Exclusive Agency for Korea

BMKCloud Log a-steach

Bathar

Eadar-obrachadh Chromatin stèidhichte air Hi-C

Is e dòigh a th’ ann an Hi-C a chaidh a dhealbhadh gus rèiteachadh genomic a ghlacadh le bhith a’ cothlamadh eadar-obrachaidhean stèidhichte air faisg air làimh agus sreath àrd-threabhaidh. Tha an dòigh-obrach stèidhichte air chromatin crosslinking le formaldehyde, air a leantainn le cnàmhadh agus ath-ligation ann an dòigh nach bi ach pìosan a tha ceangailte gu covalent a chruthachadh stuthan ligation. Le bhith a’ leantainn nan toraidhean ligation sin, tha e comasach sgrùdadh a dhèanamh air eagrachadh 3D an genoma. Tha Hi-C a’ comasachadh sgrùdadh a dhèanamh air cuairteachadh earrannan den genoma a tha air am pacadh gu aotrom (roinnean A, euchromatin) agus nas dualtaiche a bhith gnìomhach ann an tar-sgrìobhadh, agus na roinnean a tha air am pacadh nas teann (roinnean B, Heterochromatin). Faodar Hi-C a chleachdadh cuideachd gus Fearann Topologically Co-cheangailte (TADs) a chomharrachadh, roinnean den genoma aig a bheil structaran fillte agus a tha dualtach pàtrain faireachdainn co-chosmhail a bhith aca, agus gus lùban chromatin, roinnean DNA a tha air acair còmhla le pròtanan agus a tha. gu tric beairteach ann an eileamaidean riaghlaidh. Tha seirbheis seicheamhachaidh Hi-C BMKGene a’ toirt cumhachd do luchd-rannsachaidh sgrùdadh a dhèanamh air meudan spàsail genomics, a’ fosgladh slighean ùra gus riaghladh genome a thuigsinn agus a’ bhuaidh a th’ aige air slàinte is galair.

Cuir fios thugainn

Mion-fhiosrachadh seirbheis

Bith-fiosrachadh

Toraidhean demo

Foillseachaidhean sònraichte

Feartan seirbheis

● Sequencing air Illumina NovaSeq le PE150.

● Feumaidh an t-seirbheis sampallan clò, an àite searbhagan niuclasach a chaidh a thoirt a-mach, a dhol thairis air ceangal le formaldehyde agus na h-eadar-obrachaidhean DNA-protein a ghleidheadh.

● Tha an deuchainn Hi-C a’ toirt a-steach a bhith a’ cuingealachadh agus a’ càradh na h-oirean steigeach le biotin, agus an uairsin a’ cuairteachadh na h-oirean maol fhad ‘s a tha iad a’ gleidheadh na h-eadar-obrachaidhean. Tha an DNA an uairsin air a shlaodadh sìos le grìogagan streptavidin agus air a ghlanadh airson ullachadh an leabharlainn às deidh sin.

Buannachdan seirbheis

●Dealbhadh Enzyme Cuingealachaidh as Fheàrr: gus dèanamh cinnteach à èifeachdas àrd Hi-C air diofar ghnèithean le suas ri 93% paidhrichean eadar-obrachaidh dligheach.

●Eòlas farsaing agus clàran foillseachaidh:Tha eòlas mòr aig BMKGene le> 2000 pròiseact sreath Hi-C bho 800 gnè eadar-dhealaichte agus diofar pheutantan. Còrr is 100 cùis foillsichte le feart buaidh tionalach de chòrr air 900.

●Sgioba Bith-fiosrachaidh air leth sgileil:le peutantan a-staigh agus dlighe-sgrìobhaidh bathar-bog airson deuchainnean Hi-C agus mion-sgrùdadh dàta agus bathar-bog dàta fradharc fèin-leasaichte.

●Taic iar-reic:Tha ar dealas a’ leudachadh nas fhaide na crìoch a’ phròiseict le ùine seirbheis 3-mìosan às deidh reic. Rè na h-ùine seo, bidh sinn a’ tabhann seiseanan leanmhainn pròiseict, cuideachadh fuasgladh cheistean, agus seiseanan Q&A gus dèiligeadh ri ceistean sam bith co-cheangailte ris na toraidhean.

●Annotation coileanta: bidh sinn a’ cleachdadh grunn stòran-dàta gus na ginean a chomharrachadh le caochlaidhean comharraichte agus an sgrùdadh beairteachaidh co-fhreagarrach a dhèanamh, a’ toirt seachad seallaidhean air ioma-phròiseactan rannsachaidh.

Sònrachaidhean seirbheis

Leabharlann

Ro-innleachd sreathachaidh

Toradh dàta air a mholadh

Fuasgladh Comharra Hi-C

Leabharlann Hi-C

Illumina airson PE 150

Lùb chromatin: 150x

TAD: 50x

Lùb chromatin: 10Kb

TAD: 40Kb

Riatanasan Seirbheis

Seòrsa sampall	Meud riatanach
Stuth beathach	≥2g
Fuil Uile	≥2mL
Fungasan	≥1g
Lusan - clò òg	1g/aliquot, 2-4 aliquotes air am moladh
Ceallan Cultarach	≥1x10⁷

Roimhe: TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit

Air adhart: DNBSEQ leabharlannan a chaidh a dhèanamh ro-làimh

A’ toirt a-steach an anailis a leanas:

● Raw dàta QC;

● Mapadh agus leabharlann Hi-C QC: paidhrichean eadar-obrachaidh dligheach agus luchd-taisbeanaidh lobhadh eadar-ghnìomhach (IDEs);

● Pròifil eadar-obrachaidh Genome-wide: mion-sgrùdadh cis/trans agus mapa eadar-obrachaidh Hi-C;

● Mion-sgrùdadh air cuairteachadh roinn A/B;

● Comharrachadh TADs agus lùban chromatin;

● Mion-sgrùdadh eadar-dhealaichte air eileamaidean structar chromatin 3D am measg shampaill agus comharrachadh gnìomh co-fhreagarrach air ginean co-cheangailte.

Sgaoileadh cuibhreann cis agus trans

Mapa teas de eadar-obrachadh chromosomal eadar sampaill

Sgaoileadh air feadh genome de roinnean A/B

Sgaoileadh genome-farsaing de lùban chromatin

Sealladh farsaing air TADs

Dèan sgrùdadh air na h-adhartasan rannsachaidh air an cuideachadh le seirbheisean seicheamh Hi-C BMKGene tro chruinneachadh de fhoillseachaidhean curanta.

Meng, T. et al. (2021) 'Tha mion-sgrùdadh coimeasach ioma-omics a' comharrachadh CA2 mar thargaid ùr airson chordoma',Neuro-Oncology, 23(10), td. 1709–1722. doi: 10.1093/NEUONC/NOAB156.

Xu, L. et al. (2021) ‘Tha mì-eagrachadh 3D agus ath-rèiteachadh genoma a’ toirt seachad seallaidhean air pathogenesis de NAFLD le Hi-C, Nanopore, agus sreath RNA aonaichte’,Tha an artaigil Pharmaceutica Sinica B, 11(10), td. 3150–3164. doi: 10.1016/J.APSB.2021.03.022.