Lytse RNA Sequencing-Illumina
Funksjes
● Biblioteek tarieding omfettet in stap fan grutte seleksje
● Bioynforatyske analyse sintraal om Mirna-foarsizzing en har doelen
Tsjinstbewusteens
●Wiidweidige bioinformatika-analyse:De identifikaasje ynskeakelje fan sawol bekende as roman, identifikaasje fan Mirnas-doelen, en korrespondearjende funksjonele annotaasje en ferriking mei meardere databases (Kegg, Go)
●Rigorous kwaliteitskontrôle: Wy ymplementearje kearnkontrôle punten oer alle stadia, út foarbyld en biblioteek om tarieding op sequencing en biopformatika. Dizze nauwe monitoaring soarget foar de levering fan konsekwint resultaten fan hege kwaliteit.
●Support foar post-ferkeap: Us tawijing wreidet útwreidet bûten it foltôgjen fan projekt mei in tsjinstperioade fan 3 moannen. Yn dizze tiid biede wy Project Follow-Up, Troubleshooting by it oplossen fan assistinsje, en Q & A-sesjes om te adressearjen relatearre yn ferbân mei de resultaten.
●Wiidweidige ekspertize: Mei in spoarrekord fan suksesfol sluten oer meardere Srna Srna-projekten oer 300 soarten yn ferskate ûndersyksdomen bringt ús team in rykdom oan ûnderfining oan elk projekt.
Sample-easken en levering
| Biblioteek | Perron | Oanbefellende gegevens | Gegevens QC |
| Grutte selekteare | Illumina Seeps | 10m-20m lêst | Q30 ≥85% |
Foarbyldkeasken:
Nucleotiko's:
| CONC. (NG / μL) | Bedrach (μg) | Suverens | Yntegriteit |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | Od260 / 280 = 1,7-2.5 Od260 / 230 = 0.5-2.5 Beheind as gjin proteïne as DNA-fersmoarging werjûn op gel. | Rin≥6.0; 5.0≥260 / 18s 60.0; beheind as gjin innelderige hichte |
● planten:
Woartel, stam as petalje: 450 mg
Blêd as sied: 300 mg
Fruit: 1,2 g
● Dier:
Hert as darm: 450 mg
Viscera as harsens: 240 mg
Spier: 600 mg
Bonken, hier as hûd: 1,5g
● arthropods:
Ynsekten: 9g
Crustacea: 450 mg
● heule bloed: 2 buizen
● Cells: 106 sellen
● Serum en plasma:6 ml
Oanbefellende foarbyld levering
Container: 2 ml centrifuge buis (tin folie is net oan te rieden)
Sample etiketten: Groep + replika, bygelyks A1, A2, A3; B1, b2, b3.
Ferstjoering:
1. Droech-iis: samples moatte ynpakt wurde yn sekken en begroeven yn droech iis.
2. Rnastable buizen: RNA-samples kinne wurde droege yn RNA-stabilisaasjebuis (bgl. Rnastable®) en ferstjoerd yn keamertemperatuer.
Tsjinstwurkstream
Eksperimintûntwerp
Sample levering
RNA-ekstraksje
Biblioteek konstruksje
Sequencing
Gegevensanalyse
Tsjinsten foar neisoarch
Bioinformatika
● RAW gegevenskontrôle fan gegevens
● Srna-klassifikaasje
● Alignment nei in referinsje Genome
● Identifikaasje fan bekende en roman Mirna
● Differentriale Mirna-útdrukking analyse
● Funksjonele annotaasje fan Mirna-doelen
Identifikaasje fan Mirna: struktuer en djipte
Differinsjaal útdrukking fan Mirna - Hiearchical Clustering
Funksjoneel annotaasje fan doel fan it tank dat ferlet fan Mirnas útdrukt
Ferkenne de Faciliteare foar Undersyk Avides-fasiliteare troch Bmkgene 'Srna Sequencing Tsjinsten fia in skriklike samling publikaasjes.
Chen, H. et al. (2023) 'Viral Intyctions Inhibit Saponin Biosynthese and fotosynthese in Panax Notoginseng', plant fysiology en biochemistry, 203, s. 108038. DOI: 10.1016 / J.PRAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'The Plant FYVE DOMAIN-befette Protein FREE1 Associates mei mikroprocessorkomminten om Mirna biogenesis te repressearjen, 9 Embo rapporten, 24 (1). doi: 10.15252 / embr.202255037 / suppor_file / embr20255037-sup-0004-sdatafig4.tif.
Yu, J. et al. (2023) 'The Microna Ame-Bantam-3P Controls Larval Pupy Untwikkeling fan it meardere Epidermale groei - lykas domeinen 8 Gene (Megf8) yn' e Honeybee, APIS Mellifera ', ynternasjonale tydskrift fan Molekular Wittenskippen, 24 (6), P . 5726. DOI: 10.3390 / IJMS24065726 / S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'yntegreare analyse fan mirna en genen assosjeare mei fleiskwaliteit iepenbiere dat gga-mir-140- ynfloed op intramuskulêre fette, sellulêre fysiology en biochemistyk, 46 (6). 2421-2433. Doi: 10.1159 / 000489649.
