DNBSEQ pre-makke biblioteken
Features
●Perron:MGI-DNBSEQ-T7
●Sequence modes:PE150
●Oerdracht fan Illumina bibleteken neiMGI:it ynskeakeljen fan sequencing fan hege gegevens folume tsjin lege kosten.
●Kwaliteitskontrôle fan biblioteken foardat sequencing.
●Folgjende gegevens QC en levering:levering fan QC rapport en rauwe gegevens yn fastq opmaak nei demultiplexing en filterjen Q30 reads.
Foardielen
●Veelzijdigheid fan sequencing tsjinsten:de klant kin kieze om te foltôgjen troch baan of hoemannichte gegevens.
●Hege gegevensútfier:1500 Gb/baan
●Levering fan folchoarder QC rapport:mei kwaliteitsmetriken, gegevenskrektens en algemiene prestaasjes fan it sequencing-projekt.
●Mature sequencing proses:mei koarte omlooptiid.
●Rigorous Quality Control: wy implementearje strange QC-easken om de levering fan konsekwint heechweardige resultaten te garandearjen.
Sample Requirements
| Gegevensbedrach (X) | Konsintraasje (qPCR/nM) | Folume | |
| Partial Lane
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Single Lane | Per Lane | ≥ 1,5 nM / Biblioteekpool | ≥ 25 μl / Biblioteekpool |
Neist konsintraasje en totale bedrach is ek in gaadlik pykpatroan nedich.
Opmerking: Lane-sekwinsje fan biblioteken mei leech ferskaat fereasket PhiX-spike-in om robúste basisoprop te garandearjen.
Wy riede oan om pre-poolde bibleteken as foarbylden yn te tsjinjen. As jo nedich BMKGENE foar in útfiere biblioteek pooling, nim dan ferwize nei de
biblioteek easken foar in part lane sequencing.
Biblioteekgrutte (Pykkaart)
De wichtichste peak moat binnen 300-450 bp wêze.
Biblioteken moatte ien haadpiek hawwe, gjin adapterfersmoarging en gjin primerdimers.
Service Workflow
Biblioteek QC rapport
In rapport oer de kwaliteit fan 'e bibleteek wurdt levere foardat sequencing, beoardieling fan biblioteekbedrach en fragmintaasje.
Sequencing QC rapport
Tabel 1. Statistiken op sekwinsje gegevens.
| Sample ID | BMKID | Raw lêst | Raw Data (bp) | Skjin lêzen (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
figuer 1. Kwaliteit ferdieling lâns lêzen yn eltse stekproef
figuer 2. Basis ynhâld distribúsje
figuer 3. Ferdieling fan lêzen ynhâld yn sequencing gegevens
