Petit séquençage d'ARN-illumine
Caractéristiques
● La préparation de la bibliothèque comprend une étape de sélection de taille
● Analyse bioinformatique centrée sur la prédiction des miARN et leurs cibles
Avantages de service
●Analyse complète de la bioinformatique:Permettant l'identification des miARN connus et nouveaux, l'identification des cibles miARN et l'annotation fonctionnelle correspondante et l'enrichissement avec plusieurs bases de données (Kegg, GO)
●Contrôle de la qualité rigoureux: Nous mettons en œuvre des points de contrôle principaux à toutes les étapes, de la préparation des échantillons et de la bibliothèque au séquençage et à la bioinformatique. Cette surveillance méticuleuse garantit la livraison de résultats de haute qualité toujours de haute qualité.
●Support post-vente: Notre engagement s'étend au-delà de l'achèvement du projet avec une période de service après-vente de 3 mois. Pendant ce temps, nous offrons un suivi du projet, une assistance de dépannage et des séances de questions-réponses pour répondre à toutes les requêtes liées aux résultats.
●Expertise approfondie: Avec une expérience de la fermeture avec succès de plusieurs projets d'ARNs couvrant plus de 300 espèces dans divers domaines de recherche, notre équipe apporte une richesse d'expérience à chaque projet.
Exemples d'exigences et de livraison
| Bibliothèque | Plate-forme | Données recommandées | Données QC |
| Taille sélectionnée | Illumina SE50 | Lectures de 10m à 20m | Q30 ≥ 85% |
Exemples d'exigences:
Nucléotides:
| Conc. (Ng / μl) | Quantité (μg) | Pureté | Intégrité |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260 / 280 = 1,7-2,5 OD260 / 230 = 0,5-2,5 Contamination limitée ou non protéique ou ADN montré sur le gel. | Rin ≥ 6,0; 5.0≥28s / 18S ≥ 1,0; Élévation limitée ou non de référence |
● Plantes:
Racine, tige ou pétale: 450 mg
Feuille ou graine: 300 mg
Fruit: 1,2 g
● Animal:
Cœur ou intestin: 450 mg
Viscères ou cerveau: 240 mg
Muscle: 600 mg
Os, cheveux ou peau: 1,5 g
● Arthropodes:
Insectes: 9g
Crustacea: 450 mg
● sang total: 2 tubes
● Cellules: 106 cellules
● Sérum et plasma:6 ml
Livraison d'échantillon recommandée
Récipient: 2 ml de tube à centrifugeuse (la papier d'étain n'est pas recommandée)
Exemple d'étiquetage: groupe + réplique par exemple A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Expédition:
1. Face sèche: les échantillons doivent être emballés dans des sacs et enterrés dans la glace sèche.
2. Tubes raastables: les échantillons d'ARN peuvent être séchés dans un tube de stabilisation de l'ARN (par exemple RNastable®) et expédiés à température ambiante.
Flux de travail de service
Conception d'expérience
Livraison d'échantillons
Extraction de l'ARN
Construction de la bibliothèque
Séquençage
Analyse des données
Services après-vente
Bioinformatique
● Contrôle de qualité des données brutes
● Classification de l'ARNA
● Alignement sur un génome de référence
● Identification du miARN connu et nouveau
● Analyse de l'expression de miARN différentielle
● Annotation fonctionnelle des cibles miARN
Identification du miARN: structure et profondeur
Expression différentielle de miARN - clustering hiarchical
Annotation fonctionnelle de la cible des miARN exprimés différentiellement
Explorez les progrès de la recherche facilités par les services de séquençage de l'ARNs de BMKGene grâce à une collection organisée de publications.
Chen, H. et al. (2023) «Les infections virales inhibent la biosynthèse et la photosynthèse de la saponine dans le notoginseng de Panax», Plant Physiology and Biochemistry, 203, p. 108038. Doi: 10.1016 / j.plaphy.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) «La FREE de protéines contenant le domaine de la plante Fyve s'associe aux composants du microprocesseur pour réprimer la biogenèse miRNA», Embo Reports, 24 (1). doi: 10.15252 / embr.202255037 / Suppl_file / embr202255037-Sup-0004-Sdatafig4.tif.
Yu, J. et al. (2023) «Le microARN AME-BANTAM-3P contrôle le développement du pupal larvaire en ciblant les domaines multiples de type facteur de croissance épidermique 8 (Megf8) dans l'abeille, Apis mellifera», International Journal of Molecular Sciences, 24 (6), P . 5726. Doi: 10.3390 / ijms24065726 / s1.
Zhang, M. et al. (2018) 'L'analyse intégrée des miARN et des gènes associés à la qualité de la viande révèle que le GGA-MIR-140-5p affecte le dépôt de graisse intramusculaire chez les poulets, la physiologie cellulaire et la biochimie, 46 (6), pp. 2421-2433. doi: 10.1159 / 000489649.
