Petit ARN

Les petits ARN sont des ARN courts non codants avec une longueur moyenne de 18 à 30 nt, y compris les miARN, siRNA et pirna, qui jouent un rôle important dans les processus de régulation. Le pipeline SRNA BMKCloud fournit une analyse standard et personnalisée pour l'identification des miARN. Après la coupe de lecture et le contrôle de la qualité, les lectures sont alignées sur plusieurs bases de données pour classer les ARNs et sélectionner les miARN et mappés au génome de référence. Les miARN sont identifiés sur la base de bases de données miRNA connues, fournissant des informations sur la structure secondaire, la famille des miARN et les gènes cibles. L'analyse de l'expression différentielle identifie les miARN exprimés différentiellement et les gènes cibles correspondants sont fonctionnellement annotés pour trouver des catégories enrichies.