● Mei twa mooglike opsjes om te kiezen út ôfhinklik fan 'e winske graad fan genochke folsleinens.
● Untwerp Genome-opsje: Koarte lêzen fan koarte lês mei Illumina Novaseq Pe150.
● Folje 0 GAP Genome.
● Longlês sequencing op Nanopore Prometion 48 of Pacbio Revio foar genome gearkomst.
● Koartslêzen sequencing op Illumina Novaseq foar genoomige falidaasje en flaterkorreksje (Nanopore) of om in konsept genoom te generearjen.
●Nul-gap genome garandearre: Dit komt troch de yntegraasje fan Illompina Sequencing mei lange lêzen sequencing (Nanopore of Pacbio).
●Folsleine wurkstream foar Bioinformatika:Dit omfettet Genome Gearkomst en foarsizzing fan meardere genomyske eleminten, funksjonele genanner, en genooch visualisaasjes lykas sirkus plot.
●Wiidweidige ekspertize: Mei mear dan 20.000 mikrobiaal gearstald bringt Bmkgene in desennium fan ûnderfining bringt, in heul feardigensdealyspele, wiidweidige ynhâld, en poerbêste post-ferkeap-stipe.
●Support foar post-ferkeap:Us tawijing wreidet út bûten de foltôging fan projekt mei in 3-moanne nei-Sale Service Perioade. Yn dizze tiid biede wy Project Follow-Up, Troubleshooting by it oplossen fan assistinsje, en Q & A-sesjes om te adressearjen relatearre yn ferbân mei de resultaten.
●Meardere sequencing Strategyen beskikber:Foar ferskate ûndersyksdoelen en easken fan Genome folsleinens.
Tsjinst | SEQUCING STRATEGY |
Draft genoom | Illumina Pe150 100x |
0 Gap Genome | Nanopore 100x + Illumina Pe150 100x Or Pacbio Hifi 30x + Illumina Pe150 100x (opsjoneel) |
Konsintraasje (NG / μL) | Totaal bedrach (μg) | Folume (μL) | Od260 / 280 | Od260 / 230 | |
Pacbio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1,7-2.2 | ≥1.0 |
Nanopore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1,7-2.2 | 1.0-3.0 |
Illumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Baktearje: ≥3.5x1010 sellen
Omfettet de folgjende analyse:
● SEQUENCING BATTJOCHTWITALING CONTROL
● Genome Assembly
● Genich komponint-analyse: foarsizzing fan CD's en meardere genomyske eleminten
● Funksjonele annotaasje mei meardere algemiene databases (gean, kegg, etc) en avansearre databases (kaart, VFDB, ETC)
● Genich visualisaasje
Wy leverje it genoom yn in maklik tagonklik Fasta-formaat en it Genome Annotation-bestân (GFF).
Gene annotaasje - GO
Gene annotaasje - Cazy Carbohydrates
Genich Visualisaasje - Circos Plot
Ferkenne de avacements Faciliteare troch de baktearjele genobere assemblage-tsjinsten fia in genêde kolleksje fan publikaasjes.
Dai, W. et al. (2023) 'Discovery of bakteroïde uniformis f18-22 as in feilige en romanprobiotyske baktearje foar de behanneling foar de behanneling fan ulcerative kolitis fan' e sûne minsklike kolon ',Ynternasjonaal tydskrift fan Molekulêre Wittenskippen, 24 (19), p. 14669. Doi: 10.3390 / ijms241914669 / S1.
Kang, Q. et al. (2021) 'Multidrug-resistint Proteus Mirabilis isolates mei blaooxa-1 en BLANDM-1 fan Wildlife yn China: Taheakke risiko's tanimmende risiko's,Integrative zoology, 16 (6), PP. 798-809. Doi: 10.1111 / 1749-4877.12510.
Wang, TT et al. (2017) 'Folsleine genoemige sekwinsje fan endophyte Bacillus Flexus Klbmp 4941 ûntbleatet har plantigrôarismeganisme en genetyske basis foar sâlt tolerânsje',Journal of Biotechnology, 260, PP. 38-41. Doi: 10.1016 / JJ.Jbiotec.2017.09,001.
Wang, X. et al. (2021) 'meardere-republyk-fersoarging plasmids fan Klebsiella-mediate wiidweidige fersprieding fan antimikrobyske genen'Frontiers yn mikrobiology, 12, p. 754931. DOI: 10.3389 / FMICB.2021.754931 / bibtex.