● Àrd-ùrlar SequeNome: Pacbio Revio
● Modh Sequencing: CCS (HiFi A 'leughadh)
● leudachadh air sgìre targaid air a leantainn le tandem a 'ceangal amplicsons ro ro-ullachadh Leabharlann Hifi SMRE
●Rùn tacsonumic nas àirde: T.scrion geàrr-amplical,A 'comasachadh ìrean seòrsachaidh Otu Àrd-ìre aig ìre na gnèithean.
●Callachadh bonn fìor cheart: Sgemencing Modh Pacbio CCS (tha hifi a 'leughadh).
●Isònt-Free: Comharrachadh luath air co-dhèanamh microbial ann an sampaill àrainneachd.
●Gu farsaing buntainneach: Sgrùdaidhean Coimhearsnachd Miceobial Dianse.
●Mion-sgrùdadh biochdachais coileanta: Am pasgan QIMime2 as ùire (sealladh cainnteach ann an eag-eòlas microbial) le mion-sgrùdaidhean eadar-mheasgte a thaobh stòr-dàta, nonation, OTU / ASV.
●Eòlas farsaing: Le mìltean de phròiseactan sgrìobhaidh Amplical air a dhèanamh gach bliadhna, tha BMKgene a 'toirt a-steach deichead de eòlas, deagh sgioba sgileil, susbaint coileanta, agus taic sàr-reic sàr-reic.
Leabharlann | Ro-innleachd SequeNroming | Dàta air a mholadh |
Ampliceon | Pacbio Revio | 10/30/30/50 k tagaichean (CCS) |
Dùmhlachd (ng / μl) | Suim iomlan (μg) | Tomhas-lìonaidh (μl) |
≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
Reothadh na samples ann an leaghan nitrogen airson 3-4 uair a thìde agus stòradh ann an ceum sìos gu Linerogen no -80 gu glèidheadh fad-ùine. Tha feum air sampall de shuidheachadh le deigh tioram.
A 'toirt a-steach an sgrùdadh a leanas:
● Smachd càileachd dàta amh
● cruinneachadh OTU / de-fuaim (ASV)
● OTU anotoution
● Mion-sgrùdadh Alphationsity: Ioma-chlàr-amais, nam measg Shannon, Simpson agus Ace.
● Mion-sgrùdadh Iomadachd Beta
● Mion-sgrùdadh Eadar-bhuidheann
● Mion-sgrùdadh Ath-cheangal: eadar factaran àrainneachd agus a-mach co-sgrìobhadh agus iomadachd
● 16s ro-innse gine gnìomh
Hisktorgram de sgaoileadh tacsonomic
Craobh Pylogenetic Sgaoilte Coimhearsnachd
Mion-sgrùdadh Alpha iomadachd: Ace
Mion-sgrùdadh Beta: Pua
Mion-sgrùdadh Eadar-mheadhanachaidh: Innò
Dèan sgrùdadh air na h-adhartasan a tha air an comasachadh Seirbheisean Sgiobachd BMKgene le Pacbio tro chruinneachadh foillseachaidhean air an leigheas.
GAA, X. agus Wang, H. (2023) 'Mion-sgrùdadh coimeasach de phrìosanaichean bactery (thageren vs feurach air caoraich merino alpine', corrach-seachdain, 9 ( 1), td, td. 16. DOI: 10.3390 / Fermintation9010016 / S1.
Li, s. et al. (2023) 'A' glacadh a 'chùis dhorchabachd dorcha ann an ùirean fàsach agus mion-sgrùdadh High-Rianachd', biofilms NPJALS agus microbiomes 2023 9: 1), PP. 1-14. doi: 10.1038 / S41522-023-0043439-8.
Mu, l. et al. (2022) 'Buaidh salainn searbhag reamhar air feartan fichead, iomadachd bacterial agus cruithneachd a' Chaille ', Iris Saidheans, 102 (4), PP. 1475- 1487. doi: 10.1002 / JSF.114822.
Yang, J. et al. (2023) 'An eadar-obrachadh eadar bhiomarkers cuideam oxibative agus meanbh-leasaiche air an t-buaidhean atioxidat de erchus Brachyotus dc. ann an cuideam oxidaigeach Inxazolone inxazolone ann an Zebrafish inbheach ', Antioxidagets 2023, Vol. 12, Duilleag 192, 12 (1), td. 192. DOI: 10.3390 / Antiox19192.