Seicheamhú seicheamhaithe mRNA fad iomlán
Bheith
● Poly-A mRNA a ghabháil agus sintéis cDNA agus ullmhúchán leabharlainne ina dhiaidh sin
● Seicheamhú na n-athscríbhinní fad fad
● Anailís bhithfhaisnéiseach bunaithe ar ailíniú le géanóm tagartha
● Ní hamháin go n-áirítear le hanailís bhithfhaisnéiseach léiriú ag leibhéal géine agus isoform ach anailís ar lncRNA, fusions géine, polai-adenylation agus struchtúr géine
Buntáistí Seirbhíse
●Cainníochtú an abairt ag an leibhéal isoform: Anailís léirithe mhionsonraithe agus chruinn a chumasú, athrú a nochtadh a d'fhéadfaí a chumhdach agus anailís á déanamh ar an léiriú géine iomlán
●Éilimh laghdaithe sonraí:I gcomparáid le seicheamhú na chéad ghlúine eile (NGS), léiríonn seicheamhú nanopore riachtanais sonraí níos ísle, rud a cheadaíonn leibhéil choibhéiseacha de chainníochtú géine le sonraí níos lú.
●Cruinneas níos airde cainníochtaithe léirithe: ag leibhéal géine agus isoform araon
●Faisnéis bhreise athscríofa a aithint: polyadenylation malartach, géinte comhleá agus lcnRNA agus a ngéinte sprice
●Saineolas fairsing.
●Tacaíocht iar-dhíolacháin. Le linn an ama seo, tairgimid obair leantach tionscadail, cúnamh fabhtcheartaithe, agus seisiúin Q & A chun aghaidh a thabhairt ar aon cheisteanna a bhaineann leis na torthaí.
Riachtanais agus seachadadh samplacha
| Leabharlann | Straitéis seicheamhaithe | Sonraí Molta | Rialú cáilíochta |
| Polai a saibhrithe | Illumina PE150 | 6/12 GB | Meánscór Cáilíochta: C10 |
Riachtanais Samplacha:
Nucleotides:
| Conc. (Ng/μl) | Méid (μg) | Íona | Ionracas |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Teoranta nó gan aon éilliú próitéine nó DNA a thaispeántar ar ghlóthach. | Do phlandaí: Rin≥7.0; Le haghaidh ainmhithe: Rin≥7.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; ingearchló teoranta nó gan aon ingearchló bunlíne |
● Plandaí:
Fréamh, gas nó peitil: 450 mg
Duilleog nó síol: 300 mg
Torthaí: 1.2 g
● Ainmhí:
Croí nó stéig: 300 mg
Viscera nó inchinn: 240 mg
Muscle: 450 mg
Cnámha, gruaig nó craiceann: 1g
● Arthropods:
Feithidí: 6g
Crustacea: 300 mg
● Fuil iomlán: 1 feadán
● Cealla: 106 cealla
Seachadadh samplach molta
Coimeádán: 2 feadán lártheifneoir ml (ní mholtar scragall stáin)
Lipéadú samplach: Grúpa+macasamhlú m.sh. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Loingsiú:
1. Tirim-Ice: Ní mór samplaí a phacáil i málaí agus iad a adhlacadh i oighear tirim.
2. Feadáin RNAStable: Is féidir samplaí RNA a thriomú i bhfeadán cobhsaíochta RNA (m.sh. RNAStable®) agus iad a sheoladh i dteocht an tseomra.
Sreabhadh oibre seirbhíse
Nucleotides:
Seachadadh samplach
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís ar shonraí
Seirbhísí tar éis díol
Sreabhadh oibre seirbhíse
Fíochán:
Dearadh turgnamh
Seachadadh samplach
Eastóscadh RNA
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís ar shonraí
Seirbhísí tar éis díol
● Próiseáil sonraí amh
● Sainaithint athscríbhinne
● Splicing malartach
● Cainníochtú léirithe i leibhéal géine agus leibhéal isoform
● Anailís ar léiriú difreálach
● Nótaí agus saibhriú feidhme (DEGS and Dets)
Anailís Splicing Malartach
Anailís Polyadenylation Malartach (APA)
tuar lncRNA
Nótaí géinte núíosacha
Cnuasú dets
Líonraí próitéine-próitéine i DEGS
Déan iniúchadh ar na dul chun cinn a éascaíonn seirbhísí seicheamhaithe mRNA nanopore nanopore BMKGENE trí bhailiúchán foilseachán coimeádaithe.
Gong, B. et al. . doi: 10.1016/j.jgg.2023.01.008.
Sé, Z. et al. . 108636. Doi: 10.1016/j.fsi.2023.108636.
Ma, Y. et al. . 110709. Doi: 10.1016/j.ygeno.2023.110709.
Yu, D. et al. . doi: 10.1186/s13287-023-03491-5/táblaí/6.
