Des nouvelles passionnantes dans le monde de la génomique !
« Un assemblage du génome au niveau des chromosomes du foreur de la tige jaune (Scirpophaga incertulas) » publié dans Scientific Data est un nouvel ajout à nos études de cas.
En utilisant les données 94X PacBio HiFi et 55X Hi-C, un génome chromosomique de haute qualité du foreur jaune des tiges a été construit. L'analyse génomique comparative avec 17 autres espèces d'insectes a révélé un degré élevé de synténie du génome avec le foreur de la tige du riz, indiquant une différenciation il y a environ 72,65 millions d'années.
L'analyse de l'expansion et de la contraction des familles de gènes a révélé 860 familles de gènes considérablement élargies, particulièrement enrichies en réponses de défense et en voies de stimulation biologique, cruciales pour améliorer l'adaptabilité écologique et la résistance aux insecticides du foreur jaune de la tige.
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Heure de publication : 16 juillet 2024