MRNNA làn-ùine -Pebbio
Feartan
● sionthesis co-chur bho poly-a MRnna le ullachadh Leabharlann
● Bidh sequencing ann am modh CCS, a 'gineadh Hifi a' leughadh
● Cruthaich na tar-sgrìobhaidhean làn-fad
● Chan fheum an anailis a bhith a 'toirt iomradh air fìor fhìrinn; Ach, dh 'fhaodadh a bhith air fhastadh
● Tha mion-sgrùdadh biocfachais a 'toirt seachad mion-sgrùdadh air tar-sgrìobhaidhean Isolic LNCRNA, fusons gine, pocannan poca, agus structar gine
Buannachdan Seirbheis
●Cruinneas àrd: Bidh Hifi a 'leughadh le mionaideachd> 99.9% (Q30 (Q30), a thomhas gu GNA
● Mion-sgrùdadh splicing eadar: Leigidh na tar-sgrìobhaidhean gu lèir a 'comasachadh comharrachadh israiteach agus caractar
●Eòlas farsaing: Le eachdraidh shligheach de bhith a 'crìochnachadh còrr air 1100 gnìomhachas tar-chur làn-fad PacBio agus a' giullachd còrr air 2300 sampaill, tha an sgioba againn a 'toirt beairteas de eòlas a-steach don h-uile pròiseact.
●Taic às dèidh reic: Tha ar dealas a 'leudachadh taobh a-muigh crìochnachadh a' phròiseict le ùine seirbheis 3-mìosan. Aig an àm seo, tha sinn a 'tabhann ceuman air a' phròiseact, a 'cur-neartachadh taic, agus Q & Q & Seiseanan gus dèiligeadh ri ceistean sam bith co-cheangailte ris na toraidhean.
Riatanasan agus lìbhrigeadh sampaill
| Leabharlann | Ro-innleachd SequeNroming | Dàta air a mholadh | Smachd Càileachd |
| Air Polya a bheairtigeadh Leabharlann MRNA CCS | Pacbio Sequel II Pacbio Revio | 20/40 GB 5/10 m CCS | Q30SI85% |
Riatanasan sampaill:
Nucleolides:
● Lusan:
Freumh, stem no petal: 450 mg
Duilleach no sìol: 300 mg
Measan: 1.2 g
● beathach:
Cridhe no brathaidh: 300 mg
Viscera no eanchainn: 240 mg
Fèithean: 450 mg
Cnàmhan, falt no craiceann: 1g
● Arthropods:
Biastagan: 6g
Crùbach: 300 mg
● Fuil slàn: 1 tiùb
● Ceallan: 106 ceallan
| Co-dhùnadh. (Ng / μl) | Suim (μg) | Purity | Ionracas |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2-2.5 Cuibhrichte no gun mhothachadh pròtain no DNA air a shealltainn air gel. | Airson lusan: rin≥7.5; Airson beathaichean: rin≥8.0; 5.0 E18 / 18mh a-steach1.0; Lùghdachaidh no chan eil àrdachadh bun-loidhne |
Lìbhrigeadh sampall air a mholadh
Container: 2 tiùb 2 ml ceudair (chan eilear a 'moladh foil)
Labeling Labeling: Clèireach Buidheann + me A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Gluasad:
1. Deigh tioram: Feumaidh sampaill a bhith air am pacadh ann am pocannan agus air an tiodhlacadh ann an deigh tioram.
2. Tubas runastble: Faodar sampaill RNA a thiormachadh ann an tiùba seasmhach RNA (me cuairteach®) agus air a chuir ann an teòthachd an t-seòmair.
Sruth obair seirbheis
Dealbhadh deuchainn
Lìbhrigeadh sampaill
Rna a-mach
Togail leabharlainn
SequeNrings
Mion-sgrùdadh dàta
Seirbheisean às deidh a reic
A 'toirt a-steach an sgrùdadh a leanas:
● Smachd càileachd dàta amh
● Mion-sgrùdadh Polyadenyy no an APA)
● Sgrùdadh tar-sgrìobhadh fusion
● Mion-sgrùdadh splicing eadar
● Sumibalking Cenchmarking Senchalal Sgrùdadh Orthologs (Busco)
● Mion-sgrùdadh Struscript: Ro-innse sreathan còcaireachd (CDan) agus an nonotation gnìomhach
● Mion-sgrùdadh LNCRna: Ro-innse LCNRNA AGUS TÒRRAIDHEAN
● Comharrachadh microtelite (SSR)
Mion-sgrùdadh Busco
Mion-sgrùdadh splicing eile
Mion-sgrùdadh Polyadenyy North (APA)
Ainmeachadh gnìomh de thiofar litrichean nobhail
Dèan sgrùdadh air na h-adhartasan a tha air an comasachadh bho na seirbheisean sgith-iarainn làn-ùine BMKgene anns an fhoillseachadh seo gu sònraichte.
Ma, y. et al. (2023) 'Mion-sgrùdadh coimeasach de dhòighean sgàilean Pacbio agus Ont RNA airson DÙTHCHASAN NOMURAI PENROMAN', Genumraics, 115 (6), td. 110709. DOI: 10.1016 / J.Ygeno.2023.110709.
Chao, Q. et al. (2019) 'Dynamics Engminic Stem Ingcriptome', Iris Bitechnolo Pust, 17 (1), PP. 206-219. doi: 10.1111 / pbi.12958.
Deng, H. et al. (2022) 'Atharraichean beothail ann an susbaint searbhagach Ascorbic rè leasachadh measan agus a' togail ri Unifolms Contaelia (Iris Eadar-nàiseanta nan Saidheansan Moleculia, 23 (10), td. 5808. DOI: 10.3390 / IJMS23105808 / S1.
Hua, x. et al. (2022) 'Cleachdadh èifeachdach air Genes Fathways bith-eòlasach ann am Parisphyllins biorach ann am Parisphyllins', bith-eòlas conaltraidh 2022 5: 1 (1), 1-10. doi: 10.1038 / S42003-022-03000-Z.
Liu, m. et al. (2023) 'Combined PacBio Iso-Seq and Illumina RNA-Seq Analysis of the Tuta absoluta (Meyrick) Transcriptome and Cytochrome P450 Genes', Insects, 14(4), p. 363. DOI: 10.3390 / biacts 3040363 / S1.
Wang, lijun et al. (2019) 'sgrùdadh air iom-fhillteachd tar-sgrìobh-sgrìobhaidh a' cleachdadh sgrùdadh-ciùil Illbio Foundcule ann an Biosyntis Servelotic ann an Riversure Consiumis ', 20-17. 1-17. 1-17. Doi: 10.1186 / S12864-019-5832-9.
