Heathmap
It heatmap-ark aksepteart in matrix-gegevensbestân as ynfier en lit brûkers om gegevens te filterjen, te normalisearjen en te krûpen. It primêre gebrûksaak foar Heatmaps is cluster analyse fan 'e uttespanning nivo tusken ferskate samples.
Gene Annotaasje
It genanner fan Gene Annotation docht gene annotaasje basearre op sekwinsje-ôfstimming fan ynfierfast-bestannen tsjin ferskate databases.
Basis lokaal oplaadykopslach (blast)
It blastynstrumint is in bemkcled-yntegreare ferzje fan NCBI Blast en kin brûkt wurde om deselde funksjes út te fieren mei gegevens dy't opwurdearre oan it BMKCloud-akkount.
CDS_UTR-foarsizzing
It CDS_UTR-foarsizzing is ûntworpen om regio's te foarsizzen (CD's) en net-kodearjende regio's (UTR) yntsjutte transkriptbejilden op basis fan BEGINNE DATABASE EN ORF-foarsizzing útkomsten.
Manhattan Plot
It minsklike plot-ark ynskeakelje werjefte fan eksperiminten mei hege stampen en wurdt faak brûkt yn stúdzjes fan Genome-brede (gwas).
Circs Diagram
It Circos Diiram-ark leveret effisjinte fisualisaasje fan hoe genomyske funksje wurdt ferdield oer it genoom. Common funksjes omfetsje kwantitative loci, snps, wykein, strukturele en kopiearje getalfarianten.
Gene ontology (Go) Enrichment
It ark fan 'e go-ferrykens leveret funksjoneel-analyse. De primêre software yn dit ark is it boppekant fan 'e topgo-bioconductor, dy't omfettet analyse omfettet, gean ferrykensanalyse en fisualisaasje fan' e resultaten.
Gewichtige Gene CO-EXPRESPRESPER NETWERSYSE (WGCNA)
WGCNA is in breed brûkte gegevensmodyk foar gegevens foar it ûntdekken fan modules fan Gene-co-útdrukking. It is fan tapassing op ferskate útdrukking dataset ynklusyf mikrarray en NGS-Útsûndere gegevens.
Ynterproscan
It ynterproscan-ark leveret ynterpro foar ynterpro Protein Sequence analyse en klassifikaasje.
Gean Kegg-ferriking
It histogram fan 'e kegg-ferrykens is om in histogram fan Kegg te generearjen, histogram te generearjen, Kegg Enrichthens histogram en Kegg Enrichment-paad basearre op in levere genêzend annotaasje.