Le transcriptome est le lien entre les informations génétiques génomiques et le protéome de la fonction biologique. La régulation au niveau transcriptionnel est le mode de régulation le plus important et le plus largement étudié des organismes. Le séquençage du transcriptome peut séquencer le transcriptome à tout moment ou dans n'importe quelle condition, avec une résolution précise à un seul nucléotide. Échantillon de transcriptions spécifiques.
À l'heure actuelle, la technologie de séquençage des transcriptomes a été largement utilisée dans l'agronomie, la médecine et d'autres domaines de recherche, notamment la régulation du développement animal et des plantes, l'adaptation environnementale, l'interaction immunitaire, la localisation des gènes, l'évolution génétique des espèces et la détection des maladies tumorales et génétiques.