Gwas

L'étude de l'association à l'échelle du génome (GWAS) vise à identifier les loci associés à des traits ou des phénotypes spécifiques, souvent d'une importance économique ou humaine. Les pipelines BMKCloud GWAS nécessitent une liste de variantes génomiques identifiées et une liste de variations phénotypiques. Après un contrôle qualité des phénotypes et des génotypes, différents modèles statistiques sont appliqués pour effectuer une analyse d'association. Le pipeline comprend également l'analyse de la structure de la population, le déséquilibre de liaison et l'estimation de la parenté.