16S/18S/ITS Seicheamhú Amplicon-NGS
Gnéithe Seirbhíse
● Ardán seicheamhaithe: Illumina NovaSeq.
● Aimpliú ar réigiúin ghearr 16S, 18S agus ITS, i measc spriocanna aimpliúcháin eile.
● Roghanna solúbtha aimplicon.
● Taithí tionscadail roimhe seo le spriocanna aimpliúcháin iolracha.
Buntáistí Seirbhíse
●Saor ó leithlis:Aithint mhear ar chomhdhéanamh miocróbach i samplaí comhshaoil.
●Ardtaifeach: I gcomhpháirteanna íseal-flúirseach i samplaí comhshaoil.
●Infheidhme go Forleathan: Staidéir phobail mhiocróbacha éagsúla.
●Anailís Bhithfhaisnéiseach Chuimsitheach: An pacáiste QIIME2 is déanaí (léargas cainníochtúil ar éiceolaíocht mhiocróbach) le hanailísí éagsúla i dtéarmaí bunachar sonraí, nótaí, OTU/ASV.
●Saineolas Fairsing: Le 150 míle tionscadal seicheamhaithe amplicon á seoladh go bliantúil, tugann BMKGENE breis agus deich mbliana de thaithí, foireann anailíse ard-oilte, ábhar cuimsitheach, agus tacaíocht iar-díolacháin den scoth.
Sonraíochtaí Seirbhíse
| Leabharlann | Straitéis Seicheamhaithe | Sonraí molta |
| Amplicon | Illumina PE250 | Clibeanna 50/100/300K (Léigh Péirí) |
Riachtanais Seirbhíse
| Tiúchan (ng/µL) | Méid iomlán (ng) | Toirt (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Ithir/sloda: 1-2g
● Ábhar stéigeach-ainmhí: 0.5-2g
● Ábhar stéigeach-feithidí: 0.1-0.25g
● Dromchla plandaí (dríodar saibhrithe): 0.1-0.5g
● Dríodar saibhrithe brat choipeadh): 0.1-0.5g
● Faeces (ainmhithe móra): 0.5-2g
● Faeces (luch): 3-5gráin
● Sreabhán lavage alveolar scamhógach: páipéar scagtha
● Swab faighne: 5-6 táithíní
● swab craicinn/giniúna/seile/fíochán bog béil/swab pharyngeal/swab dronuilleach: 2-3 táithín
● Miocrorgánaigh dromchla: páipéar scagtha
● Dobharlach/aer/bithscannán: scagpháipéar
● Endophytes: 1-2g
● Plaic Fiaclóireachta: 0.5-1g
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Seachadadh samplach
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís sonraí
Seirbhísí iar-díola
Áirítear leis an anailís seo a leanas:
- Rialú cáilíochta sonraí amh
- Cnuasú OTU /De-torann (ASV)
- Nóta OTU
- Anailís éagsúlachta Alfa: innéacsanna iolracha, lena n-áirítear Shannon, Simpson agus ACE.
- Anailís éagsúlacht beta
- Anailís idirghrúpa
- Anailís comhghaoil: idir fachtóirí comhshaoil agus comhdhéanamh agus éagsúlacht OUT
- 16S tuar géine feidhme
Histeagram den dáileadh tacsanomaíoch
léarscáil teasa cnuasaithe flúirse tacsanomaíoch
Anailís éagsúlachta alfa: cuar rarefaction
anailís beta éagsúlachta: NMDS
Anailís idirghrúpa: fionnachtain bithmharcála LEFSE
Déan iniúchadh ar na dul chun cinn atá éascaithe ag seirbhísí seicheamhaithe aimplicon BMKGene le Illumina trí bhailiúchán coimeádaithe foilseachán.
Dong, C. et al. (2022) 'Cóimeáil, Croí-Mhicribiotán, agus Feidhm na Micribhitheora Ithir Rhizosphere agus Coirt in Eucommia ulmoides', Teorainneacha sa Micribhitheolaíocht, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317/Líonach.
Li, Y. et al. (2023) 'Trasphlandú cuibhreannais bhaictéarach shintéiseach chun cóireáil a dhéanamh ar vaginosis baictéarach de bharr Gardnerella vaginalis i lucha', Microbiome, 11(1), lgh. 1–14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. agus Liu, H. (2022) 'Micribhithóim de dheannach aeir a bailíodh le linn an turgnaimh dhúnta tacaíochta beatha bith-athghiniúna "Lunar Palace 365"', Micribhithóim Comhshaoil, 17(1), lgh. 1–20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
Ceann, S. et al. (2022) 'An raidhse bunábhar-spleách de ghéinte feidhmiúla a bhaineann le claochlú nítrigine caillteanas nítrigine rialaithe i múiríniú', Bioresource Technology, 361, lch. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
