Ardán | Méid leabharlainne | Toradh Sonraí Teoiriciúla (in aghaidh na cille) | Cruinneas bonn aonair | Feidhmithe |
Nanúileach | 8KB, 10KB, 20KB, Ultralong, cDNA-PCR | 70-90GB/cill | 85-92% | SV Calling, de novo, seicheamhú fad iomlán, ISO-seq, nótaí géine, braite meitile DNA |
● Taithí os cionn 5 bliana ar ardán seicheamhaithe PACBIO leis na mílte tionscadal dúnta le speicis éagsúla.
● Is comhpháirtí oifigiúil é BMKGene de Oxford Nanopore, le deimhniú dé -ardán RNA/DNA.
● Tá samhlacha príomhshrutha seicheamhaithe le trealamh iomlán agus tréchur seicheamhaithe leordhóthanach.
● Bunaithe ar an ardán nanopore, foilsíodh níos mó ná 10 dtaighde ar Denovo ainmhithe agus plandaí in irisí a bhfuil cáil idirnáisiúnta orthu.
Cineál samplach | Méid | Tiúchan (Qubit ®) | Toirt | Íona | Daoine eile |
DNA géanómach | Ag brath ar riachtanas sonraí | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.2; OD260/230≥1.5 ; Buaic shoiléir ag 260 nm, gan aon truailliú | Ní mór an tiúchan a thomhas ag qubit agus qubit/nanopore ≤ 2 |
RNA iomlán | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.5; OD260/230 = 0.5-2.5 ; Gan aon truaillithe | Luach Rin ≥7.5 |
Measúnú ar cháilíocht sonraí ar shampla DNA
Tábla 1. Staitisticí ar shonraí glana.
BMKID | Rawseqnum | Rawsumbase | CleanSeqnum | cluambase | glanta50len | glanta90len | glantalen | CleanMaxlen | glanmEAigh |
DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
Measúnú ar cháilíocht sonraí ar shampla RNA
Tábla 1. Staitisticí ar shonraí glana.
Ainm comhaid | Cliintid | Readnum | An bhunbhéim | N50 | Rún | Uasta | Meánchomhrá |
RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | C12 |
Figiúr 1. Dáileadh fad léite
Figiúr 2. Scór cáilíochta Dáileadh na Sonraí Glan
Figiúr 3. Scór Fad agus Cáilíochta Dáileadh na Sonraí Glan