Géanómaíocht 10x Transcriptome spásúil Visium
Scéim theicniúil
Bheith
● Rún: 100 µm
● Trastomhas Spota: 55 µm
● Líon na spotaí: 4992
● Limistéar gabhála: 6.5 x 6.5 mm
● Tá gach láthair bharrachódaithe luchtaithe le primers atá comhdhéanta de 4 chuid:
- Tail Phola (DT) le haghaidh priming mRNA agus sintéis cDNA
- Aitheantóir móilíneach uathúil (UMI) chun claontacht aimplithe a cheartú
- barrachód spásúil
- Seicheamh ceangailteach de phríomhaí seicheamhaithe páirteach 1 seicheamhú
● Staining rannóga H&E
Buntáistí
●Seirbhís aon-stad.
● Foireann theicniúil ardoilte.
●Nuashonrú fíor-ama ar an tionscadal iomlán: le rialú iomlán ar dhul chun cinn turgnamhach.
●Bithfhaisnéisíocht chaighdeánach chuimsitheach:Cuimsíonn an pacáiste 29 anailís agus 100+ figiúr ardcháilíochta.
●Anailís agus léirshamhlú sonraí saincheaptha: Ar fáil le haghaidh iarrataí taighde éagsúla.
●Comh-anailís roghnach le seicheamhú mRNA aonchille
Sonraíochtaí Sonraíochtaí
| Riachtanais samplacha | Leabharlann | Straitéis seicheamhaithe | Sonraí Molta | Rialú cáilíochta |
| Samplaí Cryo Emmedded Deireadh Fómhair (Trastomhas is fearr: thart ar 6x6x6 mm³) 2 bhloc in aghaidh an tsampla | Leabharlann 10x Visium cDNA | Illumina PE150 | Léann 50k Corpoideachas in aghaidh an spota (60GB) | Rin> 7 |
Le haghaidh tuilleadh sonraí ar threoir ullmhúcháin samplacha agus sreabhadh oibre seirbhíse, bíodh leisce ort labhairt leSaineolaí BMKGENE
Sreabhán oibre
Sa chéim ullmhúcháin samplacha, déantar triail eastósctha mórchóir RNA chun a chinntiú gur féidir RNA ardcháilíochta a fháil. Sa chéim optamaithe fíochán déantar na rannóga a dhathú agus a shamhlú agus déantar na coinníollacha permeabilization le haghaidh scaoileadh mRNA a bharrfheabhsú ó fhíochán. Cuirtear an prótacal optamaithe i bhfeidhm ansin le linn tógáil leabharlainne, agus ina dhiaidh sin seicheamhú agus anailís sonraí.
Is éard atá i gceist leis an sreabhadh oibre iomlán seirbhíse ná nuashonruithe fíor-ama agus deimhnithe cliant chun lúb aiseolais sofhreagrach a choinneáil, ag cinntiú forghníomhú réidh tionscadail.
Áirítear leis an anailís seo a leanas:
Rialú cáilíochta sonraí:
o Aschur Sonraí agus Dáileadh Scór Cáilíochta
o Braite géine in aghaidh an spota
o clúdach fíochán
Anailís ar an sampla istigh:
o saibhreas géine
o Cnuasú spot, lena n -áirítear anailís toisí laghdaithe
o Anailís ar léiriú difreálach idir braislí: géinte marcóra a aithint
o Nótaí feidhme agus saibhriú géinte marcóra
Anailís idirghrúpa
o Ath-chomhcheangal spotaí ón dá shampla (m.sh. galraithe agus rialú) agus ath-chnuasach
o géinte marcóra a aithint do gach braisle
o Nótaí feidhme agus saibhriú géinte marcóra
o Léiriú difreálach ar an mbraisle chéanna idir grúpaí
Anailís Sampla istigh
Cnuasach spot
Aithint Géinte Marker agus Dáileadh Spásúil
Anailís idirghrúpa
Teaglaim sonraí ó ghrúpaí agus ó ath-chnuasach araon
Géinte marcóra de chnuasaigh nua
Déan iniúchadh ar na dul chun cinn a éascaíonn seirbhís athscríofa spásúlachta BMKGENE ag 10x Visium sna foilseacháin seo:
Chen, D. et al. .Imeachtaí Acadamh Náisiúnta na nEolaíochtaí i Stáit Aontaithe Mheiriceá, 120 (30), lch. E2303462120. doi: /10.1073/pnas.2303462120
Chen, Y. et al. .Faisnéise i mbithfhaisnéisíocht, 24 (2), lgh. 1–10. doi: 10.1093/bib/bbad068.
Liu, C. et al. (2022) 'Atlas spatiotemporal de organogenesis i bhforbairt bláthanna magairlín',Taighde ar Aigéid Núicléasacha, 50 (17), lgh. 9724–9737. doi: 10.1093/NAR/GKAC773.
Wang, J. et al. .Iris Idirnáisiúnta na nEolaíochtaí Bitheolaíochta, 19 (8), lgh. 2515–2530. doi: 10.7150/ijbs.83510.
