan
Chaidh 1.Godldfish Genome ùrachadh le dreach co-phàirteach àrd-inbhe, achlageing 95.75% de chruinnean a-steach do 50 pseudochromosomes (Scufbolmosomes (SCHADODOLS N50 = 31.84 MB). Bha dà subgenomomes air an sgaradh.
Chaidh dleastanasan èideadh de shèideadh roghnachaidh a chomharrachadh ann an dachaigheil a bhith ag ath-pàirteachadh dàta 201 neach, a 'nochdadh thairis air 390 genes tagraiche a tha dualtach co-cheangailte ri comharran dachaigheil.
3.Gwas air Dorsal Fin ann an aodach òir dachaigheil chaidh 378 genes tagraiche a dh 'fhaodadh a bhith ceangailte. Chaidh neach-aithris Tyrosine-prine a chomharrachadh mar ghineadair adhbharach tagraiche a tha co-cheangailte ri follaiseachd
Cùl-fhiosrachadh
Is e iasg òr (Carassius Auratus) aon den iasg a tha an tuathanais as cudromaiche, a chaidh a nochdadh dachaigheil bho chàr crubhadach ann an seann china. Thuirt Teàrlach Darwin riutha mar "a 'dol seachad air iomadachd beag neo-chrìochnach, bidh sinn a' coinneachadh ris na h-atharrachaidhean as iongantach aca air structar". Tha feartan gu math eadar-mheasgte agus eachdraidh fhada de dhachaighiche is briodachaidh a 'dèanamh suas uisge modail modail fìor mhath airson eòlas-inntinn èisg agus mean-fhàs.
Euchdan
Genome feòil òir
JBidh mion-sgrùdadh air leth de phacbio agus den fhacal paidhir-lagha paidhir paidhir pacumina a 'toirt toradh tùsail 1.657 G FIOSRACHADH (a' Chiondig N50 = 474 KB). Chaidh mapa optaigeach Biono a 'chùis a chruthachadh agus a cheartachadh an t-seanadh ann an 1.73 GB ann am meud (meud fìor air an tuairmseach: 1.8 GB). Scrofold stèidhichte nas fheàrr ann an t-sreath nas fheàrr N50 bho 606 KB gu 31.84 MB agus choilean e 95.75% (1.65 GB) a tha stèidhichte agus òraid. Tha 56,251 a 'toirt a-steach 56,251 ginean cooding agus 10,098 thairis air tar-sgrìobhadh fada nach deach a chaitheamh. A bharrachd air an sin, bha 38 de roinnean Centromeicic a 'ro-innse de 50 cromosoman.
Fig.1 Genome Girce Genome
TB 'chaidh seataichean soilleir de fo-thaighean a chomharrachadh anns na 50 chromosoman òir le òr-uisge a thàinig bho sheann thachartasan dìonach. Bha seata cromosoman le cuibhreann nas àirde de leasachaidhean agus barbinae air a mhìneachadh mar subgenome A (Chra01 ~ A25).
Dìth-dachaigh agus sguabadh roghnach
AGu h-iomlan 16 CARPS Crucianach Seòrsa Cruinneachaidh Seòrsa Wild agus 185, bha atharrachaidhean òir òir de dhimhneachadh timcheall air 12.5x, a 'gineadh 4.3 teabacas dàta. Chaidh ath-thogail phyrosgetic agus mion-sgrùdadh PCA a dhèanamh a 'dearbhadh dàimh nas dlùithe eadar cumhachd òir agus carpachas cruachan cumanta, a roinnte ann an dà shreath.
LD Ragy Air ceithir fo-thalamh air na ceithir fo-thalamh le buidhnean botail leathann sluaigh ann an dachaigheil agus taghadh fuadain làidir ann am faigheadh òganach. Thuirt barrachd iomadachd biorach (Π) bho ghup cruuitan gu faodadh fuais òir cumanta le Wanttet òir òr is uighean a 'nochdadh cruinneachadh mòr de dh' atharrachaidhean ginteileach rè an dachaigheil. Bha 50 roinnean fìor sgudail a 'còmhdach 25.2 MB agus 946 Genes air an comharrachadh bho dhàta riochdachaidh (33 crap òir agus 16 crap cruiuch). Leudaich anailis a leudachadh gu 201 daoine, agus chomharraich 393 ginean roinnean de sguabadh roghnach crìochnaichte. Chaidh na genes sin a lorg le iomadachd ìosal, a tha coltach ris na poneatypes co-cheangailte ri prìomh rudan a tha san dachaigh ann am fuaigheal Òir.
Fig.3 Mion-sgrùdadh co-cheangailte ri daoine
Gwas air iasg òir dachaigheil
DTha ORSAL Fin na phrìomh fheart a 'dèanamh eadar-dhealachadh suas wen goimh-dhath òir bho ugh uisge uighean. GWAS of dorsal fin on 96 Wen goldfish and 87 Egg goldfish revealed 378 candidate genes spread across 13 chromosomes and an uneven distribution of these genes between subgenomes was observed. Mion-sgrùdadh gnìomh mu na genesairean tagraichean sin a tha a 'toirt buaidh air pròiseasan bith-eòlasach "," Còmhdhail thar-ghluasaid "," Leasachadh Siostam Gynetal ", msaa.
Fig.4 gwas de dhàta drosal air iasg òir dachaigheil
In gwas de luchd-reic co-cheangailte ri sgèile làidir, chaidh aon sliais làidir làidir a lorg. Chaidh gabhail ri geam a chaidh a ghlacadh a-mach dìon pròtain a thoirt air a chomharrachadh ann an aon de chleachdaidhean tagraiche.
Fig.5 gwas de na feartan co-cheangailte ri sgèile a tha ceangailte ri sgèile
Iomradh
Ccearc d et al. Tha an dachaigh tùs agus dachaigheil ann an dachaigh a 'ghluasaid ann am fuaigheal Òir (Carassius AuraTus). Panas (2020)
Naidheachdan Amasan aig a bhith a 'roinneadh na cùisean soirbheachail as ùire le teicneòlasan biomarker, a' glacadh òrdughan saidheansail a bharrachd air dòighean follaiseach air an cur a-steach tron sgrùdadh.
Ùine a 'phuist: Faoilleach-04-2022