Seicheamhú Bisulfite Ionadaíochta Laghdaithe (RRBS)
Tá seicheamhú bisulfite laghdaithe (RRBS) tagtha chun cinn mar rogha eile éifeachtach ó thaobh costais agus éifeachtúil ar sheicheamhú bisulfite géanóm iomlán (WGBS) i dtaighde meitile DNA. Cé go soláthraíonn WGBS léargais chuimsitheacha trí scrúdú a dhéanamh ar an ngéanóm iomlán ag réiteach bonn aonair, is féidir leis an gcostas ard a bheith ina fhachtóir teorannaithe. Déanann RRBanna an dúshlán seo a mhaolú go straitéiseach trí anailís a dhéanamh go roghnach ar chuid ionadaíoch den ghéanóm. Braitheann an mhodheolaíocht seo ar shaibhriú na réigiún CpG atá saibhir ó thaobh an oileáin de ag scoilteacht MSPI agus ina dhiaidh sin roghnú méide blúirí 200-500/600 bps. Dá bhrí sin, ní dhéantar ach na réigiúin atá gar do oileáin CpG a chur in ord, agus tá na daoine a bhfuil oileáin CPG i bhfad i gcéin eisiata ón anailís. Ceadaíonn an próiseas seo, in éineacht le seicheamhú bisulfite, go mbraitear meitiliú DNA ardtaifigh, agus díríonn an cur chuige seicheamhaithe, PE150, go sonrach ar chríoch na n-iatán seachas ar an lár, ag méadú éifeachtúlacht próifíliú meitile. Is uirlis luachmhar é an RRBS a chuireann ar a gcumas taighde meitile-éifeachtach ó thaobh costais de agus eolas ar mheicníochtaí eipidéimeacha a chur chun cinn.
Gnéithe seirbhíse
● Éilíonn sé géanóm tagartha.
● Úsáidtear DNA Lambda chun monatóireacht a dhéanamh ar éifeachtúlacht tiontaithe bisulfite.
● Déantar monatóireacht freisin ar éifeachtúlacht díleá MSPI.
● Díleá dúbailte einsím le haghaidh samplaí plandaí.
● Seicheamhú ar Illumina Novaseq.
Buntáistí Seirbhíse
●Rogha eile éifeachtach ó thaobh costais agus éifeachtúil seachas WGBS: An anailís a dhéanamh ar an anailís a dhéanamh ar chostas níos ísle agus le riachtanais samplacha níos ísle.
●Ardán iomlán:Seirbhís den scoth a sholáthar ó phróiseáil samplach, tógáil leabharlainne, agus seicheamhú go hanailís bithfhaisnéisíochta.
●Saineolas fairsing: Le tionscadail seicheamhaithe RRBS críochnaithe go rathúil ar fud raon éagsúil speiceas, tugann BMKGene breis agus deich mbliana de thaithí, foireann anailíse ardoilte, ábhar cuimsitheach, agus tacaíocht iar-dhíolacháin den scoth.
Sonraíochtaí seirbhíse
| Leabharlann | Straitéis seicheamhaithe | Aschur sonraí molta | Rialú cáilíochta |
| MSPI LEABHARLANN DÍOSPÓIREACHTA AGUS BISULFITE Cóireáil | Illumina PE150 | 8 GB | C30 ≥ 85% Comhshó Bisulfite> 99% Éifeachtúlacht Gearrtha MSPI> 95% |
Riachtanais samplacha
| Tiúchan (Ng/µl) | Méid iomlán (µg) |
| |
| DNA géanómach | ≥ 30 | ≥ 1 | Díghrádú nó éilliú teoranta |
Sreabhadh oibre seirbhíse
Seachadadh samplach
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís ar shonraí
Seirbhísí tar éis díol
Áirítear leis an anailís seo a leanas:
● Rialú cáilíochta seicheamhaithe amh;
● Mapáil chun tagairt a dhéanamh do ghéanóm;
● Bunáiteanna meitilithe 5mc agus sainaithint móitíf a bhrath;
● Anailís ar dháileadh meitile agus comparáid samplach;
● Anailís ar réigiúin atá meitilithe go héagsúil (DMRanna);
● Nótaí feidhme na ngéinte a bhaineann le DMRanna.
Rialú Cáilíochta: Éifeachtúlacht díleá (i mapáil géanóm)
Rialú Cáilíochta: Comhshó Bisulfite (i mBaint Eolas Meitile)
Léarscáil mheitile: 5mc meitiliú dáileadh ar fud an ghéanóim
Comparáid Samplach: Anailís Príomh -Chomhpháirt
Anailís ar réigiúin atá meitilithe go héagsúil (DMRS): Heatmap
Déan iniúchadh ar dhul chun cinn an taighde a éascaíonn seirbhísí seicheamhaithe bisulfite Genome BMKGENE trí bhailiúchán foilseachán coimeádaithe.
Li, Z. et al. .PNAS Nexus, 1 (4). doi: 10.1093/pnasnexus/pgac179.
Tian, H. et al. .Eorpach Journal of Clinical Investigation, 53 (11), lch. E14055. doi: 10.1111/eci.14055.
Wu, Y. et al. .Journal of Infigocrinological Investigation, 45 (12), lgh. 2365–2376. doi: 10.1007/S40618-022-01878-4.
