
Transkripte fan Pacbio Folsleine lingte
Pacbio-transkripleaze sequcing, IsoseQ, kinne krekte identifikaasje fan transkript isofriek, skodzje ljocht op alternative polyadenylaasje en splicearjend en liedend ta mear krekte genprekkende analyse. De Bammcled Pacbio-transkripde-pipeline is ûntworpen om CDNA-biblioteken te analysearjen en net-chimeryske net-chimeric te analysearjen en identifisearret net-chimeric (FLNC)-sekonden, dy't wurde klustere, yn net-redundante transkripsjes. In folgjende Busco-analyse beoardielet de folsleinens fan 'e transkripleaze gearkomst. Fanôf it gearstalde transkripde wurde meardere analyses útfierd: Alternative splicing, Simple Sequence Werhelje (SSR), en korrespondearing fan 'e romisaasje fan romisaasjeanal, oergongsfaktoaranalyse, transkinsjale analyse, en funksjonele annotaasje.
Bioinformatika
