Leabharlanna réamhdhéanta Illumina
Gnéithe
●Ardáin:Illumina NovaSeq 6000 agus NovaSeq X Plus
●Modhanna seicheamhaithe:PE150 agus PE250
●Rialú cáilíochta ar leabharlanna roimh sheicheamhú
●Sonraí seicheamhaithe QC agus seachadadh:seachadadh tuairisce QC agus sonraí amh i bhformáid fastq tar éis léamha C30 a dhí-ilphléacsú agus a scagadh
Buntáistí Seirbhíse
●Ilghnéitheacht seirbhísí seicheamhaithe:féadfaidh an custaiméir seicheamh a dhéanamh de réir lána, sreafachill, nó de réir méid na sonraí a theastaíonn (seicheamhú lána páirteach).
●Taithí fhairsing ar ardán seicheamhaithe Illumina:leis na mílte tionscadal dúnta le speicis éagsúla.
●Seachadadh tuarascáil QC seicheamhaithe:le méadracht cháilíochta, cruinneas sonraí agus feidhmíocht fhoriomlán an tionscadail seicheamhaithe.
●Próiseas seicheamhaithe aibí:le ham slánúcháin gearr.
●Rialú Cáilíochta dian: cuirimid ceanglais dhian QC i bhfeidhm chun seachadadh torthaí ardchaighdeáin comhsheasmhach a ráthú.
Ardáin Samplacha
| Ardán | Sreabhadh Cille | Modh seicheamhaithe | Aonad | Aschur measta |
| NovaSeq X | 10B (8 lána) | PE150 | Lána Aonair Lána Páirteach | 375Gb / Lána |
| 25B (8 lána) | PE150 | Lána Aonair Lána Páirteach | 1000 Gb / Lána | |
| NovaSeq 6000 | Cill sreafa SP (2 lána) | PE250 | Sreabhadh Cille Lána Aonair Lána Páirteach | 325-400 M léann / Lána |
| Cill sreafa S4 (4 lána) | PE150 | Sreabhadh Cille Lána Aonair Lána Páirteach | ~800 Gb / Lána |
Riachtanais Shamplacha
| Méid na Sonraí (X) | Tiúchan (qPCR/nM) | Toirt | |
| Seicheamh Lána Páirteach
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
| Seicheamh Lána | Per Lane | ≥ 1.5 nM / Linn Leabharlann | ≥ 25 μl / Linn Leabharlann |
Chomh maith le tiúchan agus méid iomlán, tá gá le patrún buaic oiriúnach freisin.
Tabhair faoi deara: Tá gá le PhiX spike-isteach le haghaidh seicheamh lána leabharlanna íseal-éagsúlachta chun bonnghlaoch láidir a chinntiú.
Molaimid leabharlanna réamh-chomhthiomsaithe a chur isteach mar shamplaí. Má theastaíonn uait BMKGENE chun comhthiomsú leabharlainne a dhéanamh, féach le do thoil
riachtanais na leabharlainne maidir le seicheamhú cuid de lána.
Méid na Leabharlainne (Buaicléarscáil)
Ba chóir go mbeadh an príomh-bhuaic laistigh de 300-450 bp.
Ba cheart go mbeadh príomhbhuaic amháin ag leabharlanna, gan aon éilliú oiriúnaitheora agus gan aon dimers primer.
Déan teagmháil linn le do thoil mura gcomhlíonann do shamplaí na ceanglais maidir le hábhar tosaigh.
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Rialú cáilíochta leabharlainne
Seicheamhú
Rialú cáilíochta sonraí
Seachadadh tionscadail
Tuarascáil QC na Leabharlainne
Cuirtear tuairisc ar cháilíocht na leabharlainne ar fáil sula ndéantar seicheamhú, measúnú ar mhéid na leabharlainne agus ar an scoilteadh.
Seicheamh tuarascáil QC
Tábla 1. Staitisticí ar shonraí seicheamhaithe.
| ID Samplach | BMKID | Léann amh | Sonraí Amha (bp) | Léamh glan (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Fíor 1. Léann dáileadh cáilíochta feadh gach sampla
Fíor 2. Dáileadh ábhar bonn
Fíor 3. Dáileadh an ábhair léite i sonraí seicheamhaithe
