-
Géanóm Chomparáideach
Baineann géanóm chomparáideach le scrúdú agus comparáid a dhéanamh ar sheichimh agus struchtúir iomlána an ghéanóim i measc speiceas éagsúla. Féachann an réimse seo le héabhlóid speiceas a nochtadh, feidhmeanna géine a dhíchódú, agus na meicníochtaí rialaithe géiniteacha a shoiléiriú trí struchtúir agus eilimintí seichimh chaomhnaithe nó dhibhéirseacha trasna orgánaigh éagsúla a shainaithint. Cuimsíonn staidéar cuimsitheach comparáideach géanóm anailísí amhail teaghlaigh géine, forbairt éabhlóideach, teagmhais dúblála géanóm uile, agus tionchar brúnna roghnacha.
-
Géineolaíocht Éabhlóideach
Bunaítear ardán anailíse géiniteach daonra agus éabhlóideach ar bhonn na taithí ollmhór atá carnaithe laistigh d'fhoireann T&F BMK le blianta anuas. Is uirlis í atá éasca le húsáid go háirithe do thaighdeoirí nach bhfuil an-mhór acu i mbithfhaisnéisíocht. Cumasaíonn an t-ardán seo anailís bhunúsach a bhaineann le géineolaíocht éabhlóideach bhunúsach lena n-áirítear tógáil crann fíginéiteach, anailís éagothroime naisc, measúnú ar éagsúlacht ghéiniteach, anailís scuabtha roghnach, anailís gaolta, PCA, anailís ar struchtúr daonra, etc.
-
Tionól Géanóim Bunaithe Hi-C
Is modh é Hi-C atá deartha chun cumraíocht chromosóim a ghabháil trí idirghníomhaíochtaí fiafraithe bunaithe ar ghaireacht agus seicheamhú ard-thréchuir a chomhcheangal. Creidtear go bhfuil comhghaol diúltach idir déine na n-idirghníomhaíochtaí seo agus achar fisiceach ar chrómasóim. Dá bhrí sin, úsáidtear sonraí Hi-C chun cnuasú, ordú agus treoshuíomh seichimh cóimeáilte i ndréacht-ghéanóm a threorú agus iad siúd a ancaire ar líon áirithe crómasóim. Tugann an teicneolaíocht seo cumhacht do thionól géanóm ar leibhéal crómasóim in éagmais léarscáil ghéiniteach daonra-bhunaithe. Teastaíonn Hi-C ó gach géanóm.
-
Seicheamhú Géanóim Gléasra/Ainmhithe De Novo
De Novotagraíonn seicheamhú do thógáil géanóm iomlán speicis ag baint úsáide as teicneolaíochtaí seicheamhaithe in éagmais géanóm tagartha. Chuir tabhairt isteach agus glacadh forleathan seicheamhú tríú glúin, ina bhfuil léimh níos faide, go mór le cóimeáil ghéanóim tríd an bhforluí idir léith a mhéadú. Tá an feabhsú seo thar a bheith tábhachtach nuair atáthar ag déileáil le géanóim dhúshlánacha, mar iad siúd a thaispeánann ard-heitrisigeachas, cóimheas ard de réigiúin athchleachtach, polaplóidigh, agus réigiúin le heilimintí athchleachtach, inneachar neamhghnácha GC, nó ard-chastacht nach mbíonn comhchruinnithe go dona go hiondúil ag baint úsáide as seicheamh gearrléamh. ina aonar.
Soláthraíonn ár réiteach aon-stad seirbhísí seicheamhaithe comhtháite agus anailís bhithfhaisnéiseach a sheachadann genome de novo ardchaighdeáin. Soláthraíonn suirbhé genome tosaigh le Illumina meastacháin ar mhéid agus ar chastacht an ghéanóim, agus úsáidtear an fhaisnéis seo chun an chéad chéim eile den seicheamhú fadléithe a threorú le PacBio HiFi, agus ina dhiaidh sinde novocóimeáil contigs. Trí úsáid a bhaint as cóimeáil HiC ina dhiaidh sin is féidir na contigí a ancaire don ghéanóm, ag fáil cóimeála ar leibhéal na crómasóim. Ar deireadh, déantar an géanóm a anótáil trí thuar géine agus trí ghéinte sainráite a sheicheamhú, ag dul i muinín tras-scríbhinní le léann gearr agus fada.
-
Seicheamhú Exome Iomlán Daonna
Aithnítear go forleathan go bhfuil seicheamhú exome Iomlán Daonna (HWES) ina chur chuige seicheamhaithe cost-éifeachtach agus cumhachtach chun sócháin is cúis le galair a aimsiú. In ainneoin nach bhfuil ach thart ar 1.7% den genome iomlán ann, tá ról ríthábhachtach ag exons trí phróifíl na bhfeidhmeanna próitéine iomlána a léiriú go díreach. Go háirithe, sa ghéanóm daonna, léirítear breis agus 85% de na sócháin a bhaineann le galair laistigh de na réigiúin códaithe próitéine. Tairgeann BMKGENE seirbhís sheicheamhaithe iomlán exome daonna cuimsitheach agus solúbtha le dhá straitéis gabhála exon éagsúla ar fáil chun spriocanna taighde éagsúla a bhaint amach.
-
Seicheamhú Mír Mhéadaithe Sain-Locus (SLAF-Seq)
Is céim bhunúsach í géinitíopáil ard-thréchuir, go háirithe ar dhaonraí ar scála mór, i staidéir ar chomhlachas géiniteach agus cuireann sí bonn géiniteach ar fáil d’fhionnachtain géinte feidhme, d’anailís éabhlóideach, etc.Seicheamhú Géanóim Léirithe Laghdaithe (RRGS)úsáidtear go minic sna staidéir seo chun costas seicheamhaithe in aghaidh an tsampla a íoslaghdú agus éifeachtúlacht réasúnta a choinneáil i bhfionnachtain marcóra géiniteach. Baineann RRGS é seo amach trí DNA a dhíleá le heinsímí srianta agus díriú ar raon méide blúirí ar leith, rud a fhágann nach seicheamh ach codán den ghéanóm. I measc na modheolaíochtaí éagsúla RRGS, is cur chuige inoiriúnaithe agus ardcháilíochta é Seicheamhú Ilchodach Amplified Specific-Locus (SLAF). Déanann an modh seo, arna fhorbairt go neamhspleách ag BMKGene, uasmhéadú ar an einsím srianta atá leagtha síos do gach tionscadal. Cinntíonn sé seo giniúint líon suntasach clibeanna SLAF (réigiúin 400-500 bps den ghéanóm á seicheamhú) a dháiltear go haonfhoirmeach ar fud an ghéanóm agus ag seachaint go héifeachtach réigiúin athchleachtacha, rud a chinntíonn an fionnachtain marcóra géiniteach is fearr.
-
Leabharlanna réamhdhéanta Illumina
Tá teicneolaíocht seicheamhaithe Illumina, atá bunaithe ar Seicheamhú le Sintéis (SBS), ina nuálaíocht NGS a bhfuil glactha go domhanda léi, atá freagrach as breis agus 90% de shonraí seicheamhaithe an domhain a ghiniúint. Is éard atá i gceist le prionsabal SBS Críochnaitheoirí inchúlaithe a bhfuil lipéad fluaraiseacha orthu a íomháú de réir mar a chuirtear gach dNTP leis, agus ina dhiaidh sin scoilte chun an chéad bhonn eile a ionchorprú. Agus na ceithre dNTP inchúlaithe faoi cheangal Críochnaitheoir i láthair i ngach timthriall seicheamhaithe, laghdaítear an claonadh ionchorpraithe le hiomaíocht nádúrtha. Tacaíonn an teicneolaíocht ilúsáideach seo le leabharlanna aon léite agus péireáilte araon, ag freastal ar raon feidhmeanna géanómaíochta. Cuireann cumais ard-tréchur agus beachtas seicheamh Illumina é mar chloch choirnéil i dtaighde géanómaíochta, rud a chuireann ar chumas na n-eolaithe casta na géanóim a réiteach le sonraí agus le héifeachtúlacht nach ionann iad.
Cuireann ár seirbhís seicheamhaithe leabharlainne réamhdhéanta ar chumas custaiméirí leabharlanna seicheamhaithe a ullmhú ó fhoinsí éagsúla (mRNA, genome iomlán, amplicon, leabharlanna 10x, i measc nithe eile). Ina dhiaidh sin, is féidir na leabharlanna seo a sheoladh chuig ár n-ionaid seicheamhaithe le haghaidh rialú cáilíochta agus seicheamhú ar ardáin Illumina.
