Génétique évolutive

Les études génétiques évolutionnistes visent à comprendre la trajectoire évolutive des populations en utilisant les informations de polymorphisme dans les séquences génomiques. Le pipeline BMKCloud Evolutionary Genetics est conçu pour analyser les données WGS ou Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF) provenant de grandes populations. Après contrôle qualité des données brutes, les lectures sont alignées sur le génome de référence et les variantes sont appelées. Le pipeline comprend la construction d'arbres phylogénétiques, l'analyse en composantes principales (ACP), l'analyse de la structure de la population, le déséquilibre de liaison (LD), l'analyse par balayage sélectif et l'analyse des gènes candidats.