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Produits

Séquençage de l’exome humain entier

Le séquençage de l’exome entier humain (hWES) est largement reconnu comme une approche de séquençage rentable et puissante pour identifier les mutations pathogènes. Bien qu’ils ne constituent qu’environ 1,7 % du génome total, les exons jouent un rôle crucial en reflétant directement le profil des fonctions totales des protéines. Notamment, dans le génome humain, plus de 85 % des mutations liées à des maladies se manifestent dans les régions codantes pour les protéines. BMKGENE propose un service complet et flexible de séquençage de l'exome humain entier avec deux stratégies différentes de capture d'exons disponibles pour répondre à divers objectifs de recherche.


Détails des services

Résultats de la démonstration

Caractéristiques des services

● Deux panels d'exome disponibles basés sur l'enrichissement de cibles avec des sondes : Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) et xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).

● Séquençage sur Illumina NovaSeq.

● Pipeline bioinformatique orienté vers l'analyse de maladies ou l'analyse de tumeurs.

Avantages des services

Cible la région codante pour les protéines: En capturant et en séquençant les régions codantes pour les protéines, hWES est utilisé pour révéler des variantes liées à la structure des protéines.

Rentable :Le hWES produit environ 85 % des mutations associées aux maladies humaines sur 1 % du génome humain.

Haute précision: Avec une profondeur de séquençage élevée, hWES facilite la détection à la fois des variantes courantes et des variantes rares avec des fréquences inférieures à 1 %.

Contrôle qualité rigoureux: Nous mettons en œuvre cinq points de contrôle principaux à toutes les étapes, de la préparation des échantillons et des bibliothèques au séquençage et à la bioinformatique. Ce suivi méticuleux garantit la fourniture de résultats constants de haute qualité.

Analyse bioinformatique complète: notre pipeline va au-delà de l'identification des variations du génome de référence, car il intègre des analyses avancées conçues pour répondre spécifiquement aux questions de recherche liées aux aspects génétiques des maladies ou à l'analyse des tumeurs.

Assistance après-vente :Notre engagement s'étend au-delà de l'achèvement du projet avec une période de service après-vente de 3 mois. Pendant cette période, nous proposons un suivi de projet, une assistance au dépannage et des séances de questions-réponses pour répondre à toute question liée aux résultats.

Exemples de spécifications

Stratégie de capture d'exons

Stratégie de séquençage

Sortie de données recommandée

Bien sûr, sélectionnez Human All Exon v6 (Agilent)

ou Panel d'hybridation xGen Exome v2 (IDT)

 

Illumina NovaSeq PE150

5 à 10 Go

Pour les troubles mendéliens/maladies rares : > 50x

Pour les échantillons de tumeurs : ≥ 100x

Exemples d'exigences

Type d'échantillon

 

 Montant(Qubit®)

 

Concentration 

Volume

 

 

 Pureté (NanoDrop™)

 

ADN génomique

 

≥ 50ng
≥ 6 ng/μL
≥ 15 µL
 
OD260/280=1,8-2,0
 
aucune dégradation, aucune contamination

 

Bioinformatique

Flux de travail WES_BI_Disease-01

L'analyse bioinformatique des échantillons de maladie hWES comprend :

● CQ des données de séquençage

● Alignement du génome de référence

● Identification des SNP et des InDels

● Annotation fonctionnelle des SNP et InDels

Flux de travail WES_BI_Tumor-01

L'analyse bioinformatique des échantillons de tumeurs comprend :

● CQ des données de séquençage

● Alignement du génome de référence

● Identification des SNP, InDels et variations somatiques

● Identification des variantes germinales

● Analyse des signatures de mutation

● Identification de gènes d'entraînement basée sur des mutations à gain de fonction

● Annotation des mutations au niveau de la sensibilité aux médicaments

● Analyse d'hétérogénéité – calcul de pureté et de ploïdie

Flux de travail des services

livraison d'échantillon

Livraison d'échantillon

Expérience pilote

Extraction d'ADN

Préparation de la bibliothèque

Construction d'une bibliothèque

Séquençage

Séquençage

Analyse des données

Analyse des données

数据上传-01

Livraison des données

Services après-vente

Services après-vente


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  • Data QC – Statistiques de capture Exome

     

    wps_doc_22

     

    Identification des variantes – InDels

    photo36

    Analyse avancée : identification et distribution des SNP/InDels délétères – Tracé Circos

     

    photo37

    Analyse tumorale : identification et répartition des mutations somatiques – Tracé Circos

     

    photo38

     

    Analyse tumorale : lignées clonales

     

    photo39

     

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