L'étude d'association à l'échelle du génome (GWAS) vise à identifier les variantes génétiques (génotype) associées à des traits spécifiques (phénotype). Les études de GWA étudient les marqueurs génétiques croisés du génome entier d'un grand nombre d'individus et prédisent les associations de génotypes-phénotypes par analyse statistique au niveau de la population. La reprise du génome entier peut potentiellement découvrir toutes les variantes génétiques. Couplage avec des données phénotypiques, le GWAS peut être traité pour identifier les SNP liés au phénotype, les QTL et les gènes candidats, qui soutient fortement la reproduction moderne des animaux / végétaux. Le SLAF est une stratégie de séquençage du génome simplifiée auto-développée, qui découvre les marqueurs distribués à l'échelle du génome, SNP. Ces SNP, en tant que marqueurs génétiques moléculaires, peuvent être traités pour des études d'association avec des traits ciblés. Il s'agit d'une stratégie rentable pour identifier les traits complexes associés aux variations génétiques.
