Mion-sgrùdadh segregdant a 'molladh
Buannachdan Seirbheis
Takagi et al., Am planntrais iris, 2013
● Sgeadachadh ceart: A 'measgachadh tha bulks le 30 + 30 gu 200 + 200 neach gus fuaim Cùl-fhiosrachadh a lughdachadh; MutArtication KeyalyMous Forect Prodect Prodect Prestrantication.
● Mion-sgrùdadh coileanta: A 'gabhail a-steach tagraiche geam in-aimhreit, a' gabhail a-steach nr, Eilbheis, Kegg, Cog, KOG, msaa.
● Ùine tionndaidh nas luaithe: Fìonadh Gàrraidh luath taobh a-staigh 45 latha-obrach.
● eòlas farsaing: Tha BMK air cur a-steach mìltean de fhrith-bhiteachaidh, a 'còmhdach gnèithean eadar-mheasgte mar bhàrr, toraidhean uisge, flùraichean, flùraichean, msaa.
Sònrachaidhean Seirbheis
Àireamh-sluaigh:
A 'sgaoileadh uaislean phàrantan le phonotypes an aghaidh.
me F2 Progenny, Backcrossing (BC), Ath-ghairm air a 'loidhne inbred (ril)
Measgachadh amar
Airson comharran càileachdail: 30 gu 50 neach fa leth (20 aig a 'char as lugha) / bulk
Airson tratis caochlaideach: Top no 5% gu 10% daoine le fìor mhòr-chunathan san t-sluagh gu lèir (30 + 30) aig a 'char as lugha.
Doimhneachd a 'moladh a thathar a' moladh
Co-dhiù 20x / pàrant is 1x / clann fa leth (me airson clann measgachadh de dh 'aois 30 + 30, bidh an doimhneachd neach fa leth 30 + 30 ann an 1x gach mòr)
Mion-sgrùdaidhean bioteficforications
● neach-obrach fìor ag iarraidh
● giollachd dàta
● SNP / A 'GABHAIL A' GABHAIL A-STEACH
● Roinnean Tagraiche Tagraiche
● Cuir a-steach tagraiche air tagraiche
Riatanasan agus lìbhrigeadh sampaill
Riatanasan sampaill:
Nucleolides:
| sampall gdna | Sampall clò |
| Sluagh: ≥30 ng / μl | Lusan: 1-2 g |
| Suim: ≥2 μg (Holumn ≥15 μl) | Beathaichean: 0.5-1 g |
| Purity: OD260 / 280 = 1.6-2.5 | Fuil slàn: 1.5 ml |
Sruth obair seirbheis
Dealbhadh deuchainn
Lìbhrigeadh sampaill
Rna a-mach
Togail leabharlainn
SequeNrings
Mion-sgrùdadh dàta
Seirbheisean às deidh a reic
Bunait Mion-sgrùdaidh 1.Association air astar Euclidean (Ed) gus sgìre tagraiche a chomharrachadh. Anns a 'cheist a leanas
X-Axis: an àireamh cromosome; Tha gach dota a 'riochdachadh luach ed SNP. Tha an loidhne dhubh a 'freagairt ri luach Ed iomchaidh. Tha luach ED nas àirde a 'nochdadh comann nas cudromaiche eadar an làrach agus an phonotype. Tha loidhne dash dearga a 'riochdachadh cruinneachadh cudromach.
Sgrùdadh 2. Sgrùdadh sam bith gun chlàr-amais sam bith
X-Axis: an àireamh cromosome; Tha gach dota a 'riochdachadh luach clàr-amais SNP. Tha an loidhne dhubh na sheasamh airson luach antex a tha iomchaidh. Is e as motha as motha, as motha a tha an comann.
Cùis BMK
Am prìomh-bhuaidh cliùiteach sùbailte locus sùbailte fnl7.1 a 'toirt a-steach pròtain sgarfain fadalach co-cheangailte ri fad amhach mheasan ann an cucumber
Foillsichte: Iris bith-eòlas planntrais, 2020
Ro-innleachd SequeNroming:
Pàrantan (Jin5-508, YN): Genome làn rannsaich airson 34 × agus 20 ×.
Amars DNA (50 de accod-gended agus 50 goirid): Ag innse aon-neach airson 61 × agus 52 ×
Prìomh thoraidhean
Anns an sgrùdadh seo, chaidh àireamh-sluaigh na litreachaidh (F2 agus F2: 3) a ghineadh le bhith a 'dol tarsainn loidhne Cucumber awt Jin5-508 agus yn sa ghort. Chaidh dà ionad DNA a thogail le 50 neach amhach amhach fad-ùine agus 50 neach amhach a-muigh. Chaidh am prìomh bhuaidh a chomharrachadh air chr07 le sgrùdadh BSA agus mapadh QTL traidiseanta. Chaidh an sgìre an tagraiche a lughdachadh le àrdachadh mòr agus deuchainnean transgenic a 'ghàrradh, a nochd dà ghine gus smachd a chumail air Fad amhach, CSFNL7.1. A bharrachd air an sin, chaidh Polymorphism ann an CSFNL7.1 sgìre a 'ChSfnl7.1 a bhith co-cheangailte ri faireachdainn co-fhreagarrach. Mhol mion-sgrùdadh phylogentice gu bheil FNL7.1 Lous glè choltach a bhith air a thùsadh às na h-Innseachan.
 Qtl-mapaidh ann am mion-sgrùdadh BSA gus sgìre tagraiche a chomharrachadh co-cheangailte ri Fad amhach Cucumber |  Pròifilean loidsidh de qtl fad amhach cucumber air an comharrachadh air chr07 |
Xu, x., et al. "Tha am prìomh bhuaidh-starra lrative locus sùbailte fnl7.1 a 'toirt a-steach pròtain bacadh fadalach co-cheangailte ri fad amhach mheasan ann an cucumber." Bith-aontachadh planntrais 18.7 (2020).
