Metagenomics (NGS)

Shotgun metagenomics mei illumina is in populêr ark foar studearjen troch mikrobiomen troch direkt te besykjen dna út komplekse samples, ynskeakelje de stúdzje fan beide taksonom en funksjonele ferskaat. De Pipeline fan BmkCloud (NGS) Pipeline begjint mei kwaliteitskontrôle, wêrfan it moete-genen wurde foarsizze en klusteren yn net-redundante data's binne foar funksje en taksonomy fan meardere databases. Dizze ynformaasje wurdt brûkt om binnen-stekproef-thivonomyske ferskaat te analysearjen (Alpha Diversity) en tusken-sampter-ferskaat (Beta-ferskaat). Differinsjaal analyse tusken groepen fynt Otus en Biologyske funksjes dy't ferskille dy't ferskille mei sawol parametryske en net-parametryske testen, wylst korrelaasje-analyse dizze ferskillen relateart oan miljeufaktoaren.