Seicheamhú mRNA bunaithe ar thagairt
Bheith
● Gabháil mRNA polai roimh ullmhú na leabharlainne
● Neamhspleách ar aon ghéanóm tagartha: Bunaithe ar thionól de novo tras-scríbhinní, ag giniúint liosta de na unigenes atá anótáilte le bunachair shonraí iolracha (NR, Eilvéis-Prot, COG, KOG, EGGNOG, PFAM, GO, KEGG)
● Anailís bhithfhaisnéiseach chuimsitheach ar léiriú géine agus ar struchtúr athscríbhinne
Buntáistí Seirbhíse
●Saineolas fairsing. D'éirigh linn níos mó ná 100,000 tionscadal mRNA-seq a dhúnadh i réimsí taighde éagsúla.
●Rialú cáilíochta dian: Cuirimid príomhphointí rialaithe i bhfeidhm i ngach céim, ó ullmhúchán samplach agus leabharlainne go seicheamhú agus bithfhaisnéisíocht. Cinntíonn an mhonatóireacht chúramach seo go seachadtar torthaí ardchaighdeáin go comhsheasmhach.
● Nótaí cuimsitheach.
●Tacaíocht iar-dhíolacháin. Le linn an ama seo, tairgimid obair leantach tionscadail, cúnamh fabhtcheartaithe, agus seisiúin Q & A chun aghaidh a thabhairt ar aon cheisteanna a bhaineann leis na torthaí.
Riachtanais agus seachadadh samplacha
| Leabharlann | Straitéis seicheamhaithe | Sonraí Molta | Rialú cáilíochta |
| Polai a saibhrithe | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 GB | C30≥85% |
Riachtanais Samplacha:
Nucleotides:
| Conc. (Ng/μl) | Méid (μg) | Íona | Ionracas |
| ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Teoranta nó gan aon éilliú próitéine nó DNA a thaispeántar ar ghlóthach. | Do phlandaí: Rin≥4.0; Le haghaidh ainmhithe: Rin≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; ingearchló teoranta nó gan aon ingearchló bunlíne |
● Plandaí:
Fréamh, gas nó peitil: 450 mg
Duilleog nó síol: 300 mg
Torthaí: 1.2 g
● Ainmhí:
Croí nó stéig: 300 mg
Viscera nó inchinn: 240 mg
Muscle: 450 mg
Cnámha, gruaig nó craiceann: 1g
● Arthropods:
Feithidí: 6g
Crustacea: 300 mg
● Fuil iomlán: 1 feadán
● Cealla: 106 cealla
Seachadadh samplach molta
Coimeádán: 2 feadán lártheifneoir ml (ní mholtar scragall stáin)
Lipéadú samplach: Grúpa+macasamhlú m.sh. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Loingsiú:
1. Tirim-Ice: Ní mór samplaí a phacáil i málaí agus iad a adhlacadh i oighear tirim.
2. Feadáin RNAStable: Is féidir samplaí RNA a thriomú i bhfeadán cobhsaíochta RNA (m.sh. RNAStable®) agus iad a sheoladh i dteocht an tseomra.
Sreabhadh oibre seirbhíse
Dearadh turgnamh
Seachadadh samplach
Eastóscadh RNA
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís ar shonraí
Seirbhísí tar éis díol
Bithfhaisnéisíocht
Tionól trascríofa agus roghnú unigene
Nóta unigene
Comhghaol agus measúnú samplach ar mhacasamhla bitheolaíocha
Géinte a chuirtear in iúl go héagsúil (DEGS)
Nóta feidhmiúil DEGS
Saibhriú Feidhmeach DEGanna
Déan iniúchadh ar na dul chun cinn a éascaíonn seirbhísí seicheamhaithe Eukaryotic NGS BMKGENE NGS trí bhailiúchán foilseachán coimeádaithe.
Shen, F. et al. . doi: 10.1016/j.ygeno.2020.01.026.
Zhang, C. et al. . 212763. Doi: 10.3389/fpls.2016.01425/bibtex.
Zhu, C. et al. . doi: 10.1371/journal.pone.0171966.
Zou, L. et al. . doi: 10.1186/s12870-021-03274-1/figiúirí/9.
