Leabharlannan Illumina a chaidh a dhèanamh ro-làimh
Feartan
●Àrd-ùrlaran:Illumina NovaSeq 6000 agus NovaSeq X Plus
●Modhan sreathachaidh:PE150 agus PE250
●Smachd càileachd leabharlannan mus tèid an òrdugh
●Cur an òrdugh dàta QC agus lìbhrigeadh:lìbhrigeadh aithisg QC agus dàta amh ann an cruth fastq às deidh a bhith a’ demultiplexing agus a ’sìoladh leughaidhean Q30
Buannachdan seirbheis
●Iom-fhillteachd nan seirbheisean seicheamhachaidh:faodaidh an neach-ceannach roghnachadh sreath a dhèanamh le sreath, cealla sruthadh, no a rèir na tha de dhàta a dhìth (sreath sreath pàirt).
●Eòlas farsaing air àrd-ùrlar sreath Illumina:le mìltean de phròiseactan dùinte le diofar ghnèithean.
●Lìbhrigeadh aithisg QC sreath:le meatrach càileachd, cruinneas dàta agus coileanadh iomlan a’ phròiseict sreathachaidh.
●Pròiseas leanmhainn aibidh:le ùine tionndaidh goirid.
●Smachd càileachd teann: bidh sinn a’ cur an gnìomh riatanasan QC teann gus dèanamh cinnteach gun tèid toraidhean àrd-inbhe a lìbhrigeadh gu cunbhalach.
Àrd-ùrlaran eisimpleirean
| Àrd-ùrlar | Cell Sruth | Modh sreathachaidh | Aonad | Toradh tuairmseach |
| NovaSeq X | 10B (8 slighean) | PE150 | Caol-shràid shingilte Caol-shràid pàirteach | 375Gb / Caolshràid |
| 25B (8 slighean) | PE150 | Caol-shràid shingilte Caol-shràid pàirteach | 1000 Gb / Caolshràid | |
| NovaSeq 6000 | Cealla sruthadh SP (2 shreath) | PE250 | Cell Sruth Caol-shràid shingilte Caol-shràid pàirteach | 325-400 M leugh / Lane |
| Cealla sruthadh S4 (4 sreathan) | PE150 | Cell Sruth Caol-shràid shingilte Caol-shràid pàirteach | ~ 800 Gb / Caolshràid |
Sampall Riatanasan
| Meud an dàta (X) | dùmhlachd (qPCR/nM) | Toirt | |
| Seicheamh pàirt-laighe
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 Gb | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
| Seicheamh lain | Per Lane | ≥ 1.5 nM / amar leabharlainn | ≥ 25 μl / amar leabharlainn |
A bharrachd air dùmhlachd agus suim iomlan, tha feum air pàtran stùc iomchaidh cuideachd.
Nota: Feumaidh sreath de leabharlannan iomadachd ìosal PhiX spike a-steach gus dèanamh cinnteach gu bheil bunait làidir ann.
Tha sinn a’ moladh leabharlannan a chuir a-steach ro-làimh mar shamhlaichean. Ma tha feum agad air BMKGENE gus cruinneachadh leabharlainn a dhèanamh, thoir sùil air
riatanasan leabharlainn airson sreath pàirt de shreathan.
Meud an Leabharlainn (Mapa as àirde)
Bu chòir am prìomh stùc a bhith taobh a-staigh 300-450 bp.
Bu chòir aon phrìomh stùc a bhith aig leabharlannan, gun truailleadh inneal-atharrachaidh no dimers primer.
Feuch an cuir thu fios thugainn mura h-eil na sampallan agad a’ coinneachadh ris na riatanasan stuth tòiseachaidh.
Sruth-obrach seirbheis
Leabharlann càileachd smachd a
Seicheamh
Smachd càileachd dàta
Lìbhrigeadh pròiseict
Leabharlann QC aithisg
Tha aithisg air càileachd an leabharlainn air a thoirt seachad mus tèid a chur an òrdugh, a' measadh meud an leabharlainn, agus a' briseadh sìos.
A’ leantainn aithisg QC
Clàr 1. Staitistigean air dàta sreathachaidh.
| ID sampall | BMKID | Tha amh a' leughadh | Dàta amh (bp) | Leughadh glan (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figear 1. Sgaoileadh càileachd an cois leughaidhean anns gach sampall
Figear 2. Sgaoileadh susbaint bunaiteach
Figear 3. Sgaoileadh susbaint leughaidh ann an dàta sreathachaidh
