● le dà roghainn a dh 'fhaodadh a bhith a' taghadh bho bhith a 'dearbhadh a rèir an ìre a tha thu ag iarraidh iomlanachd eanchainn.
● Dreach REVE REVE RIVE RIVE: SEQUIRMHEADH GUN CHUNNTAS LE ILBUSQ ILVUSQ PE150.
● coileanta 0 beàrn genome.
● Sgrìobhadh fad-stiùiridh air promethens Neusopere 48 no Pacbio Revio airson Seanadh Genome.
● Sgòrachadh goirid air Eillumina novaseq airson ceartachadh Cionaideach agus ceartachadh Mearachd (Nanoipore) no gus dreachd de fhìor fhìor a ghineadh.
●Genome Zero-beàrn Gaused: Tha seo mar thoradh air amalachadh de bhith a 'sgeadachadh mì-chleasachd le sequemancing fada (Nanoicere no Pacbio).
●Cuir crìoch air sruth-obrach bith-eòlasach:Tha seo a 'toirt a-steach co-chruinneachadh genome agus ro-innse ioma-fheudachd ioma-ghnèitheach, nonotation Gene Gnìomhach, agus Lèirmheas Cenome leithid cuilbheart Circos.
●Eòlas farsaing: Le còrr air 20,000 genocmes microbial a 'toirt a-steach deichead de eòlas, Sgioba Mileachadh air leth sgileil, susbaint coileanta, agus taic sàr-reic sàr-reic.
●Taic às dèidh reic:Tha ar dealas a 'leudachadh taobh a-muigh crìochnachaidh pròiseact le ùine seirbheis 3-mìosan. Aig an àm seo, tha sinn a 'tabhann ceuman air a' phròiseact, a 'cur-neartachadh taic, agus Q & Q & Seiseanan gus dèiligeadh ri ceistean sam bith co-cheangailte ris na toraidhean.
●Ioma ro-innleachdan beaga rim faighinn:Airson diofar amasan rannsachaidh agus riatanasan iomlan iomlanachd.
Seirbheis | Ro-innleachd SequeNroming |
Dreach Genome | Illumina pe150 100x |
0 beàrn genome | Nanopore 100x + illumina pe150 100x Or Pacbio hifi 30x + illumina pe150 100x (roghainneil) |
Dùmhlachd (ng / μl) | Suim iomlan (μg) | Tomhas-lìonaidh (μl) | Od260 / 280 | Od260 / 230 | |
Pacbio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
Nanopore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
Illumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Bacteria: ≥3.5x1010 ceallan
A 'toirt a-steach an sgrùdadh a leanas:
● A 'senethering smachd càileachd dàta
● Co-chruinneachadh Genome
● Mion-sgrùdadh Comprental Genome: Ro-aithris air CDS agus iomadachd dealasach
● Tha notaichean gnìomh le ioma-dàta coitcheann (falbh, kegg, msaa) agus stòran-dàta adhartach (cairt, VFDB, msaa)
● Spèiseachas Genome
Bidh sinn a 'toirt seachad an genome ann an cruth Falt ruigsinneach agus an neach-brathaidh daocan (GFF).
An notaichean gine - falbh
An notaichean gine - Carbohydrates Cazy
Spèradhachd Genome - Cuilbheart Circos
Dèan sgrùdadh air na h-adhartasan a tha air an comasachadh le seirbheisean seanadh genome Genter ann am BMKgene tro chruinneachadh de fhoillseachaidhean.
Dai, w. et al. (2023) 'A' lorg bacateynes ealands F18-22 mar bacterium fèill mhòr agus nobhail airson làimhseachadh colcis ulacrative bhon cholon daonna fallain ',Iris Eadar-nàiseanta Saidheansan Molecular, 24 (19), td. 14669. DOI: 10.3390 / IJMS241914669 / S1.
Kang, Q. et al. (2021) 'Mirabils Dìon Dìon Mirabilis a tha a' giùlan blaoxa-1 agus Blandm-1 bho fhiath-bheatha ann an Sìona: A 'meudachadh cunnart slàinte poblach',Numolachd Amalachaidh, 16 (6), pp. 798-8-8-8-809. doi: 10.1111 / 1749-4877.12510.
Wang, tt et al. (2017) 'coileanta Sequence de Endophyte Backeophyte Backelus Klbmp 4941 a' nochdadh a chuideam brosnachaidh fàis agus gintinn a tha a 'nochdadh a chuid planntachadh agus stèidh gintinn airson fulangas salainn',Iris Biotechnogy, 260, pp. 38-41. doi: 10.1016 / j.jbiotec.2017.09.001.
Wang, x. et al. (2021) 'Co-fhillteachd ioma-mhac-samhail de phlasan Klebsiella Mediate sgaoileadh gintinn antimicrobial',Crìochan ann am microbiology, 12, td. 754931. Doi: 10.3389 / fmicb.2021.754931 / Bibtex.