WGS (Nanopore)

Folsleine genoom opnij sequencing mei Nanopore is in populêre metoade foar it identifisearjen fan genomyske farianten, benammen strukturele farianten (SV's), dy't krekter wurde neamd troch lange-lêzen sequencing dan troch koarte-read-sequencing. De BMKCloud TGS-WGS (Nanopore) pipeline is ûntworpen om gegevens te analysearjen fan WGS-projekten mei Nanopore mei in heechweardich, goed annotearre referinsjegenoom. De analyze begjint mei lêzen trimmen en kwaliteitskontrôle, folge troch ôfstimming nei it referinsjegenoom, SV-oprop en troch funksjonele annotaasje fan SV-assosjearre genen mei meardere databases.