Exclusive Agency for Korea

条形meirge-03

Táirgí

Géineolaíocht Éabhlóideach

Is seirbhís chuimsitheach seicheamhaithe é Géineolaíocht Éabhlóideach atá deartha chun léirmhíniú léargasach a thairiscint ar an éabhlóid laistigh de ghrúpa mór daoine aonair, bunaithe ar éagsúlachtaí géiniteacha, lena n-áirítear SNPanna, InDels, SVanna, agus CNVanna. Cuimsíonn an tseirbhís seo na hanailísí riachtanacha go léir a theastaíonn chun athruithe éabhlóideacha agus tréithe géiniteacha daonraí a shoiléiriú, lena n-áirítear measúnuithe ar struchtúr daonra, éagsúlacht ghéiniteach, agus caidrimh fhileiginiteacha. Ina theannta sin, déanann sé staidéar ar shreabhadh géine, rud a chumasaíonn meastacháin ar mhéid éifeachtach an daonra agus ar am éagsúlachta. Tugann staidéir ghéiniteacha éabhlóideacha léargais luachmhara ar bhunús agus oiriúnuithe speiceas.

Ag BMKGENE, cuirimid dhá bhealach ar fáil chun staidéir ghéiniteacha éabhlóideacha a dhéanamh ar dhaonraí móra: seicheamhú géanóm iomlán (WGS) a úsáid nó modh seicheamhaithe géanóm ionadaíochta laghdaithe a roghnú, an Fragment Amplified Sonrach-Lócas (SLAF) a forbraíodh intí. Cé go n-oireann WGS do ghéanóim níos lú, tagann SLAF chun cinn mar rogha eile atá éifeachtach ó thaobh costais de chun staidéar a dhéanamh ar dhaonraí níos mó le géanóim níos faide, ag íoslaghdú costais seicheamhaithe go héifeachtach.


Sonraí Seirbhíse

Bithfhaisnéisíocht

Torthaí Taispeána

Foilseacháin faoi thrácht

Buntáistí Seirbhíse

1 Géineolaíocht éabhlóideach

Takagi et al.,An iris plandaí, 2013

Anailís chuimsitheach bhithfhaisnéiseach:a chumasaíonn meastachán na héagsúlachta géinití, a léiríonn acmhainneacht éabhlóideach speiceas, agus a nochtfaidh caidreamh iontaofa fíolaigineach idir speicis a bhfuil tionchar íoslaghdaithe acu ar éabhlóid chóineasaithe agus ar éabhlóid chomhthreomhar

Anailís shaincheaptha roghnach: amhail meastachán ar am agus ar luas na héagsúlachta bunaithe ar éagsúlachtaí ar leibhéal na núicléatíde agus aimínaigéid.

Saineolas fairsing agus taifid foilseacháin: Tá taithí ollmhór carntha ag BMKGene i dtionscadail géineolaíochta daonra agus éabhlóideach le breis agus 15 bliana, ag clúdach na mílte speiceas, etc., agus chuir sé le breis agus 1000 tionscadal ardleibhéil a foilsíodh i Nature Communications, Móilíneach Plandaí, Iris Biththeicneolaíochta Plandaí, etc.

● Foireann bithfhaisnéisíochta ardoilte agus timthriall anailíse gairid: le taithí iontach ar anailís ghéanómaíochta chun cinn, seachadann foireann BMKGene anailísí cuimsitheacha le ham slánúcháin sciobtha.

● Tacaíocht Iar-Dhíolacháin:Síneann ár dtiomantas níos faide ná críochnú an tionscadail le tréimhse seirbhíse 3 mhí tar éis an díola. Le linn an ama seo, cuirimid gníomhaíochtaí leantacha tionscadail, cúnamh fabhtcheartaithe, agus seisiúin ceisteanna agus freagraí ar fáil chun dul i ngleic le haon cheisteanna a bhaineann leis na torthaí.

Sonraíochtaí agus ceanglais Seirbhíse

Cineál seicheamhaithe

Scála daonra molta

Straitéis seicheamhaithe

Ceanglais núicléitíde

Seicheamhú Géanóim Iomlán

≥ 30 duine aonair, le ≥ 10 duine ó gach foghrúpa

 

10x

Tiúchan: ≥ 1 ng/ µL

Méid iomlán≥ 30ng

Díghrádú nó éilliú teoranta nó gan éilliú

Fragment Méadaithe Sain-Lócais (SLAF)

Doimhneacht chlib:

10x

Líon na gclibeanna:

<400 Mb: Moltar WGS

<1Gb: clibeanna 100K

1Gb

> 2Gb: clibeanna 300K

500k clibeanna ar a mhéad

Tiúchan ≥ 5 ng/µL

Méid iomlán ≥ 80 ng

Nanodrop OD260/280=1.6-2.5

Glóthach agarose: gan aon díghrádú nó éilliú nó gan a bheith teoranta

 

Sreabhadh Oibre Seirbhíse

QC samplach

Dearadh turgnaimh

seachadadh samplach

Seachadadh samplach

Ullmhúchán Leabharlainne

Tógáil leabharlainne

Seicheamhú

Seicheamhú

Anailís sonraí

Anailís sonraí

Seirbhísí tar éis díol

Seirbhísí iar-díola


  • Roimhe Seo:
  • Ar Aghaidh:

  • SLAF流程图 -8.4改-01

    Áirítear leis an tseirbhís anailís ar struchtúr an daonra (crann fylogenetic, PCA, cairt srathaithe daonra), éagsúlacht daonra, agus roghnú daonra (éagothroime nascachta, roghnúchán roghnach láithreán buntáisteach). Is féidir anailís shaincheaptha a áireamh sa tseirbhís freisin (eg am éagsúlachta, sreabhadh géine).

    *Is ó ghéanóim a foilsíodh le BMKGENE na torthaí taispeána a thaispeántar anseo

    Cuimsíonn anailís 1.Evolution tógáil crann phylogenetic, struchtúr daonra agus PCA bunaithe ar éagsúlachtaí géiniteacha.

    Is ionann crann fylogenetic agus caidreamh tacsanomaíoch agus éabhlóideach i measc speiceas le sinsear coitianta.
    Tá sé mar aidhm ag PCA cé chomh gar agus atá na fo-dhaonraí a fheiceáil.
    Léiríonn struchtúr daonra láithreacht fo-dhaonra atá sainiúil go géiniteach i dtéarmaí minicíochtaí ailléil.

    3-1 Phylogenetic-crann 3-2PCA 3-3Daonra-struchtúr

    Chen, et. al.,PNAS, 2020

    2.Sweet Roghnach

    Tagraíonn scuabadh roghnaíoch do phróiseas trína roghnaítear láithreán buntáisteach agus ina n-ardaítear minicíochtaí suíomhanna neodracha nasctha agus laghdaítear líon na suíomhanna neamhnasctha, rud a fhágann go laghdaítear líon réigiúnach.

    Próiseáiltear braite ar fud an ghéanóim ar réigiúin roghnacha scuabtha trí innéacs géiniteach daonra (π,Fst, Tajima's D) de gach SNP a ríomh laistigh d'fhuinneog sleamhnáin (100 Kb) ag céim áirithe (10 Kb).

    Éagsúlacht núicléitíde(π)
    4Núicléitíd-éagsúlacht(π)

    D. Tajima
    5Tajima's-D

    Innéacs fosaithe(Fst)

    6Fixation- index(Fst)

    Wu, et. al.,Gléasra Móilíneach, 2018

    Sreabhadh 3.Gene

    7 Géine-sreabhadh

    Wu, et. al.,Gléasra Móilíneach, 2018

    Stair 4.Demographic

    8Déimeagrafach-stair

    Zhang, et. al.,Éiceolaíocht & Éabhlóid an Dúlra, 2021

    Am 5.Divergence

    9Divergence-time

    Zhang, et. al.,Éiceolaíocht & Éabhlóid an Dúlra, 2021

    Déan iniúchadh ar na dul chun cinn atá éascaithe ag seirbhísí géiniteacha éabhlóideacha BMKGene trí bhailiúchán coimeádaithe foilseachán:

    Hassanyar, AK et al. (2023) 'Fionnachtain Marcóirí Móilíneacha SNP agus Géinte Iarrthóra a Bhaineann le Friotaíocht Víreas Sacbrood i Larbhaí Apis cerana cerana trí Iarchéimniú Genome Iomlán',Iris Idirnáisiúnta na nEolaíochtaí Móilíneach...., 24(7). do: 10.3390/IJMS24076238.

    Chai, J. et al. (2022) ‘Cruthaítear deiseanna caomhnaithe nua nuair a aimsítear salamandair ollmhór Síneach fiáin géiniteach’,Taighde Zó-eolaíochta, 2022, Iml. 43, Eagrán 3, Leathanaigh: 469-480, 43(3), lgh. 469–480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.

    Han, M. et al. (2022) 'Patrún Phylogeographical agus Stair Éabhlóid an Daonra Elymus sibiricus L. Dúchasach ar Ardchlár Qinghai-Tibéidis',Teorainneacha in Eolaíocht Plandaí, 13, lch. 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.

    Wang, J. et al. (2022) 'Léargas géanómach ar éabhlóid longan ó thionól géanóm ar leibhéal crómasóim agus géanóm daonra aontachais longan',Taighde Gairneoireachta, 9. doi: 10.1093/HR/UHAC021.

    fháil ceanglófar

    Scríobh do theachtaireacht anseo agus seol chugainn é

    Seol do theachtaireacht chugainn: