16S / 18s / syn amplicon Sequencing-Pacbio
Tsjinstfunksjes
● Sequencing Platform: Pacbio Revio
● SEQUCING MODE: CCS (HIFI LEADS)
● Amplifikaasje fan Doelregio folge troch Tandem-keppeling fan Amplicons foardat Hifi Smt Bell-biblioteek taryf
Tsjinstbewusteens
●Hegere taksonomyske resolúsje: tHan Short-Amplicon Sequencing,ynskeakelje hegere klassifikaasjes foar OTU-klassifikaasje op it soarte nivo.
●Heech krekte basisoproppen: Pacbio CCS-modus sequencing (HIFI Reads).
●Isolaasje-frij: RAPID IDENTIFIKASJE FAN MICROTIALE GEBLOAK IN MILLUBLUEBOPEN.
●Breed fan tapassing: Diverse mikrobiale mienskipstúdzjes.
●Wiidweidige Bioynforatyske analyse: It lêste QIIME2-pakket (kwantitative ynsjoch yn mikrobiaal ecology) mei ferskaat analyses yn termen fan database, annotaasje, otu / asv.
●Wiidweidige ekspertize: Mei tûzenen Amplicon fertelde projekten jierliks, bringt Bmkgene in desennium fan ûnderfining oer, in heul feardigens-team, wiidweidige ynhâld, en poerbêste post-ferkeap-stipe.
Tsjinstspesifikaasjes
| Biblioteek | SEQUCING STRATEGY | Gegevens oanrikkemandearre |
| Amplicon | Pacbio Revio | 10/30/50 K Tags (CCS) |
Foarbyldfeediening
| Konsintraasje (NG / μL) | Totaal bedrach (μg) | Folume (μL) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
Oanbefellende foarbyld levering
Befriest de samples yn floeibere stikstof foar 3-4 oeren en bewarje yn floeibere stikstof as -80-graad nei reservearring op lange termyn. Sample ferstjoere mei droech iis is fereaske.
Tsjinstwurkstream
Sample levering
Biblioteek konstruksje
Sequencing
Gegevensanalyse
Tsjinsten foar neisoarch
Omfettet de folgjende analyse:
● RAW gegevenskontrôle fan gegevens
● OTU Clustering / DE-NOISE (ASV)
● Otu Annotaasje
● Alpha Diversity Analyse: Meardere yndeksen, ynklusyf Shannon, Simpson en Ace.
● Beta-ferskaat-analyse
● Analyse fan intergroep
● Korrelaasjeanalyse: tusken omjouwing fan miljeufaktoaren en út komposysje en ferskaat
● 16s funksjoneel genefoordeling
Histogram fan taxonomyske ferdieling
Community Distribution PhyLogenic Tree
Alpha Diversity Analyse: Ace
yndeks
Beta-ferskaat analyse: Pcoa
Intergroup Analyse: Anova
Ferkenne de avideminten Faciliteare troch de amplicon fan Bmkgene Severcing Tsjinsten mei Pacbio fia in skriklike samling publikaasjes.
Gao, X. En Wang, H. (2023) 'Fergeliking-analyse fan Rumen baktearjele profilen en funksjes tidens adaption nei ferskate fenology) yn Alpine Merino skiep mei twa groeiende stadia op in Alpine Meadow', fermentaasje, 9 ( 1), p. 16. DOI: 10.3390 / fermentaasje9010016 / S1.
LI, S. et al. (2023) 'Capture de mikrobiaal-saak yn woastyngrûn mei CouTuromics-basearre MetaSolics-analyse', NPJ BIOFILMS EN MICROBIMES 2023 9: 1 (), PP. 1-14. Doi: 10.1038 / S41522-023-00439-8.
Mu, L. et al. (2022) 'Effekten fan Fatty Acid Salts op fermenti-skaaimerken en aerobyske stabiliteit fan mingde goaire taret mei alfalfa, rydbalke', tydskrift fan 'e wittenskip en lânbou, 102 (4). 1487. Doi: 10.1002 / jsfa.11482.
Yang, J. et al. (2023) 'De ynteraksje tusken oksidative stress Biomarders en darm mikrobiota yn' e anty -xidante effekten fan ekstrakten fan Sonchus Brachyotus DC. Yn Oxazolone-induzeare darm oksidative stress yn folwoeksen Zebrafal ', AntiOxidants 2023, Vol. 12, pagina 192, 12 (1), p. 192. DOI: 10.3390 / Antiox12010192.
