Trascríbhinn Spásúil BMKMANU S1000
BMKMANU S1000 Scéim Theicniúil Trascriptome Spásúlachta
Gnéithe
● Taifeach: 5 µM
● Trastomhas Spota: 2.5 µM
● Líon na spotaí: thart ar 2 mhilliún
● 3 fhormáid limistéar gabhála féideartha: 6.8 mm * 6.8 mm, 11 mm * 11 mm nó 15 mm * 20 mm
● Tá gach coirnín barrachóid luchtaithe le primers comhdhéanta de 4 chuid:
eireaball polai(dT) le haghaidh priming mRNA agus sintéis cDNA
Aitheantóir Móilíneach Uathúil (UMI) chun laofacht aimpliúcháin a cheartú
Barrachóid spáis
Seicheamh ceangailteach de pháirtléamh 1 primer seicheamhaithe
● H&E agus smálú fluaraiseacha na gcodanna
● Féidearthacht úsáid a bhaint asteicneolaíocht deighilt cille: comhtháthú staining H&E, staining fluaraiseacha, agus seicheamhú RNA chun teorainneacha gach cille a chinneadh agus slonn géine a shannadh i gceart do gach cill.
Buntáistí BMKMANU S1000
●Rún Fo-cheallach: I ngach limistéar gabhála bhí >2 mhilliún spota barrachódaithe spásúlachta a raibh trastomhas 2.5 µm acu agus spásáil 5 µm idir spotionaid, rud a chuir ar chumas anailíse tras-scríbhinne spásúlachta le taifeach focheallach (5 µm).
●Anailís Taifeach Illeibhéil:Anailís il-leibhéil solúbtha ó 100 μm go 5 μm chun gnéithe fíocháin éagsúla a réiteach ag an réiteach is fearr.
● Féidearthacht Teicneolaíocht Deighilte Cille “Trí in aon sleamhnán” a Úsáid:Trí ruaimniú fluaraiseachta, staining H&E, agus seicheamhú RNA a chomhcheangal ar shleamhnán amháin, cumasaíonn ár n-algartam anailíse “trí-i-aon” teorainneacha cille a aithint do thrascríobhánaíocht cille-bhunaithe ina dhiaidh sin.
●Ag luí le hArdáin Il-Seicheamhaithe: Tá an dá NGS agus seicheamhú fad-léite ar fáil.
●Dearadh Solúbtha ar Limistéar Gabhála Gníomhach 1-8: Tá méid an limistéir ghabhála solúbtha, agus is féidir 3 fhormáid a úsáid (6.8 mm * 6.8 mm., 11 mm * 11 mm agus 15 mm * 20 mm)
●Seirbhís Aon-stad: Comhtháthaíonn sé gach céim taithí agus scil-bhunaithe, lena n-áirítear cryo-roinnt, staining, leas iomlán a bhaint fíocháin, barrachódú spásúil, ullmhú leabharlainne, seicheamhú, agus bithfhaisnéisíocht.
●Bithfhaisnéisíocht Chuimsitheach agus Amharcléiriú Torthaí Éasca le húsáid:Áirítear sa phacáiste 29 anailís agus 100+ figiúr ardcháilíochta, in éineacht le húsáid bogearraí a forbraíodh intí chun scoilteadh cille agus spotchnuasú a shamhlú agus a shaincheapadh.
●Anailís agus Amharcléiriú Sonraí Saincheaptha: ar fáil le haghaidh iarratais taighde éagsúla
●Foireann Teicniúil ardoilte: le taithí ar bhreis is 250 cineál fíocháin agus 100+ speiceas lena n-áirítear daoine, lucha, mamach, iasc agus plandaí.
●Nuashonruithe Fíor-ama ar an Tionscadal Iomlán: le smacht iomlán ar dhul chun cinn turgnamhach.
●Comh-anailís Roghnach le Seicheamhú mRNA Aonchealla
Sonraíochtaí Seirbhíse
|
Sampla Riachtanais
| Leabharlann |
Straitéis seicheamhaithe
| Sonraí molta | Rialú Cáilíochta |
| Samplaí cryo leabaithe OCT, 3 bhloc in aghaidh an tsampla | S1000 cDNA leabharlann | Illumina PE150 (ardáin eile ar fáil) | Léann 100K PE in aghaidh 100 uM ( 60-150 Gb ) | RIN>7 |
Le haghaidh tuilleadh sonraí ar threoir ullmhúcháin samplach agus ar shreabhadh oibre seirbhíse, bíodh leisce ort labhairt le asaineolaí BMKGENE
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Sa chéim ullmhúcháin sampla, déantar triail eastósctha RNA mórchóir tosaigh chun a chinntiú gur féidir RNA ardcháilíochta a fháil. Sa chéim optamaithe fíocháin déantar na hailt a dhaite agus a léirshamhlú agus déantar na coinníollacha tréscaoilteachta maidir le scaoileadh mRNA ó fhíocháin a bharrfheabhsú. Cuirtear an prótacal optamaithe i bhfeidhm ansin le linn tógáil na leabharlainne, agus déantar seicheamhú agus anailís ar shonraí ina dhiaidh sin.
Is éard atá i gceist le sreabhadh oibre iomlán na seirbhíse ná nuashonruithe fíor-ama agus deimhnithe cliant chun lúb aiseolais sofhreagrach a choinneáil, rud a chinntíonn go ndéantar tionscadal réidh.
Déantar anailís ar na sonraí a ghineann BMKMANU S1000 ag baint úsáide as na bogearraí “BSTMatrix”, atá deartha go neamhspleách ag BMKGENE, a ghineann Maitrís Léirithe Géine. Ón áit sin, gintear tuarascáil chaighdeánach a chuimsíonn rialú cáilíochta sonraí, anailís inmheánach-shampla agus anailís idirghrúpa.
● Rialú Cáilíochta Sonraí:
Aschur sonraí agus dáileadh scór cáilíochta
Brath géine in aghaidh an spota
Clúdach fíocháin
● Anailís samplach istigh:
Saibhreas géine
Cnuasú spota, lena n-áirítear anailís toise laghdaithe
Anailís difreálach ar léiriú idir braislí: sainaithint géinte marcála
Anótáil feidhme agus saibhriú géinte marcála
● Anailís idirghrúpa:
Spotaí ón dá shampla a athcheangal (m.sh. galair agus rialaithe) agus athchnuasach
Sainaithint géinte marcála do gach braisle
Anótáil feidhme agus saibhriú géinte marcála
Difreálach Léiriú an bhraisle chéanna idir grúpaí
Ina theannta sin, d’fhorbair BMKGENE “BSTViewer” is uirlis atá éasca le húsáid a chuireann ar chumas an úsáideora léiriú a dhéanamh ar shloinneadh na géine agus cnuasach a fheiceáil ag rúin éagsúla.
D'fhorbair BMKGene bogearraí le haghaidh léirshamhlú atá éasca le húsáid
Cnuasú spot BSViewer ag taifeach illeibhéil
BSTCellViewer: scoilteadh cille uathoibríoch agus láimhe
Anailís Samplach Istigh
Cnuasú spota:
Sainaithint géinte marcóra agus dáileadh spásúil:
Anailís Idirghrúpa
Comhcheangal sonraí ón dá ghrúpa agus ón athchnuasach:
Géinte marcála na mbraislí nua:
Déan iniúchadh ar na dul chun cinn a d’éascaigh seirbhísí tras-scríbhinne spásúla BMKGene leis an teicneolaíocht BMKManu S1000 san fhoilseachán seo a leanas:
Amhrán, X. et al. (2023) ‘Nochtann trascríobhómaíocht spásúil cealla chlorenchyma solas-spreagtha a bhfuil baint acu le hathghiniúint préachán a chur chun cinn i callus trátaí’,Imeachtaí Acadamh Náisiúnta Eolaíochtaí na Stát Aontaithe Mheiriceá, 120(38), lch. e2310163120. doi: 10.1073/pnas.2310163120
Tú, Y. et al. (2023) 'Comparáid chórasach idir modhanna tras-amaíocha spásúla atá bunaithe ar sheicheamhú',bithRxiv, lch. 2023. 12.03.569744. do: 10.1101/2023.12.03.569744.
