Heule transkripleaze sekwinsje - Illumina
Funksjes
● Dual Bibleteek om it folsleine transkripde te folgjen: RRNA-útpakke folge troch PE150 Bibleteek tarieding en selection Folgje troch SEPTE TEPLOADING
● Folsleine Bioynformatyk-analyse fan Mrna, LNCRNA, Circrna, en Mirna yn aparte Bioinformatika rapportearje
● Montanalyse fan alle RNA-útdrukking yn in kombineare rapport, ynklusyf analyse fan CERNA netwurken.
Tsjinstbewusteens
●Yngeande analyse fan regeljouwing netwurken: Analyse fan CERNA wurdt ynskeakele troch de joint sequencing fan Mrna, LNCRNA, Circrna, en Mirna en troch in útputtende Bioynformatyske wurkstream.
●Wiidweidige annotaasje: Wy brûke meardere databases om de ferskillende útdruklike genen (degs) te annotearjen en de korrespondearjende ferrykensanalyse út te fieren, ynsjoch yn 'e sellulêre en molekulêre prosessen ûnder te fieren ûnderlizzend ûnderlingen.
●Wiidweidige ekspertize: Mei in spoarrekord fan suksesfol sluten oer 2100 heule transkriptjemde projekten yn ferskate ûndersyksmomein bringt ús team in rykdom oan ûnderfining oan elk projekt.
●Rigorous kwaliteitskontrôle: Wy ymplementearje kearnkontrôle punten oer alle stadia, út foarbyld en biblioteek om tarieding op sequencing en biopformatika. Dizze nauwe monitoaring soarget foar de levering fan konsekwint resultaten fan hege kwaliteit.
●Support foar post-ferkeap: Us tawijing wreidet útwreidet bûten it foltôgjen fan projekt mei in tsjinstperioade fan 3 moannen. Yn dizze tiid biede wy Project-up-up-up-up-up-up, troubleshooting, en Q & A-sesjes om te adressearjen relatearre oan 'e resultaten
Sample-easken en levering
| Biblioteek | SEQUCING STRATEGY | Gegevens oanrikkemandearre | Kwaliteitskontrôle |
| RRNA útpurrearre | Illumina pe150 | 16 GB | Q30 ≥85% |
| Grutte selekteare | Illumina Seeps | 10-20m lêst |
Foarbyldkeasken:
Nucleotiko's:
| CONC. (NG / μL) | Bedrach (μg) | Suverens | Yntegriteit |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | Od260 / 280 = 1,7-2.5 Od260 / 230 = 0.5-2.5 Beheind as gjin proteïne as DNA-fersmoarging werjûn op gel. | Rin≥6.0 5.0≥260 / 18s 60.0; beheind as gjin innelderige hichte |
Oanbefellende foarbyld levering
Container: 2 ml centrifuge buis (tin folie is net oan te rieden)
Sample etiketten: Groep + replika, bygelyks A1, A2, A3; B1, b2, b3.
Ferstjoering:
1. Droech-iis: samples moatte ynpakt wurde yn sekken en begroeven yn droech iis.
2 Rnastable buizen: RNA-samples kinne wurde droege yn RNA-stabilisaasjeblok (bgl. Rnastable®) en ferstjoerd by keamertemperatuer.
Tsjinstwurkstream
Eksperimintûntwerp
Sample levering
RNA-ekstraksje
Biblioteek konstruksje
Sequencing
Gegevensanalyse
Tsjinsten foar neisoarch
Bioinformatika
RNA Expression oersjoch
Ferskillende útdrukt genen
Cerna Analyse
Ferskillend útdrukt Mirnas en besibbe Rnas
Ferkenne de excides-avideminten foar ûndersyk Faciliteare troch de heule transkripleaze tsjinsten fia in skriklike samling fan publikaasjes.
Dai, Y. et al. (2022) 'Compleyle Expressioniles fan Mrnas, LNCRNas en Mirnas yn Kashin-Beck-sykte identifisearre troch RNA-sequencing', Molekula OMICS, 18 (2) PP. 154-166. Doi: 10.1039 / D1mo00370D.
Liu, N. Nan et al. (2022) 'Folsleine lingte transkriptearje fan analyse fan kâld-ferset fan APIS CERANA yn Changbai-berch tidens overwinteringsperioade.', Gene, 830, pp. 146503-146503. Doi: 10.1016 / J.Ge.2022.146503.
Wang, XJ et al. (2022) 'Multi-Omics yntegraasje-basearre prioritaasje fan konkurrinsje fan endogeaze RNA-regeljouwing netwurken yn lytse sel longkanker: molekulêre skaaimerken en drugsandidaten', frontiers yn onkology, 12, s. 904865. Doi: 10.3389 / fonc.2022.904904865 / bibtex.
Xu, P. et al. (2022) 'yntegreare analyse fan' e progressyf fan Crna / Circcrna-mirna-mirna-mir-ynsjoch iepenet yn potinsjele meganismen op root-knot nematoden yn peanut ', BMC-genomika, 23 (1), pp. 1-12. Doi: 10.1186 / S12864-022-08470-3 / figueren / 7.
Yan, Z. et al. (2022) 'HELD-transkripde rNA-sequencing markeart de molekulêre meganismen dy't assosjeare is mei it ûnderhâld fan posthaarskwaliteit yn broccoli troch reade LED-bestraling', postdarvest biology en technology, 188, p. 111878. DOI: 10.1016 / J.Postharvbio.2022.111878.
