Exclusive Agency for Korea

Logkcloud logáil isteach

Táirgeacht

16S/18S/a sheicheamhú amplicon-pacbio

16s/18s/a seicheamhú amplicon-pacbio íomhá le feiceáil

Feidhmíonn na géinte rRNA 16S agus 18S, mar aon leis an réigiún inmheánach athscríofa (a), mar marcóirí méarloirg móilíneach lárnach mar gheall ar a meascán de réigiúin atá an-chaomhnaithe agus an-athbhunaithe, rud a fhágann gur uirlisí luachmhara iad chun orgánaigh prokaryotic agus eukaryotic a thréithriú. Tugann aimpliú agus seicheamhú na réigiún seo cur chuige saor ó aonrú chun an comhdhéanamh agus an éagsúlacht mhiocróbach a imscrúdú ar fud éiceachórais éagsúla. Cé go ndíríonn seicheamhú Illumina de ghnáth ar réigiúin ghearra hipear-inláimhsithe cosúil le V3-V4 de 16S agus ITS1, léiríodh go bhfuil an nóta tacsanomaíoch níos fearr indéanta trí fhad iomlán 16s, 18s, agus a. Mar thoradh ar an gcur chuige cuimsitheach seo tá céatadáin níos airde de sheichimh aicmithe go cruinn, ag baint amach leibhéal réitigh a shíneann go sainaithint speiceas. Seasann ardán seicheamhaithe fíor-ama (SMRT) PACBIO trí léamha fada an-chruinn (HIFI) a chur ar fáil a chlúdaíonn na h-amplicons fad-fhad, ag dul i ngleic le cruinneas seicheamhú Illumina. Ligeann an cumas seo do thaighdeoirí buntáiste neamh -chomhoiriúnaithe a bhaint amach - dearcadh lánléargais ar an tírdhreach géiniteach. Ardaíonn an clúdach sínte an réiteach i nótaí speiceas go mór, go háirithe i bpobail bhaictéaracha nó fungais, rud a chuireann ar a gcumas tuiscint níos doimhne a dhéanamh ar intricacies na ndaonraí miocróbacha.

Déan teagmháil linn

Sonraí seirbhíse

Bithfhaisnéisíocht

Torthaí taispeána

Foilseacháin le feiceáil

Gnéithe seirbhíse

● Ardán seicheamhaithe: Pacbio Revio

● Modh seicheamhaithe: CCS (léann HIFI)

● Aimpliú ar an sprioc -réigiún agus ina dhiaidh sin ag nascadh amplicons roimh ullmhúchán Leabharlann Hifi Smrt Bell

Buntáistí Seirbhíse

●Réiteach Tacsanomaíoch Níos Airde: T.Seicheamhú Han Short-Amplicon,ag cur ar chumas rátaí aicmithe OTU níos airde ag leibhéal an speicis.

●Glaoch bonn an -chruinn: Seicheamhú Mód PACBIO CCS (léann HIFI).

●Saor ó aonrú: Comhdhéanamh miocróbach a aithint go tapa i samplaí comhshaoil.

●Infheidhme go forleathan: Staidéir phobail mhiocróbacha éagsúla.

●Anailís chuimsitheach bithfhoirmiúil: An pacáiste QIIME2 is déanaí (léargas cainníochtúil ar éiceolaíocht mhiocróbach) le hanailísí éagsúla i dtéarmaí bunachar sonraí, nóta, OTU/ASV.

●Saineolas fairsing: Leis na mílte tionscadal seicheamhaithe Amplicon a rinneadh gach bliain, tugann BMKGene breis agus deich mbliana de thaithí, foireann anailíse ardoilte, ábhar cuimsitheach, agus tacaíocht iar-dhíolacháin den scoth.

Sonraíochtaí seirbhíse

Leabharlann	Straitéis seicheamhaithe	Sonraí Molta
Aimplicon	Pacbio Revio	Clibeanna 10/30/50 K (CCS)

Riachtanais samplacha

Tiúchan (Ng/µl)	Méid iomlán (µg)	Toirt (µl)
≥5	≥0.3	≥20

Seachadadh samplach molta

Reo na samplaí i nítrigin leachtach ar feadh 3-4 uair an chloig agus stóráil i nítrigin leachtach nó -80 céim go forchoimeádas fadtéarmach. Teastaíonn loingseoireacht shamplach le oighear tirim.

Sreabhadh oibre seirbhíse

Seachadadh samplach

Tógáil leabharlainne

Seicheamhú

Anailís ar shonraí

Seirbhísí tar éis díol

Roimhe seo: 16S/18S/A Sheicheamhú Amplicon-NGS

Ar Aghaidh: Measúnacht le haghaidh crómatin inrochtana trasuímh le seicheamhú tréchuir ard (ATAC-seq)

Áirítear leis an anailís seo a leanas:

● Rialú cáilíochta sonraí amh

● Cnuasach OTU/De-Torann (ASV)

● Nóta OTU

● Anailís ar éagsúlacht alfa: Innéacsanna iolracha, lena n -áirítear Shannon, Simpson agus Ace.

● Anailís ar éagsúlacht béite

● Anailís idirghrúpa

● Anailís ar chomhghaol: Idir tosca comhshaoil agus comhdhéanamh agus éagsúlacht amach

● réamh -mheastachán géine feidhmiúil 16S

Histeagram de dháileadh tacsanomaíoch

Dáileadh Pobail Crann fíteigineach

Anailís ar éagsúlacht alfa: ACE

innéacsuimhir

Anailís ar éagsúlacht béite: PCOA

Anailís Idirghrúpa: ANOVA

Déan iniúchadh ar na dul chun cinn a éascaíonn seirbhísí seicheamhaithe amplicon BMKGENE le PACBIO trí bhailiúchán foilseachán coimeádaithe.

Gao, X. agus Wang, H. (2023) 'Anailís chomparáideach ar phróifílí agus feidhmeanna baictéarach rumen le linn oiriúnaithe do feineolaíocht dhifriúil (Regreen vs Grassy) i gcaoirigh alpach Merino le dhá chéim atá ag fás ar mhóinéar alpach', coipeadh, 9 (9 (9 (9 (9 (9 (9 (9 (9 (Coipín Alpach, 9 (9 ( 1), lch. 16. DOI: 10.3390/FORMATION9010016/S1.

Li, S. et al. . doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.

Mu, L. et al. . 1487. doi: 10.1002/jsfa.11482.

Yang, J. et al. . I strus ocsaídiúcháin intestinal oxazolone-spreagtha i zebrafish aosach ', frithocsaídeoirí 2023, vol. 12, leathanach 192, 12 (1), lch. 192. DOI: 10.3390/Antiox12010192.