Seicheamh iomlán bisuilfíte genome (WGBS)
Seasann Seicheamhú Géanóm Iomlán Bisulfite (WGBS) mar mhodheolaíocht chaighdeán ór le haghaidh mion-iniúchadh meitilation DNA, go sonrach an cúigiú suíomh sa chitosín (5-mC), rialtóir ríthábhachtach ar léiriú géine agus gníomhaíocht cheallacha. Is éard atá i gceist leis an bprionsabal is bun leis an WGBS ná cóireáil déshulfíte, rud a fhágann go n-iompófar cíteóisíní neamh-mheitiolaithe go uracil (C go U), agus ag fágáil cítoisín meitiolaithe gan athrú. Tairgeann an teicníocht seo taifeach aon-bhonn, rud a ligeann do thaighdeoirí imscrúdú cuimsitheach a dhéanamh ar an meitilome agus patrúin mhínormálta a bhaineann le coinníollacha éagsúla a aimsiú, go háirithe ailse. Trí úsáid a bhaint as WGBS, is féidir le heolaithe léargais thar na bearta a fháil ar thírdhreacha meitilation ar fud an ghéanóim, ag soláthar tuiscint níos fearr ar na meicníochtaí eipigéiniteacha atá mar bhunús le próisis agus galair bhitheolaíocha éagsúla.
Gnéithe Seirbhíse
● Tá géanóm tagartha ag teastáil.
● Cuirtear DNA Lambda leis chun monatóireacht a dhéanamh ar éifeachtúlacht chomhshó bisulfite.
● Seicheamhú ar Illumina NovaSeq.
Buntáistí Seirbhíse
●Caighdeán Óir do Thaighde Meitilation DNA: Tá cruinneas ard agus in-atáirgtheacht maith ag an teicneolaíocht próiseála comhshó methylation aibí seo.
●Clúdach Leathan agus Taifeach Aon-bhonn:suíomhanna meitilithe a bhrath ag leibhéal an ghéanóim ar fad.
●Ardán Críochnaithe:seirbhís ilfhreastail den scoth a sholáthar ó phróiseáil samplaí, tógáil leabharlainne, seicheamhú go hanailís bhithfhaisnéisíochta.
●Saineolas Fairsing: le tionscadail seicheamhaithe WGBS críochnaithe go rathúil thar raon éagsúil speiceas, tugann BMKGENE breis agus deich mbliana de thaithí, foireann anailíse ardoilte, ábhar cuimsitheach, agus tacaíocht iar-díolacháin den scoth.
●Féidearthacht a bheith páirteach in Anailís Transcriptomics: ag ligean d'anailís chomhtháite ar WGBS le sonraí omics eile mar RNA-seq.
Sonraíochtaí Samplacha
| Leabharlann | Straitéis Seicheamhaithe | Aschur sonraí molta | Rialú cáilíochta |
| Bisulfite cóireáilte | Illumina PE150 | 30x doimhneacht | Q30 ≥ 85% Comhshó déshulfíte > 99% |
Riachtanais Shamplacha
| Tiúchan (ng/µL) | Méid iomlán (µg) | Ceanglais bhreise | |
| DNA genomic | ≥5 | ≥ 400 ng | Díghrádú nó éilliú teoranta |
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Seachadadh samplach
eastóscadh DNA
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís sonraí
Seachadadh sonraí
Áirítear leis an anailís seo a leanas:
● Rialú cáilíochta seicheamhaithe amh;
● Mapáil go géanóm tagartha;
● Bunanna meitile 5mC a bhrath;
● Anailís ar dháileadh agus anótáil meitilation;
● Anailís ar Réigiúin Mheitilithe Difreálacha (DMRanna);
● Nótáil fheidhmiúil ar ghéinte a bhaineann le DMRanna.
Brath meitilation 5mC: cineálacha suíomhanna meitiolaithe
Léarscáil meitile. Dáileadh genome-leathan methylation 5mC
Anótáil ar réigiúin an-mheitilaithe
Réigiúin Mheitilithe Difreálacha: géinte gaolmhara
Réigiúin Mheitilithe Difreálacha: anótáil ar ghéinte gaolmhara (Ontology Géine)
Déan iniúchadh ar dhul chun cinn taighde arna éascú ag seirbhísí seicheamhaithe géanóm bisulfite iomlán BMKGene trí bhailiúchán coimeádaithe foilseachán.
Fan, Y. et al. (2020) ‘Anailís ar phróifílí meitilaithe DNA le linn fhorbairt matán cnámharlaigh chaoirigh ag baint úsáide as seicheamhú déshulfíte lán-ghéineamaí’,Géanómaíocht BMC, 21(1), lgh 1–15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) 'Suaitheadh meitilation aigéid dhéocsairibonúicléach núíosacha in oibrithe a nochtar do chlóiríd vinile',Tocsaineolaíocht agus Sláinte Thionsclaíoch, 38(7), lgh. 377–388. do: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) 'Caidrimh idir meitilation genome, leibhéil RNAanna neamhchódaithe, mRNAnna agus meitibilítí i dtorthaí trátaí aibiú',An Iris Plandaí, 103(3), lgh. 980–994. do: 10.1111/TPJ.14778.
