Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Toraidhean

DNA / RNA SEQUMEING -PebBio Sequence

Tha àrd-ùrlar iar-ghoireasan aig Pacbio ann an àrd-ùrlar sgecbio o chionn fhada, air an canar cuideachd air aon de na sreathan treas ginealach (TGS) teicneòlasan. An cridhe bunaiteach, aon-mhotha-ùine aon-ùine (SMRT), Cumaidhean Generation Leughadh le deichean a 'chladach de dh'fhaid. Air bunait de "sequeencing-by-in-synthesis", tha rùn neclogide singilte air a choileanadh le Wavegunide Waveguide (ZMW), far nach eil ach àireamh de shion-co-chòrdadh "air a shoilleireachadh. A bharrachd air an sin, chan eil feum air luchd-smeòrachadh gu ìre mhòr ann an siostam NGS, anns am bi feum air ceumannan leudachaidh PCR ann am pròiseas togail leabharlann PCR.

 

Àrd-ùrlar: Sequel II, Revio


Mion-fhiosrachadh seirbheis

Toraidhean an latha

Feartan

Dà dhòigh sequenergs air an t-sreath Pacbio: Long Long Red (CLR) agus co-aontachd cruinn) Lead (CCS)

Modh SequeNring Meud leabharlainn Dàta teòiridheachToradh (gach cealla) Aon-bhonnCruinneas Tagraidhean
CLR 20kb, 30kb, msaa. 80 GB gu 130 GB Mullx. 85% De novo, SV gairm, msaa.
CCS 15-20 kb

14 gu 40 GB / Cell (Sequel II)

70 gu 110 GB / CELL (Revio)

An urra ri na samples

Mullx. 99% De novo, SNP / INDEL / NEVALTING, ISO-seq,

Coimeas eadar coileanadh coileanaidh agus feartan Regio agus Sequel II

Cumhachan

Siostam seichel II

Siostam Ath-aisig

Àrdachadh

Dùmhlachd nas àirde

8 millean zmws

25 millean zmws

3x

Ìrean neo-eisimeileach

1

4

4x

Amannan ruith nas giorra

30 uair

24 uairean

1.25x

Genomeman / bliadhna HIFI HIFI

88

1,300

15x gu h-iomlan

Buannachdan Seirbheis

● Tha còrr air 8 bliadhna de eòlas air àrd-ùrlar secbio le mìltean de phròiseactan dùinte le diofar ghnèithean.

● Tha e làn uidheamaichte leis na àrd-ùrlaran taidhe taidhe Pannbio as ùire, ath-sgrùdais gus gealltainn ceanglaichean-ama agus a bhith a 'toirt taic gu leòr.

● Tionndadh nas luaithe timcheall ùine, toradh dàta nas àirde agus dàta nas cruinne.

● Chuir iad ris na ceudan de fhoillseachaidhean stèidhichte air pacbio stèidhichte.

Riatanasan sampaill


Seòrsa sampall Suim Dùmhlachd (Ruig®) Tomhas-lìonaidh Purity Feadhainn eile
DNA Genomic DNA An urra ri riatanas dàta ≥50 ng / μl ≥15μl OD260 / 280 = 1.7-2.2;
OD260 / 230 = 1.8-2.5;
Stùc soilleir aig 260 nm,Gun truaillidhean
Feumar dùmhlachd a thomhas le QUBBIT AGUS QUBIT / nanopore = 0.8-2-2.5
Rna iomlan ≥1.2μg ≥120 ng / μl ≥15μl OD260/180 = 1.7-2.5;
OD260 / 230 = 0.5-2.5;Gun truaillidhean

Tha luach rin ≥7.5

5428s / 18s≥11

 

Neach-obrach seirbheis

Ullachadh sampall

Ullachadh sampall

Ullachadh leabharlainn

Togail leabharlainn

SequeNrings

SequeNrings

Mion-sgrùdadh dàta

Mion-sgrùdadh dàta

Sampall QC

Lìbhrigeadh pròiseict


  • Mus tèid:
  • An ath rud:

  • Iarrtas dàta 1.in-thaighean

    Dàta a chaidh a chruthachadh bho 63 ceallan CCS (bho 26 gnè)

    Dàta-Pbbio-ccs-15 kb Cuibheasach Max Mion Meadhan
    Toradh - fo-thalamh (GB) 421.12 544.27 221.38 426.58
    Yiled - CCS (GB) 25.93 38.59 10.86 25.43
    Polymerase N50 145,651 175,430 118,118 144,689
    Fo-chinn N50 17,509 23,924 12,485 17,584
    CCS N50 14,490 19,034 9,876 14,747
    BLOWMERASE MÒR 67,995 89,379 49,664 66,433
    Faid cuibheasach-ster6s 15,866 21,036 11,657 16,012
    Fad cuibheasach-CCS 14,489 19,074 8,575 14,655

    Dàta a chaidh a chruthachadh bho 16 ceallan clàir (bho 76 gnè)

    Dàta-pacbio-clr-30kb Cuibheasach Max Mion Meadhan
    Toradh - fo-thalamh (GB) 142.20 291.40 50.55 142.49
    Polymerase N50 39,456 121,191 15,389 35,231
    Fo-chinn N50 28,490 41,012 14,430 29,063
    BLOWMERASE MÒR 22,063 48,886 8,747 21,555
    Faid cuibheasach-ster6s 17,720 27,225 8,293 17,779

    2.data QC - DemoStaitistig air toradh dàta

    Eisimpleir

    Bidh CCS a 'leughadh num

    Leud CCS CCS (BP)

    Bidh CCS a 'leughadh N50 (BP)

    Fad cuibhean CCS (BP)

    CCS Lathest Leugh (BP)

    ionadan basan (BP)

    Ìre CCS (%)

    Pb_bmkxxxxxx

    3,444,159

    54,164,122,586

    15,728

    15,726

    36,110

    863,326,330,465

    6.27

     

    Faigh cuòt

    Sgrìobh do theachdaireachd an seo agus cuir thugainn e

    Cuir an teachdaireachd agad thugainn: