An Tionól Géanóim Baictéarach nua
Soláthraímid seirbhís tionóil genome baictéarach iomlán, ag ráthú 0 bearnaí. Is féidir é seo a dhéanamh trí theicneolaíochtaí seicheamhaithe fadléithe a chomhtháthú, mar shampla Nanopore agus PacBio le haghaidh tionóil agus seicheamhú gearrléithe le Illumina le haghaidh bailíochtú cóimeála agus ceartú earráidí léamha ONT. Soláthraíonn ár seirbhís an sreabhadh oibre bithfhaisnéiseach iomlán ó thionól, anótáil fheidhmiúil, agus ard-anailís bhithfhaisnéiseach, ag comhlíonadh sainspriocanna taighde. Cumasaíonn an tseirbhís seo géineomaí tagartha beachta a fhorbairt le haghaidh staidéir ghéiniteacha agus ghéanómacha éagsúla. Ina theannta sin, tá sé mar bhunús le haghaidh feidhmeanna amhail barrfheabhsú brú, innealtóireacht ghéiniteach, agus forbairt teicneolaíochta miocróbach, lena n-áirithítear sonraí géanómaíochta iontaofa agus saor ó bhearnaí atá ríthábhachtach chun léargais eolaíocha agus nuálaíocht bhiteicneolaíoch a chur chun cinn.
Gnéithe Seirbhíse
● Le dhá rogha fhéideartha a roghnú as ag brath ar an leibhéal inmhianaithe iomláine genome.
● Dréacht-Rogha Genome: Seicheamh gearr-léite le Illumina NovaSeq PE150.
● Críochnaigh 0 genome bearna.
● Seicheamh léamh fada ar Nanopore PromethION 48 nó PacBio Refio le haghaidh tionól genome.
● Seicheamh gearr-léite ar Illumina NovaSeq le haghaidh bailíochtú géanóm agus ceartú earráide (Nanopore) nó chun dréacht-ghéanóm a ghiniúint.
Buntáistí Seirbhíse
●Géanóim Nialais-Bhearna Ráthaithe: Tá sé seo mar gheall ar sheicheamhú Illumina a chomhtháthú le seicheamh léamh fada (Nanopore nó PacBio).
●Sreabhadh Oibre Bithfhaisnéisíochta Críochnaithe:Áirítear leis seo cóimeáil géanóm agus tuar na n-eilimintí géanómacha iolracha, anótáil géine feidhmeach, agus léirshamhlú géanóim ar nós plota Circos.
●Saineolas Fairsing: Le níos mó ná 20,000 genomes miocróbach le chéile, tugann BMKGENE breis agus deich mbliana de thaithí, foireann anailíse ard-oilte, ábhar cuimsitheach, agus tacaíocht iar-díolacháin den scoth.
●Tacaíocht Iar-Dhíolacháin:Síneann ár dtiomantas níos faide ná críochnú an tionscadail le tréimhse seirbhíse 3 mhí tar éis an díola. Le linn an ama seo, cuirimid gníomhaíochtaí leantacha tionscadail, cúnamh fabhtcheartaithe, agus seisiúin ceisteanna agus freagraí ar fáil chun dul i ngleic le haon cheisteanna a bhaineann leis na torthaí.
●Straitéisí Ilseichimh ar Fáil:Le haghaidh spriocanna taighde éagsúla agus riachtanais iomláine genome.
Sonraíochtaí Seirbhíse
| Seirbhís | Straitéis Seicheamhaithe |
| Dréacht Géanóm | Tiománaí Illumina PE150 100x |
| 0 Géanóm Bearna | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (roghnach) |
Riachtanais Shamplacha:
| Tiúchan (ng/µL) | Méid iomlán (µg) | Toirt (µL) | OD260/280 | OD260/230 | |
| PacBio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| Nanópóir | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Illumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Baictéir: ≥3.5x1010 cealla
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Seachadadh samplach
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís sonraí
Seirbhísí iar-díola
Áirítear an Anailís seo a leanas:
● Rialú Cáilíochta Sonraí a Sheicheamhú
● Tionól Genome
● Anailís ar Chomhpháirt Géanóm: Tuar CDS agus eilimintí géanómacha iolracha
● Nóta feidhmiúil le bunachair shonraí ghinearálta iolracha (GO, KEGG, srl) agus bunachair shonraí ardleibhéil (CARD, VFDB, srl)
● Amharcléiriú Géanóim
Cuirimid an genome ar fáil i bhformáid fasta atá inrochtana go héasca agus an comhad anótála genome (gff).
Nóta géine - GO
Nóta géine – carbaihiodráití CAZY
Amharcléiriú genome - plota Circos
Déan iniúchadh ar na dul chun cinn atá éascaithe ag seirbhísí cóimeála géanóim baictéarach BMKGene trí bhailiúchán coimeádaithe foilseachán.
Dai, W. et al. (2023) 'Fionnachtain Bacteroides aonfhoirmeachis F18-22 mar Baictéar Probiotach Sábháilte Úrscéalach chun Déileáil le hAilitíteas Ulcerative ó Choilíneacht Dhaonna Shláintiúil',Iris Idirnáisiúnta na nEolaíochtaí Móilíneacha, 24(19), lch. 14669. doi: 10.3390/IJMS241914669/S1.
Kang, Q. et al. (2021) ‘Aonraíonn Proteus mirabilis ildhrugaí-resistant a iompraíonn blaOXA-1 agus blaNDM-1 ón bhfiadhúlra sa tSín: ag méadú riosca sláinte poiblí’,Zó-eolaíocht Chomhtháiteach, 16(6), lgh. 798–809. doi: 10.1111/1749-4877.12510.
Wang, TT et al. (2017) 'Nochtann seicheamh genome iomlán an endophyte Bacillus flexus KLBMP 4941 a mheicníocht chun fás plandaí a chur chun cinn agus a bhunús géiniteach maidir le lamháltas salainn',Iris na Biteicneolaíochta, 260, lgh 38–41. doi: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001.
Wang, X. et al. (2021) 'Plaisimídí Frithsheasmhachta Il-Macasamhail de Klebsiella Mediate Scaipeadh Fairsingeach ar Ghéin Fhrithmhiocróbacha',Teorainneacha i Micribhitheolaíocht, 12, lch. 754931. doi: 10.3389/FMICB.2021.754931/BIBTEX.
